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Neo-8 Neosuite CNPD 中國(guó)天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(kù)
- 公司名稱 北京創(chuàng)騰科技有限公司
- 品牌 其他品牌
- 型號(hào) Neo-8
- 產(chǎn)地 上海市浦東新區(qū)達(dá)爾文路88號(hào)半島科技園11棟4樓
- 廠商性質(zhì) 代理商
- 更新時(shí)間 2019/11/13 10:21:42
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CNPD 中國(guó)天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(kù)
CNPD™ 產(chǎn)品簡(jiǎn)介
中國(guó)傳統(tǒng)中草藥的應(yīng)用已有幾千年歷史,醫(yī)藥行業(yè)對(duì)天然產(chǎn)物進(jìn)行系統(tǒng)地分離和研究也經(jīng)歷了二百多年的歷程,從中草藥中尋找有 效成份,進(jìn)而發(fā)現(xiàn)有潛力的先導(dǎo)化合物或新藥已成為目前新藥研究與開發(fā)的一個(gè)熱門領(lǐng)域。中國(guó)科學(xué)家早在二十世紀(jì)三十年代就從 研究中國(guó)傳統(tǒng)的中藥及民間行之有效的民間藥入手,利用現(xiàn)代手段對(duì)中草藥開展了化學(xué)、生物學(xué)和藥理學(xué)研究。通過(guò)對(duì)中草藥天然 產(chǎn)物的提取分離,結(jié)構(gòu)鑒定和結(jié)構(gòu)改造,不但創(chuàng)造出來(lái)源于中草藥又優(yōu)于其母體結(jié)構(gòu)的先導(dǎo)化合物和新藥,并且積累了大量具有很 高科學(xué)與應(yīng)用價(jià)值的信息資源。系統(tǒng)地收集、整理和分析這些信息資源,無(wú)疑將對(duì)天然產(chǎn)物、新藥及相關(guān)領(lǐng)域的研究起著重要的作用。
Neosuite CNPD 中國(guó)天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(kù)[Chinese Natural Product Database (CNPD™)] 是創(chuàng)騰科技有限公司和*上海藥物研究所聯(lián)合開發(fā)的綜合性天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(kù)。這一數(shù)據(jù)庫(kù)是在 ISIS 化學(xué)信息管理系統(tǒng)的基礎(chǔ)上建立并完成的。ISIS 化學(xué)信息管理系統(tǒng)是目前通用的管理系統(tǒng),使用方便,兼容性好。
CNPD™ 是面向相關(guān)領(lǐng)域的科學(xué)家建立的易于使用的綜合性天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng),該產(chǎn)品力圖系統(tǒng)的收集、整理、分析從中國(guó)國(guó)產(chǎn) 的植物中分離鑒定出的天然產(chǎn)物的物理性質(zhì)、生物活性及化學(xué)結(jié)構(gòu)等信息,結(jié)合中國(guó)傳統(tǒng)中草藥的應(yīng)用實(shí)踐,利用的計(jì)算機(jī)化學(xué)信息管理手段,為中國(guó)的新藥、天然產(chǎn)物及相關(guān)領(lǐng)域的研究與開發(fā)工作,提供一個(gè)不可多de的好工具。
CNPD™ ——物有所值的天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(kù)
CNPD™ 數(shù)據(jù)庫(kù)包括兩方面內(nèi)容:一是庫(kù)管理系統(tǒng),二是數(shù)據(jù)本身。
CNPD™ 數(shù)據(jù)庫(kù)的一個(gè)重要方面是管理系統(tǒng)。CNPD™ 的數(shù)據(jù)庫(kù)是利用*的化學(xué)信息管理系統(tǒng) ISIS/Base & Draw 進(jìn)行數(shù)據(jù)管 理,可以方便地連接其他應(yīng)用系統(tǒng)如 BIOVIA 所提供的分子模擬和分子設(shè)計(jì)軟件系統(tǒng) Discovery Studio. ISIS/Base & Draw 在 Windows 環(huán)境下運(yùn)行,使用者無(wú)需任何專業(yè)計(jì)算機(jī)知識(shí),不需學(xué)習(xí)任何編程語(yǔ)言,即可利用 ISIS/Base & Draw 對(duì) CNPD™ 數(shù)據(jù)庫(kù)自如地進(jìn)行檢索、瀏覽和維護(hù)。更重要的是,使用者在使用 ISIS/Base & Draw 對(duì) CNPD™ 數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索時(shí),還可以使用到一 種非常有效的新功能結(jié)構(gòu)式搜尋?;瘜W(xué)結(jié)構(gòu)式是化學(xué)家的通用語(yǔ)言,當(dāng)化學(xué)家利用結(jié)構(gòu)式搜尋功能對(duì) CNPD™ 數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索時(shí), 可以非常準(zhǔn)確的得到他們所需的信息。
CNPD™ 數(shù)據(jù)庫(kù)的另一個(gè)重要內(nèi)容便是數(shù)據(jù)本身。CNPD™ 目前共收集了五萬(wàn)七干多個(gè)天然產(chǎn)物,涵蓋天然產(chǎn)物的三十七個(gè)類別. 而且類藥性分析結(jié)果標(biāo)明,CNPD™ 中有 70% 的分子是類藥性分子。
生物堿 | alkaloid | 氨基糖甙 | aminoglycoside |
柬 | glycoside | 肽 | peptide |
黃酮 | flavonoid | 多糖 | polysaccharide |
蒽醌 | anthraquinone | 核首 | nucleoside |
菲醍 | phenanthraquinone | 多烯 | polyene |
萘醌 | naphthoquinone | 二烯 | diene |
苯 酉昆 | benzoquinone | 糖 | saccharide |
苯并味晡 | benzofuran | 聚醯 | polyether |
苯并毗喃 | benzopyran | 脂環(huán) | alicyclics |
木脂素 | lignans | 雜環(huán) | heterocycle |
強(qiáng)心試 | cardiac glycoside | 大環(huán)內(nèi)醋 | macrolide |
糖嫦 | terpene | 單寧 | tannin |
倍半菇 | sesquiterpenoid | 酚 | phenol |
二菇 | diterpenoid | 酸 | acid |
三站 | triterpenoid | 苯甲酸 | benzoic acid |
單菇 | monoterpenoid | 鑿體 | steroid |
香豆素 | coumarin | 蚩體皂忒 | steroidal saponin |
篇(二米乙烯) | Stilbene | 其他 | other |
同時(shí) CNPD™ 還收集了天然產(chǎn)物相關(guān)的各類信息,主要包括:
• 天然產(chǎn)物的二維分子結(jié)構(gòu)及三維分子結(jié)構(gòu)。三維分子結(jié)構(gòu)是利用分子力學(xué)方法優(yōu)化得到的。導(dǎo)出的三維分子結(jié)構(gòu)不僅可以進(jìn)行針對(duì)藥物靶標(biāo)的虛擬篩選,而且可以將三維分子結(jié)構(gòu)與生物活性資料相結(jié)合,來(lái)探索分子結(jié)構(gòu)和活性間的相互關(guān)系。
• 天然產(chǎn)物的名稱、分子式、分子量、熔點(diǎn)、旋光度等重要理化性質(zhì)。
• 天然產(chǎn)物的 CAS 登錄號(hào)。CAS 登錄號(hào)可以作為與其它化學(xué)信息資源關(guān)聯(lián)的便捷接口。
• 一些天然產(chǎn)物的生物活性信息及其參考文獻(xiàn)。包括文獻(xiàn)來(lái)源、作者、年代等詳細(xì)信息。
• 天然產(chǎn)物的自然來(lái)源及其參考文獻(xiàn)。包括文獻(xiàn)來(lái)源、作者、年代等詳細(xì)信息。
• 原植物或其同屬中藥在中國(guó)傳統(tǒng)醫(yī)藥中的應(yīng)用。包括中文名,拉丁文名,性味,歸經(jīng)及功用主治等。
CNPD™ 的應(yīng)用
Neosuite CNPD 中國(guó)天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(kù)可以為從事藥物化學(xué)、植物化學(xué)、有機(jī)化學(xué)、醫(yī)藥、農(nóng)藥及生物化學(xué)等領(lǐng)域的研究人員提供有益的幫助,例如:
• 幫助研究人員系統(tǒng)的了解天然產(chǎn)物分離、提取和鑒定的研究方法。
• 對(duì)天然產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)及生物活性信息進(jìn)行定量或定性的分析研究,深入了解某類藥物的結(jié)構(gòu)與活性之間的關(guān)系,為新藥研究提供系統(tǒng)的和有價(jià)值的信息。
• 通過(guò)虛擬篩選方法篩選天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(kù) CNPD™ 也是獲得先導(dǎo)化合物或活性化合物的一條有效途徑。
• 由于天然產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)具有非常好的差異性,因此天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(kù)中的許多化合物可以作為組合化學(xué)庫(kù)設(shè)計(jì)的起始結(jié)構(gòu)。
• CNPD™ *將天然產(chǎn)物、生物活性數(shù)據(jù)、原植物來(lái)源及中藥傳統(tǒng)應(yīng)用融合在一起,并且提供三維結(jié)構(gòu)信息,所以它可以幫助科研人員充分了解中國(guó)天然產(chǎn)物資源。
因此,在中國(guó)的新藥、天然產(chǎn)物及相關(guān)領(lǐng)域的研究與開發(fā)工作中,CNPD™ 是一個(gè)不可多de的好工具。
升級(jí) / 補(bǔ)充
中國(guó)科學(xué)家在對(duì)天然產(chǎn)物及中草藥的研究中積累了大量的信息資源。CNPD™ 將通過(guò)版本升級(jí)來(lái)充實(shí)和完善數(shù)據(jù)庫(kù),包括新條目的 補(bǔ)充以及條目?jī)?nèi)容的增加、更新等。版的 CNPD™ 中還增加用于虛擬篩選的三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù),為用戶在使用其他的分子模擬和 設(shè)計(jì)軟件系統(tǒng)方面提供更多的方便。
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