PBDB-T-F, PM6、CAS號：1802013-83-7

PBDB-T-F, PM6、CAS號：1802013-83-7

中文名稱：PM6

中文同義詞：

9'-(2,12-DI-TERT-BUTYL-5,9-DIOXA-13B-BORANAPHTHO[3,2,1-DE]ANTHRACEN-7-YL)-9,9''CHEMICALBOOK-DIPHENYL;P9203;聚[(2,6-(4,Chemicalbook8-雙(5-(2-乙基己基-3-氟)噻吩-2-基)-苯并[1,2-B:4,5-B']二噻吩])-ALT-(5,5-(1',3'-二-2-噻吩-5',7'-雙(2-乙基己基)苯并[1',2'-C:4',5'-C']二噻吩-4,8-二酮)

英文名稱：PM6

英文同義詞：

9'-(2,12-di-tert-butyl-5,9-dioxa-13b-boranaphtho[3,2,1-de]anthracen-7-yl)-9,9''-diphenyl-9H,9'H,9''H-3,3':6',3''-tercarbazole;PM6(PBDB-T-2F);TB-P3Cz;PBDB-T-F;PBDChemicalbookB-T-F,PM6;9'-(2,12-di-tert-butyl-5,9-dioxa-13b-boranaphtho[3,2,1-de]anthracen-7-yl)-9,9''Chemicalbook-diphenyl-9H,9'H,9''H-3,3':6',3''-tercarbazole;PCE14;P141-2F

CAS號：1802013-83-7

分子式：(C68H76F2O2S8)n

PBDB-T-F, PM6、CAS號：1802013-83-7

結(jié)構(gòu)式；

描述：

背景分子對接方法通常用于預(yù)測配體與蛋白質(zhì)的結(jié)合模式和能量。對于的復(fù)雜幾何形狀和結(jié)合能估計，計算部分電荷的適當(dāng)方法關(guān)重要。AutoDockTools軟件是為廣泛使用的對接程序AutoDock 4之一準備輸入文件的界面，它利用Gasteiger部分電荷計算方法計算蛋白質(zhì)和配體電荷。然而，已經(jīng)表明，使用量子化學(xué)方法可以實現(xiàn)更的部分電荷計算，從而實現(xiàn)更的對接。對于對接計算，量子化學(xué)部分電荷計算作為常規(guī)，目前僅用于配體。MOPAC2009新開發(fā)的Mozyme函數(shù)允許通過量子力學(xué)半經(jīng)驗方法快速計算蛋白質(zhì)的部分電荷。因此，在目前的研究中，可以研究半經(jīng)驗量子力學(xué)部分電荷計算對對接精度的影響。結(jié)果使用Gasteiger和PM6部分電荷計算方法，在一組53個蛋白質(zhì)-配體復(fù)合物上研究了使用原始AutoDock評分函數(shù)的AutoDock 4對接精度。這使我們能夠利用AutoDock 4軟件比較部分電荷計算方法對對接精度的影響。結(jié)果表明，當(dāng)使用半經(jīng)驗PM6方法計算配體和蛋白質(zhì)的部分電荷時，關(guān)于復(fù)雜幾何形狀的對接精度（當(dāng)一階對接結(jié)果復(fù)合體的RMSD在實驗確定的X射線結(jié)構(gòu)的2°范圍內(nèi)時，對接結(jié)果定義為準確）顯著提高。研究過程中分析的53個絡(luò)合物中，使用PM6部分電荷計算了42個絡(luò)合物的幾何形狀，而使用Gasteiger電荷僅得到28個的幾何形狀。結(jié)合親和力估計不受部分電荷計算方法的影響-為了更準確地預(yù)測結(jié)合親和力，需要為AutoDock開發(fā)新的評分函數(shù)。結(jié)論的結(jié)果表明，在配體和蛋白質(zhì)上使用量子化學(xué)部分電荷計算，使用AutoDock 4進行對接計算的復(fù)雜幾何體的確定精度大大提高。

純度：95%

用途：僅用于科研

以上資料來自昊然小編 pk2022.07.19

溫馨提示：僅用于科研，不能用于人體實驗！

公司介紹：

西安昊然生物目前經(jīng)營的產(chǎn)品主要有合成磷脂，PEG衍生物，嵌段共聚物，納米金，磁性納米顆粒，介孔二氧化硅，

活性熒光染料，熒光量子點，點擊化學(xué)和大環(huán)配體等等。