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Ribo-seq技術(shù)服務(wù)

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上海藍(lán)夢生物醫(yī)藥科技有限公司2020年9月成立,是一家專業(yè)從事生命科學(xué)產(chǎn)品開發(fā)的科技公司。 目前,本公司自主研發(fā)產(chǎn)品為功能性磁性材料,主要應(yīng)用于基因檢測相關(guān)領(lǐng)域,包括臨床檢測、農(nóng)業(yè)育種 、科學(xué)研究、食品安全等??蔀閺V大客戶提供我司自主品牌和代理品牌的多種產(chǎn)品,包括核酸提取純化試劑,核酸和蛋白定量檢測試劑,無細(xì)胞蛋白表達(dá)系統(tǒng),NGS建庫試劑,LabChip GX Touch自動化電泳儀(核酸分析),芯片,mich磁力架,磁珠,自動化液體工作站,自動化建庫工作站,自動化核酸提取儀 等等。

核酸提取純化試劑,核酸和蛋白定量檢測試劑,無細(xì)胞蛋白表達(dá)系統(tǒng),NGS建庫試劑,LabChip GX Touch自動化電泳儀(核酸分析),芯片,mich磁力架,磁珠,自動化液體工作站,自動化建庫工作站,自動化核酸提取儀 等等

Ribo-seq技術(shù)服務(wù)


技術(shù)原理

蛋白質(zhì)是生命活動的主要承擔(dān)者,翻譯調(diào)控又是細(xì)胞內(nèi)最重要的調(diào)控方式。翻譯是核糖體讀取mRNA模板來指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成的過程,是基因表達(dá)的關(guān)鍵步驟。翻譯的過程受到嚴(yán)格的調(diào)控,很多疾病與翻譯異常相關(guān),比如神經(jīng)退行性疾病、貧血癥和發(fā)育障礙等。雖然核糖體的結(jié)構(gòu)與功能研究的比較透徹,但是對于翻譯過程的調(diào)控機(jī)理還需要深入研究。

核糖體印跡測序(Ribosome profiling, Ribo-seq),能夠詳細(xì)檢測體內(nèi)的翻譯狀態(tài)。Ribo-seq的技術(shù)核心是識別與核糖體結(jié)合的mRNA以及正在被翻譯的約30個核苷酸。對核糖體結(jié)合的mRNA片段進(jìn)行測序,能夠精確記錄核糖體在翻譯過程中的位置。將轉(zhuǎn)錄組與Ribo-seq數(shù)據(jù)聯(lián)合分析,可以計算出蛋白質(zhì)的合成速率。

Ribo-seq技術(shù)服務(wù)


技術(shù)特點

Ribo-seq能夠揭示蛋白合成的時間、地點、位置、哪些蛋白質(zhì)正在被合成以及蛋白質(zhì)合成的調(diào)控機(jī)制。Ribo-seq搭建了從轉(zhuǎn)錄組學(xué)到蛋白質(zhì)組學(xué)之間的橋梁,已經(jīng)廣泛應(yīng)用在動物、植物和微生物的研究中,用于揭示生長發(fā)育、形態(tài)建成、疾病發(fā)生、逆境脅迫響應(yīng)的調(diào)控機(jī)制。


應(yīng)用方向

Ribo-seq應(yīng)用于研究轉(zhuǎn)錄本的翻譯活性、鑒定翻譯起始位點、ORF位置和蛋白質(zhì)的翻譯調(diào)控機(jī)制。

Ribo-seq技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用在動物、植物和微生物的研究中,用于揭示生長發(fā)育、形態(tài)建成、疾病發(fā)生、逆境脅迫響應(yīng)的調(diào)控機(jī)制。總之,Ribo-seq能從基因組水平檢測蛋白質(zhì)的翻譯狀況,獲得正在翻譯的mRNA序列信息并解析翻譯調(diào)控機(jī)制。


我們的服務(wù)優(yōu)勢

實驗周期快、質(zhì)量高、結(jié)果穩(wěn)定可靠;

豐富的物種經(jīng)驗。


送樣要求

(1)細(xì)胞樣本:建議送樣量5×106~1×107個;

(2)動物組織樣本:建議送樣量≥300 mg;

(3)植物組織樣本:建議送樣量≥500 mg。


樣本分組

至少2組樣品,包括對照組和實驗組,樣本數(shù)建議:3 VS 3。



生信分析內(nèi)容

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實驗案例

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參考文獻(xiàn)

Brar GA, Weissman JS. Ribosome profiling reveals the what, when, where and how of protein synthesis. Nat Rev Mol Cell Biol. 2015. 16(11):651-664.

Chong C, Coukos G, Bassani-Sternberg M. Identification of tumor antigens with immunopeptidomics. Nat Biotechnol. 2022. 40(2):175-188.

Fremin BJ, Nicolaou C, Bhatt AS. Simultaneous ribosome profiling of hundreds of microbes from the human microbiome. Nat Protoc. 2021. 16(10):4676-4691.

Ingolia NT, Brar GA, Rouskin S, McGeachy AM, Weissman JS. The ribosome profiling strategy for monitoring translation in vivo by deep sequencing of ribosome-protected mRNA fragments. Nat Protoc. 2012. 7(8):1534-1550.

Ingolia NT, Ghaemmaghami S, Newman JR, Weissman JS. Genome-wide analysis in vivo of translation with nucleotide resolution using ribosome profiling. Science. 2009. 324(5924):218-223.

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Xu G, Greene GH, Yoo H, Liu L, Marqués J, Motley J, Dong X. Global translational reprogramming is a fundamental layer of immune regulation in plants. Nature. 2017. 545(7655):487-490.


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體內(nèi)RNA親和純化(RAP)技術(shù)服務(wù)

RNA Pull Down技術(shù)服務(wù)

RNA凝膠遷移或電泳遷移率實驗(RNA-EMSA)

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Co-IP/Co-IP-MS技術(shù)服務(wù)

GST/halo-Pull down技術(shù)服務(wù)

蛋白亞細(xì)胞定位技術(shù)服務(wù)

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