Ribo-seq技術(shù)服務(wù)
- 公司名稱 上海藍(lán)夢生物醫(yī)藥科技有限公司
- 品牌 其他品牌
- 型號
- 產(chǎn)地
- 廠商性質(zhì) 代理商
- 更新時間 2024/6/26 16:27:33
- 訪問次數(shù) 109
聯(lián)系我們時請說明是化工儀器網(wǎng)上看到的信息,謝謝!
核酸提取純化試劑,核酸和蛋白定量檢測試劑,無細(xì)胞蛋白表達(dá)系統(tǒng),NGS建庫試劑,LabChip GX Touch自動化電泳儀(核酸分析),芯片,mich磁力架,磁珠,自動化液體工作站,自動化建庫工作站,自動化核酸提取儀 等等
Ribo-seq技術(shù)服務(wù)
技術(shù)原理
蛋白質(zhì)是生命活動的主要承擔(dān)者,翻譯調(diào)控又是細(xì)胞內(nèi)最重要的調(diào)控方式。翻譯是核糖體讀取mRNA模板來指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成的過程,是基因表達(dá)的關(guān)鍵步驟。翻譯的過程受到嚴(yán)格的調(diào)控,很多疾病與翻譯異常相關(guān),比如神經(jīng)退行性疾病、貧血癥和發(fā)育障礙等。雖然核糖體的結(jié)構(gòu)與功能研究的比較透徹,但是對于翻譯過程的調(diào)控機(jī)理還需要深入研究。
核糖體印跡測序(Ribosome profiling, Ribo-seq),能夠詳細(xì)檢測體內(nèi)的翻譯狀態(tài)。Ribo-seq的技術(shù)核心是識別與核糖體結(jié)合的mRNA以及正在被翻譯的約30個核苷酸。對核糖體結(jié)合的mRNA片段進(jìn)行測序,能夠精確記錄核糖體在翻譯過程中的位置。將轉(zhuǎn)錄組與Ribo-seq數(shù)據(jù)聯(lián)合分析,可以計算出蛋白質(zhì)的合成速率。
技術(shù)特點
Ribo-seq能夠揭示蛋白合成的時間、地點、位置、哪些蛋白質(zhì)正在被合成以及蛋白質(zhì)合成的調(diào)控機(jī)制。Ribo-seq搭建了從轉(zhuǎn)錄組學(xué)到蛋白質(zhì)組學(xué)之間的橋梁,已經(jīng)廣泛應(yīng)用在動物、植物和微生物的研究中,用于揭示生長發(fā)育、形態(tài)建成、疾病發(fā)生、逆境脅迫響應(yīng)的調(diào)控機(jī)制。
應(yīng)用方向
Ribo-seq應(yīng)用于研究轉(zhuǎn)錄本的翻譯活性、鑒定翻譯起始位點、ORF位置和蛋白質(zhì)的翻譯調(diào)控機(jī)制。
Ribo-seq技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用在動物、植物和微生物的研究中,用于揭示生長發(fā)育、形態(tài)建成、疾病發(fā)生、逆境脅迫響應(yīng)的調(diào)控機(jī)制。總之,Ribo-seq能從基因組水平檢測蛋白質(zhì)的翻譯狀況,獲得正在翻譯的mRNA序列信息并解析翻譯調(diào)控機(jī)制。
我們的服務(wù)優(yōu)勢
實驗周期快、質(zhì)量高、結(jié)果穩(wěn)定可靠;
豐富的物種經(jīng)驗。
送樣要求
(1)細(xì)胞樣本:建議送樣量5×106~1×107個;
(2)動物組織樣本:建議送樣量≥300 mg;
(3)植物組織樣本:建議送樣量≥500 mg。
樣本分組
至少2組樣品,包括對照組和實驗組,樣本數(shù)建議:3 VS 3。
生信分析內(nèi)容
實驗案例
參考文獻(xiàn)
Brar GA, Weissman JS. Ribosome profiling reveals the what, when, where and how of protein synthesis. Nat Rev Mol Cell Biol. 2015. 16(11):651-664.
Chong C, Coukos G, Bassani-Sternberg M. Identification of tumor antigens with immunopeptidomics. Nat Biotechnol. 2022. 40(2):175-188.
Fremin BJ, Nicolaou C, Bhatt AS. Simultaneous ribosome profiling of hundreds of microbes from the human microbiome. Nat Protoc. 2021. 16(10):4676-4691.
Ingolia NT, Brar GA, Rouskin S, McGeachy AM, Weissman JS. The ribosome profiling strategy for monitoring translation in vivo by deep sequencing of ribosome-protected mRNA fragments. Nat Protoc. 2012. 7(8):1534-1550.
Ingolia NT, Ghaemmaghami S, Newman JR, Weissman JS. Genome-wide analysis in vivo of translation with nucleotide resolution using ribosome profiling. Science. 2009. 324(5924):218-223.
Juntawong P, Girke T, Bazin J, Bailey-Serres J. Translational dynamics revealed by genome-wide profiling of ribosome footprints in Arabidopsis. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014. 111(1):E203-212.
Sawyer EB, Cortes T. Ribosome profiling enhances understanding of mycobacterial translation. Front Microbiol. 2022. 13:976550.
Xiang Y, Huang W, Tan L, Chen T, He Y, Irving PS, Weeks KM, Zhang QC, Dong X. Pervasive downstream RNA hairpins dynamically dictate start-codon selection. Nature. 2023. 621(7978):423-430.
Xu G, Greene GH, Yoo H, Liu L, Marqués J, Motley J, Dong X. Global translational reprogramming is a fundamental layer of immune regulation in plants. Nature. 2017. 545(7655):487-490.
【Ribo-seq技術(shù)服務(wù)】更多服務(wù)內(nèi)容 +186+2134+2861
DAP-seq技術(shù)服務(wù)
CUT&Tag技術(shù)服務(wù)
染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP-seq)技術(shù)服務(wù)
轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)技術(shù)服務(wù)
EMSA技術(shù)服務(wù)
DNA Pull Down技術(shù)服務(wù)
染色質(zhì)轉(zhuǎn)座酶可及性測序(ATAC-seq)
雙熒光素酶報告實驗(Dual-LUC)
GUS染色實驗服務(wù)
酵母單雜交(Y1H)技術(shù)服務(wù)
酵母雙雜交(Y2H)技術(shù)服務(wù)
雙分子熒光互補(BiFC)技術(shù)服務(wù)
熒光素酶互補實驗(LCA)技術(shù)服務(wù)
體外RNA親和純化測序技術(shù)服務(wù)
RNA免疫共沉淀測序(RIP-seq)技術(shù)服務(wù)
體內(nèi)RNA親和純化(RAP)技術(shù)服務(wù)
RNA Pull Down技術(shù)服務(wù)
RNA凝膠遷移或電泳遷移率實驗(RNA-EMSA)
重組蛋白表達(dá)技術(shù)服務(wù)(大腸桿菌、酵母、哺乳動物細(xì)胞、昆蟲細(xì)胞、無細(xì)胞表達(dá)體系)
Co-IP/Co-IP-MS技術(shù)服務(wù)
GST/halo-Pull down技術(shù)服務(wù)
蛋白亞細(xì)胞定位技術(shù)服務(wù)
蛋白磷酸化檢測技術(shù)服務(wù)