毛細(xì)管柱的選擇一般建議從以下幾方面考慮：

一、毛細(xì)管柱柱長(zhǎng)度的選擇：

　　一般情況，15m柱用于快速篩選簡(jiǎn)單混合物或分子量高的化合物。30m柱是普遍的柱長(zhǎng)。超長(zhǎng)柱(50、60或100、150m)用于非常復(fù)雜的樣品。分辨率與柱長(zhǎng)的平方根成正比。在其他條件不變的情況下 , 為取得加倍的分辨率需有 4 倍的柱長(zhǎng)。較短的柱子適于較簡(jiǎn)單的樣品 ,尤其是由那些在結(jié)構(gòu)、極性和揮發(fā)性上相差較大的組分組成的樣品。

二、毛細(xì)管柱柱內(nèi)徑的選擇：

　　柱徑直接影響柱子的效率、保留特性和樣品容量。小口徑柱比大口徑柱有更高柱效，但柱容量更小。

　　0.25mm ：具有較高的柱效，柱容量較低。分離復(fù)雜樣品較好。

　　0.32mm ：柱效稍低于 0.25mm 的色譜柱，但柱容量約高 60% 。

　　0.53mm：具有類似于填充柱的柱容量，可用于分流進(jìn)樣，也可用于不分流進(jìn)樣，當(dāng)柱容量是主要考慮因素時(shí)(如痕量分析)，選擇大口徑毛細(xì)管柱較為合適。

三、毛細(xì)管柱液膜厚度的選擇 ：

　　液膜厚度影響柱子的保留特性和柱容量。厚度增加，保留也增加。

　　一般而言，色譜柱的膜厚為0.25到0.5um。對(duì)于流出達(dá)300℃的大多數(shù)樣品(包括蠟、甘油三酯、甾族化合物等)能夠很好的分析。對(duì)于更高的洗脫溫度，可以用0.1um的液膜。而厚液膜對(duì)于低沸點(diǎn)化合物有利，對(duì)于流出溫度在100℃～200℃之間的物質(zhì)，用1～1.5um的液膜效果較好。超厚膜(3～5um)用于分析氣體、溶劑和可吹掃出來(lái)的物質(zhì)，以增加樣品組分與固定相的相互作用。另一個(gè)選擇厚膜的原因是當(dāng)用大口徑柱時(shí)保持分離度和保留時(shí)間。由于這個(gè)原因，大口徑柱都是有厚膜。厚膜的流失較大，溫度極限必須隨膜厚度增加而下降。