菁染料是近紅外熒光染料中的一類熒光染料，統(tǒng)的可見光染料相比有的。由于和組織的自發(fā)熒光在近紅外波段小，因此在檢測復(fù)雜生物時，近紅外染料能提供的特異性和靈敏度。同時，由于光波在近紅外區(qū)段的組織透過性好。菁染料的摩爾吸光系數(shù)在熒光染料中是的，Cy5 hydrazide, Cy5.5 alkyne 和Cy7 NHS ester 的吸收在近紅外區(qū)背景低，是熒光度、穩(wěn)定的長波長染料。特別適合于活體小體內(nèi)成像代替放射性元素。

目前市面上的菁染料比較，主要是因為菁染料, 尤其是不對稱菁染料的副反應(yīng)多, 副產(chǎn)物性相近, 產(chǎn)物的分離提純相當(dāng)困難。菁染料特別是水溶性菁染料分子性大, 分離提純加困難。因此像Sulfo Cy5 Carboxylic acid就比脂溶性的Cyanine7 amine這類產(chǎn)品貴一些。水溶性的Sulfo-Cyanine3 NHS ester就比脂溶性Cyanine5 azide貴一些。

Cyanine菁染料是近紅外熒光染料中的一類熒光染料，和組織的自發(fā)熒光在近紅外波段小，能提供的特異性和靈敏度，菁染料是二個非區(qū)域電荷的氮原子通過聚合搭橋的方式形成的一種分子，以下圖片詮釋：

由于Cy染料的結(jié)構(gòu)式特點，他們往往有著的消選光系數(shù)，數(shù)值達100,000 Lmol-1cm-1

Cy系列的熒光染料我們一般分為磺酸化菁染料和非磺酸化菁染料non-sulfonated cyanines, and sulfonated cyanines.他們的光譜性質(zhì)基本相同，和蛋白 小分子修飾反應(yīng)也幾乎是一樣的，*不同的在于他們的溶解性，非磺酸化菁染料是脂溶性的，磺酸化菁染料是水溶性的，結(jié)構(gòu)式上也會有些不同。

Non-sulfonated cyanines非磺酸化菁染料包括以下：

Cy3.5 alkyne、Cy3 azide、Cy3 carboxylic acid、Cy3 NHS ester、Cy5 amine、Cy5 maleimide

Cyanine3 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester

Cyanine3.5 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester

Cyanine5 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester amine

Cyanine5.5 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester amine

Cyanine7 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester amine

Cyanine7.5 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester amine

大多數(shù)非磺酸化菁染料都在有機相里去跟蛋白、多肽、抗體及小分子材料進行下一步的反應(yīng)。

Sulfonated cyanine磺酸化菁染料包括以下：

Sulfo-Cy 5 NHS ester, Sulfo-Cy3 maleimide, Sulfo-Cy7 azide, Sulfo-Cy5 carboxylic acid

Sulfo Cyanine3 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester

Sulfo Cyanine3.5 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester

Sulfo Cyanine5 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester amine

Sulfo Cyanine5.5 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester amine

Sulfo Cyanine7 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester amine

Sulfo Cyanine7.5 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester amine

雖然非磺酸化菁染料和磺酸化菁染料有著相同的熒光特性，但是在具體使用上還是有一些差異性的，非磺酸化菁染料溶解在有機溶劑中如DMF或DMSO中使用，并加入緩沖水溶液buffers來使用，磺酸化菁染料溶解在水中，整個使用過程在水相中進行。

Most derivatives of non-sulfonated cyanines (except for hydrochlorides of hydrazides and amines) have low aqueous solubility. When these molecules are used for biomolecule labeling, use of organic co-solvent (5-20% of DMF or DMSO) is necessary for efficient reaction. Cyanine dye should be dissolved in organic solvent first, and added to a solution of biomolecule (protein, peptide, amino-labeled DNA) in appropriate aqueous buffer. When conjugation takes place efficiently, the dye reacts before it precipitates.

Fluorescent properties of non-sulfonated cyanines have little dependence on solvent and surrounding. Absorbance and fluorescence spectra of non-sulfonated cyanine dyes are plotted below.

磺酸化菁染料和非磺酸化菁熒光染料可以用于標(biāo)記不同的目標(biāo)分子：

• 可在有機溶劑中溶解的蛋白質(zhì)

• 抗體 (use 5-10% of DMSO/DMF)

• DNA和寡核苷酸

• 多肽

• 其他小分子，包括用小分子及

磺酸化菁熒光染料可用于：

• 在DMF或DMSO中變性的蛋白
• 被透析及純化的蛋白
• 水溶性的納米粒子
• 不溶或疏水的蛋白

非磺酸化菁熒光染料可用于：

• 在有機介質(zhì)反應(yīng)（二氯甲烷、乙腈）

西安瑞禧生物科技有限公司經(jīng)營的磺酸化菁染料和非磺酸化菁熒光染料達95%以上，并可以因為質(zhì)量。

非磺酸化菁熒光染料產(chǎn)品列表：

Cy3 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester

Cy3.5 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester

Cy5 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester amine

Cy5.5 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester amine

Cy7 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester amine

Cy7.5 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester amine

磺酸化菁熒光染料產(chǎn)品列表：

Sulfo Cy3 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester

Sulfo Cy3.5 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester

Sulfo Cy5 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester amine

Sulfo Cy5.5 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester amine

Sulfo Cy7 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester amine

Sulfo Cy7.5 alkyne azide carboxylic acid hydrazide maleimide NHS ester amine

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