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MaxUpII DNA Library Prep Kit for Illumina

2019-5-30  閱讀(594)

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MaxUpII DNA Library Prep Kit for Illumina®

——建庫(kù)試劑盒中的王


1、產(chǎn)品概述
Hieff NGS® MaxUpII DNA Library Prep Kit for Illumina®,可用于NGS測(cè)序中DNA樣本文庫(kù)構(gòu)建,采用高質(zhì)量的酶學(xué)組成,改進(jìn)型接頭連接技術(shù),以及具有強(qiáng)擴(kuò)增效率的高保真酶,顯著提高文庫(kù)轉(zhuǎn)化率與擴(kuò)增效率,Input DNA范圍為500 pg-1 μg,適用包含cfDNA、FFPE在內(nèi)的所有樣本進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建,產(chǎn)品可以應(yīng)用于全基因組測(cè)序、靶向捕獲測(cè)序、Chip-seq等測(cè)序方法中。

2、產(chǎn)品特點(diǎn)
適用樣本類型廣:包含cfDNA、FFPE在內(nèi)的所有樣本均能獲得優(yōu)異文庫(kù)和測(cè)序質(zhì)量
應(yīng)用范圍廣:產(chǎn)品可應(yīng)用于全基因組測(cè)序、靶向捕獲測(cè)序、Chip-seq等等
高品質(zhì)酶學(xué)組成:業(yè)界領(lǐng)現(xiàn)的接頭連接效率,高達(dá)60%、超高保真性和*擴(kuò)增效率
品質(zhì)穩(wěn)定:嚴(yán)格的批次性能與穩(wěn)定性質(zhì)控

3、操作流程
精簡(jiǎn)的操作步驟,2-2.5小時(shí)快速建庫(kù)


4、產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
1)文庫(kù)轉(zhuǎn)化效率高達(dá)60%

圖1  Agilent  2100 檢測(cè)350bp平末端DNA//片段單端和雙端連接產(chǎn)物峰

0:350bpDNA//片段峰、1:?jiǎn)味私宇^連接產(chǎn)物峰、2:雙端接頭連接產(chǎn)物峰。測(cè)試基于各公司的標(biāo)準(zhǔn) protocol進(jìn)行。

圖2 接頭連接效率百分比(%)。

對(duì)圖1峰面積進(jìn)行積分后的定量結(jié)果顯示Hieff NGS™ MaxUp II Kit 的雙端連接效率可達(dá)60%


2)擴(kuò)增效率高,兼容不同GC含量樣本
使用具有強(qiáng)擴(kuò)增效率的Super CanaceTM High-Fidelity Mix用于文庫(kù)擴(kuò)增,效率更高。

產(chǎn)品名稱GC 38% (ng)GC 50% (ng)GC 70% (ng)
Super Canace® High-Fidelity Mix25.61817.1
K*-HiFi mix15.816.721.1

1 ng GC含量分別為38%、50%、70%的400 bp DNA//片段為起始樣本,12 cycles擴(kuò)增。

3)文庫(kù)產(chǎn)量高

樣本100 ng FFPE5 ng cfDNA
7 cycles (ng)10 cycles (ng)9 cycles (ng)12 cycles (ng)
MaxUP II40020001201200
K* 品牌15011001001080

以FFPE和cfDNA為起始樣本建庫(kù),相對(duì)同類型試劑盒品牌 K*,在相同擴(kuò)增循環(huán)數(shù)下,獲得更多文庫(kù)產(chǎn)量。

4)數(shù)據(jù)無偏好性
在不同GC含量樣本中,使用Hieff NGS™ MaxUP II Kit均能獲得堿基質(zhì)量好且覆蓋度均一的測(cè)序數(shù)據(jù)。

樣本Mapped Reads (%)Coverage (%)
Average10×15×20×
蠟狀芽孢桿菌(GC 34%)93.899.64499.64399.64199.63999.638
大腸桿菌(GC 51%)92.793.05792.78292.68792.62592.579
嗜鹽桿菌(GC 65%)94.299.59899.02898.39197.88597.419

                                               

圖3不同GC含量樣本測(cè)序偏好性圖譜


5、客戶反饋

5.1建庫(kù)產(chǎn)量高
1)杭州某生物公司邁*
洗相同條件下對(duì)比實(shí)驗(yàn),脫體積32 μL,對(duì)比文庫(kù)產(chǎn)量,翊圣MaxUpII文庫(kù)產(chǎn)量比K*文庫(kù)產(chǎn)量更高

MaxUp IIK* Hyper
Input DNA50 ng25 ng10 ng50 ng25 ng10 ng
循環(huán)數(shù) (cycles)79137913
文庫(kù)濃度 (ng/µL)15.423.858.28.7613.552.4





圖4 對(duì)比文庫(kù)質(zhì)量峰圖,翊圣MaxUpII文庫(kù)主峰單一,大小與目的片段的大小一致,K*品牌建庫(kù)試劑盒出現(xiàn)多峰的現(xiàn)象

2)北京某基因技術(shù)有限公司中*
gDNA樣本(NA12878),平行實(shí)驗(yàn)中,翊圣建庫(kù)試劑盒MaxUpII與K*品牌對(duì)比,文庫(kù)質(zhì)量和產(chǎn)量基本一致,在捕獲建庫(kù)中能兼容不同的捕獲試劑!


5.2文庫(kù)對(duì)應(yīng)測(cè)序更為準(zhǔn)確

1)上海某醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所渥*


圖5 K*品牌與翊圣MaxUpII建庫(kù)試劑盒測(cè)序數(shù)據(jù)對(duì)比柱狀圖


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產(chǎn)品貨號(hào)規(guī)格價(jià)格(元)
Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit for Illumina®12200ES08/24/968/24/96libraries2456/6486/23567


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