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雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)結(jié)果不理想?看這里!

2019-6-21  閱讀(4496)

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雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)結(jié)果不理想?看這里!


熒光素酶(luciferase)是自然界中能夠產(chǎn)生生物熒光的酶的總稱,其中有代表性的是從甲蟲(chóng)中分離得到的螢火蟲(chóng)熒光素酶(Firefly luciferase)和從海腎中分離得到的海腎熒光素酶(Renilla luciferase)。由于兩種酶底物和發(fā)光顏色的區(qū)別,且在動(dòng)物體內(nèi)無(wú)內(nèi)源性表達(dá),使其在雙報(bào)告實(shí)驗(yàn)中得到廣泛應(yīng)用。

1.檢測(cè)原理

螢火蟲(chóng)熒光素酶氧氣、ATP和鎂離子同時(shí)存在的條件下,催化熒光素氧化,生成氧化熒光素,同時(shí)產(chǎn)生黃綠色光,波長(zhǎng)540-600nm,一般檢測(cè)時(shí)選用560nm。

海腎熒光素酶只需要氧氣就可以催化腔腸素氧化產(chǎn)生藍(lán)光,波長(zhǎng)460-540nm,一般檢測(cè)時(shí)選用460nm。

不同于綠色熒光蛋白(GFP)需要一定的光激發(fā)才能發(fā)光,且易淬滅;熒光素酶經(jīng)過(guò)反應(yīng)本身就可以自發(fā)熒光,并且只有在底物存在時(shí)才能發(fā)光。因此GFP只能用于標(biāo)記或檢測(cè)反應(yīng)是否發(fā)生,而熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn)卻能通過(guò)熒光值定量分析熒光素酶的表達(dá)水平。

2.應(yīng)用方向

熒光素酶作為一種理想的報(bào)告基因,可用于啟動(dòng)子研究、miRNA研究、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路研究等等。

在報(bào)告基因的5'端加上待檢測(cè)基因的啟動(dòng)子,就可以用來(lái)檢測(cè)轉(zhuǎn)錄因子對(duì)啟動(dòng)子的作用,啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄越多,那報(bào)告基因的表達(dá)量就越大,熒光值越高。如果在報(bào)告基因的3'端加上目的基因的3'UTR,就能用來(lái)檢測(cè)miRNA對(duì)于目的基因的調(diào)控(抑制作用),報(bào)告基因表達(dá)越少,說(shuō)明miRNA的作用就越強(qiáng)。

一般情況下,海腎熒光素酶基因作為內(nèi)對(duì)照使用,將帶有海腎熒光素酶基因的質(zhì)粒與報(bào)告基因質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染細(xì)胞;或是將兩個(gè)報(bào)告基因構(gòu)建到同一個(gè)質(zhì)粒上分別用不同的啟動(dòng)子啟動(dòng)其表達(dá)。計(jì)算結(jié)果時(shí),將螢火蟲(chóng)熒光素酶的檢測(cè)值比上海腎熒光素酶檢測(cè)值,這樣可以減少內(nèi)在變化因素對(duì)實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)確性的影響,使測(cè)試結(jié)果不受實(shí)驗(yàn)條件變化的干擾。

3.常見(jiàn)問(wèn)題分析

正是由于報(bào)告基因檢測(cè)結(jié)果受多種因素影響,如載體狀態(tài)、細(xì)胞狀態(tài)、轉(zhuǎn)染量、轉(zhuǎn)染效率、裂解效率、加樣精度、檢測(cè)過(guò)程等,一旦某個(gè)細(xì)節(jié)處理不好,都可能導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)失敗或結(jié)果的不準(zhǔn)確。小翊為此精心整理了大家實(shí)驗(yàn)過(guò)程中遇到的幾類常見(jiàn)的問(wèn)題和解決辦法。

1)熒光值過(guò)高

熒光值過(guò)高可能會(huì)超出儀器檢測(cè)范圍,從而檢測(cè)不到值,一般讀數(shù)在5-6位之間較好。熒光值過(guò)高可通過(guò)以下方式嘗試解決:

A.減少質(zhì)粒轉(zhuǎn)染量;

B.細(xì)胞樣品裂解后,離心取上清后檢測(cè)或?qū)α呀猱a(chǎn)物進(jìn)行稀釋后檢測(cè)。

注:不建議通過(guò)減少底物量來(lái)降低熒光值,需要保證底物的飽和來(lái)反映熒光素酶真實(shí)的表達(dá)水平,否則會(huì)造成檢測(cè)結(jié)果出現(xiàn)大的偏差。

2)熒光值過(guò)低或無(wú)熒光值

熒光素酶的表達(dá)水平與啟動(dòng)子活性相關(guān),正常表達(dá)水平下檢測(cè)到的熒光值應(yīng)在105數(shù)量級(jí)左右,若檢測(cè)到的熒光值比較低或無(wú)熒光值,可從啟動(dòng)子活性、轉(zhuǎn)染效率、檢測(cè)過(guò)程這幾方面進(jìn)行考慮:

  • 轉(zhuǎn)染效率低

A.優(yōu)化轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)條件,用較易轉(zhuǎn)染的質(zhì)粒做陽(yáng)性對(duì)照(如轉(zhuǎn)染過(guò)表達(dá)熒光蛋白質(zhì)粒);

B.確保轉(zhuǎn)染DNA的質(zhì)量,可通過(guò)酶切或瓊脂糖凝膠電泳的方法對(duì)DNA質(zhì)量進(jìn)行鑒定;

C.選擇活性較高,處于指數(shù)分裂期的細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)染。

  • 啟動(dòng)子活性低或誘導(dǎo)失敗

A.轉(zhuǎn)染后的細(xì)胞培養(yǎng)使用特異性誘導(dǎo)啟動(dòng)子的條件;

B.優(yōu)化細(xì)胞的培養(yǎng)條件,提高熒光素酶的表達(dá)量;

C.更換強(qiáng)啟動(dòng)子(如SV40、CMV)。

注:海腎熒光素酶基因作為內(nèi)對(duì)照,其表達(dá)應(yīng)不受時(shí)期、部位、環(huán)境影響,因此常用組成型表達(dá)的TK啟動(dòng)子。

  • 樣品裂解效率低

A.細(xì)胞培養(yǎng)時(shí)間不宜過(guò)長(zhǎng),12-36h內(nèi)醉好,長(zhǎng)時(shí)間培養(yǎng)后,細(xì)胞可能會(huì)難裂解;

B.加入的裂解液需足量,保證細(xì)胞能夠充分裂解。

  • 檢測(cè)過(guò)程操作不規(guī)范

A.選擇合適的檢測(cè)儀器,能夠檢測(cè)化學(xué)發(fā)光或者生物發(fā)光的儀器都適用于該實(shí)驗(yàn);

B.需加入足量底物,保證底物的飽和,否則會(huì)造成檢測(cè)結(jié)果出現(xiàn)很大偏差;

C.室溫反應(yīng)。反應(yīng)時(shí)各個(gè)組分(細(xì)胞裂解產(chǎn)物,底物工作液等)都需要調(diào)整到室溫;

D.熒光素酶的半衰期一般約30min,加完底物后可立即檢測(cè),盡量在30min內(nèi)完成。

  • 底物氧化失效

A.底物避光密封保存,螢火蟲(chóng)熒光素酶底物-20℃保存;海腎熒光素酶底物推薦-80℃保存;

B.反應(yīng)工作液建議現(xiàn)用現(xiàn)配。

3)復(fù)孔重復(fù)性差

報(bào)告基因檢測(cè)實(shí)驗(yàn)受多種因素影響,因此同批次樣品檢測(cè)值也可能出現(xiàn)浮動(dòng)。除了引入另一個(gè)報(bào)告基因作為內(nèi)參照避免實(shí)驗(yàn)條件變化的干擾之外,一般還需設(shè)置3個(gè)或3個(gè)以上復(fù)孔。想要得到一個(gè)準(zhǔn)確的結(jié)果,應(yīng)盡可能減小復(fù)孔之間的差異性:

A.細(xì)胞裂解后建議離心取上清,保證樣本的均一性;

B.保證加樣的準(zhǔn)確性,移液器需定期校準(zhǔn),確保移液;

注:熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)的檢測(cè)結(jié)果非常靈敏,復(fù)孔之間的數(shù)值有一定差異是正常的,一般認(rèn)為在同一個(gè)數(shù)量級(jí)的差異是可以接受的。


以上就是大家平常給小翊反饋多的幾個(gè)問(wèn)題,讀完此文大家是否對(duì)這個(gè)實(shí)驗(yàn)有了更深一步的認(rèn)識(shí)?如果您在實(shí)驗(yàn)中還遇到其他問(wèn)題,歡迎留言或電話咨詢。下面是福利時(shí)間!

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