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雙判定標準判定qPCR擴增特異性,提升Ct值真實性

2020-4-9  閱讀(798)

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qPCR實驗易做,但數據分析并非想象中的那么容易!數據分析的好與壞,極大程度上依賴于qPCR原始結果的質量。

qPCR結果的評價指標


•溶解曲線,是qPCR結果判定的第—要素。它的作用是判定目的基因是否得到擴增。理論上,當反應體系中僅是目標基因的擴增,才是有效擴增。
•標準曲線,是qPCR結果判定的金標準。(在溶解曲線判定為特異性擴增后)它的作用是測定引物的擴增效率及試劑的檢測上下限。根據文章發(fā)表對于qPCR數據的要求,擴增效率應在90-110%。
•擴增曲線,是直接生成qPCR定量的數據,即Ct值。從試劑對比角度而言,Ct值大小常被用于判定試劑擴增效率的高低。

產品描述


Hieff Unicon® Power qPCR SYBR Green Master Mix,這是一款旨在解決諸多qPCR實驗常見疑難問題的qPCR試劑:
•它減少了大量引物驗證的預實驗工作,是一款具備強引物兼容性的Mix,
•它明確了qPCR溶解曲線峰型的標準——“單峰的形狀”,對于“什么溶解曲線是好的溶解曲線”的解讀具有參考意義,
•它讓時間不再碎片化,1次體系配制,24 h時間自由支配

產品特點


□引物兼容性強:針對遵循qPCR引物設計原則設計的引物,使用Hieff Unicon® Power 引物使用率可達97%;
□模板加入量靈活:可檢測10-107個拷貝個數的基因片段;
□特異性高:標準溶解曲線峰型,有效避免“胖”峰、“多”峰的出現;
□穩(wěn)定性強:產品經50次反復凍融驗證,擴增性能無變化;
□操作靈活:配制好的qPCR反應液4℃保存24 h,擴增性能無變化;
□擴增時間短:每個擴增循環(huán)中,退火、延伸一步完成,用時15 sec。

產品性能展示


1. 超高特異性,簡化了qPCR實驗的引物設計


圖1. Hieff® Unicon Power預混液實現了引物的高特異性擴增  以293T細胞cDNA為模板,利用Prime5軟件設計200bp擴增長度的片段(GC含量:30%-70%)的引物共1000對,隨機挑選88對,使用Hieff Unicon® Power預混液測定引物的擴增特異性。通過溶解曲線分析,88個檢測片段中有86個(97.7%)目標片段有效擴增,說明Hieff Unicon® Power預混液引物兼容性強,具備高特異性擴增、高檢出率的特點。

2. 超高特異性,保證了Ct值的真實性

圖2. Hieff® Unicon Power預混液擴增高度特異,Ct值結果可信度高  以1 ng人gDNA為模板,使用不同品牌預混液按照標準擴增程序,擴增5個目的基因片段,經瓊脂糖凝膠電泳分析擴增產物情況。結果顯示Hieff Unicon® Power預混液針對不同靶標基因均可以高特異性擴增,得到可信的靶標片段Ct值。

3. 檢測范圍寬廣,模板添加不再糾結
    
圖3. Hieff® Unicon Power預混液可有效檢測6個數量級范圍的模板量  以質粒DNA為模板,10倍梯度稀釋(107-101 拷貝/μl),擴增IL23R基因。結果顯示Hieff Unicon® Power預混液擴增特異,線性相關性高,可在寬廣的定量區(qū)域內獲得良好的線性關系。

4. 良好的穩(wěn)定性,讓體系配制更加靈活:
 

凍融次數0次10次30次50次
Ct均值22.9722.8722.9922.84
△Ct--0.090.02-0.12

 

4℃保存時間0 h24 h48 h72 h
Ct均值22.8322.8923.0523.16
△Ct-0.060.220.33


圖4. Hieff® Unicon Power預混液及其配制體系穩(wěn)定性俱佳  以1 ng 人gDNA為模板,使用Hieff Unicon® Power預混液在不同凍融次數或體系配制后4℃放置不同時間條件下,檢測TFRC基因擴增情況。結果顯示Hieff Unicon® Power預混液經50次反復凍融或體系配制后4℃保存24h,擴增性能無變化(溶解曲線圖數據未做展示)。

5. 兼容快速程序與標準程序:
 

 30%GC-1號30%GC-2號50%GC-1號50%GC-2號70%GC-1號70%GC-2號
標準程序23.422.7923.7923.5223.2323.60
快速程序23.2923.0423.823.5723.4823.52
△Ct0.110.250.010.050.150.08


標準程序                                                快速程序

95℃         5 min                                       95℃         30 sec   
95℃         10 sec                                     95℃         10 sec
60℃         30 sec     40 Cycles                  60℃         15 sec    40 Cycles

圖6. Hieff® Unicon Power預混液讓擴增時間大大縮短 以1 ng人gDNA為模板,擴增不同GC基因片段(30-70%),比較Hieff Unicon® Power預混液在標準程序和快速程序下的擴增效果。結果顯示Hieff Unicon® Power預混液可兼容快速擴增程序和標準擴增程序,使用快速程序可縮短擴增時間。

常見問題


Q:如何選擇產品?
A:

產品名稱貨號特異性擴增效率靈敏度性價比
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix11195ES★★★★★★★★★☆★★★☆☆★★★☆☆
Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix 11198ES★★★★☆★★★★☆★★★★☆★★★★☆
Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix11201ES★★★★☆★★★★★★★★☆☆★★★★★


Q:Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix產品可應用于哪些實驗?
A:可用于對特異性要求比較高或較難實現特異性擴增的基因片段。這款產品極大程度上避免了引物二聚體、非特異性擴增的出現,特別適合于引物中有單個堿基不同的擴增。

Q:建議的模板加入量?
A:20 μL反應體系,未經稀釋的cDNA加入量建議不超過2 μL。

Q:試劑如何儲存及保質期?
A:建議-20℃保存,有效期1年。

訂購信息

產品名稱貨號規(guī)格價格(元)*(元)
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix (抗體法,No Rox)11195ES085ml1653.00663.00
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix (抗體法,Low Rox)11196ES085ml1653.00663.00
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix (抗體法,High Rox)11197ES085ml1653.00663.00


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產品名稱貨號規(guī)格價格(元)*(元)
Hifair® II 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR(gDNA digester plus)11123ES60100T955.00 
Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix (No Rox )11201ES085 ml740.00498.00
Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix (Low Rox Plus)11202ES085 ml740.00498.00
Hieff® qPCR SYBR® Green Master Mix (High Rox Plus)11203ES085 ml740.00498.00

HB190306

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