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Fast T4 DNA Ligase,讓片段連接更高效
——快速高效的DNA連接酶
產(chǎn)品原理
DNA 連接酶是一種能夠催化相鄰DNA 的3’-OH 和5’- 磷酸基末段形成磷酸二酯鍵,并且把兩段DNA 拼接起來的核酸酶。T4 Ligase是目前應(yīng)用比較多的病毒基因組編碼的DNA 連接酶,主要從缺失型嗜菌體中提取,噬菌體T4 的30 基因是該酶的合成基因。T4 DNA連接酶在分子生物學(xué)中有廣泛的應(yīng)用。
產(chǎn)品簡(jiǎn)介
在普通T4 DNA連接酶的基礎(chǔ)上,利用定向改造技術(shù),將T4 DNA ligase的有效催化活性結(jié)構(gòu)域通過多輪突變篩選,得到一種連接活性更強(qiáng)的突變體。采用zui高純度的生產(chǎn)標(biāo)準(zhǔn)和嚴(yán)格的質(zhì)量檢測(cè),有效去除核酸酶、切口酶的殘留,連接時(shí)間只需15min,打造一款快速高效的DNA連接酶。
產(chǎn)品應(yīng)用
產(chǎn)品特點(diǎn)
1. 應(yīng)用更廣泛:可催化粘性末端和平末端形成磷酸二脂鍵
2. 適用于多種樣本:包括FFPE、cfDNA等在內(nèi)的所有樣本均能高效連接
3. 適用于多種類型片段連接:兼容illumina平臺(tái)Y型接頭以及MGI平臺(tái)Bubble接頭
4. 嚴(yán)格質(zhì)控:嚴(yán)格的批次性能與穩(wěn)定性質(zhì)控
原料質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
核酸內(nèi)切酶殘留質(zhì)控:2000 U的本品和0.6 μg Supercoiled pBR322 DNA在74℃下反應(yīng)1小時(shí),DNA電泳譜帶不發(fā)生變化。
核酸外切酶殘留質(zhì)控:2000 U的本品和0.6 μg λ-Hind Ⅲ在74℃下反應(yīng)1小時(shí),DNA的電泳譜帶不發(fā)生變化。
連接效率測(cè)評(píng)
將本產(chǎn)品用于NGS建庫(kù)接頭連接模塊,樣本為模式樣本cfDNA模擬品,加入Y型建庫(kù)接頭,連接之后經(jīng)Agilent 2100檢測(cè),理論上會(huì)出現(xiàn)三個(gè)峰:
①雙端均未連接接頭片段;② 僅一端連接接頭片段;③ 雙端均連接接頭片段
而在二代測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建中,只有雙端都連接接頭的片段才是合格可用的文庫(kù),因而通??梢酝ㄟ^雙端均連接接頭的片段占比反應(yīng)接頭連接效率。即雙端連接接頭片段占比越高,單端連接以及無接頭連接的片段占比越低,連接效率越高。
*峰指認(rèn):①未連接接頭 ②單端連接接頭 ③雙端連接接頭
*樣本制備:使用170 bp多重PCR產(chǎn)物作為cfDNA模擬品,該P(yáng)CR產(chǎn)物經(jīng)過設(shè)計(jì),3’端含有所有堿基的組合(共16種)。
可應(yīng)用于MGI/Illumina平臺(tái)文庫(kù)構(gòu)建中接頭連接
樣本類型:FFPE、cfDNA、腸道微生物
對(duì)比競(jìng)品:N*品牌 T4 DNA Ligase
測(cè)序平臺(tái):illumina® 以及MGI®
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:Fast T4 DNA Ligase在不同樣本類型中的連接效率高于N*
應(yīng)用反饋
將本品應(yīng)用于NGS建庫(kù)試劑盒中(Cat#12199),經(jīng)過不同條件建庫(kù)驗(yàn)證,相比于競(jìng)品K*品牌均能獲得更高的文庫(kù)產(chǎn)出。
【注】樣本來源:Calf thymus Fragment DNA
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翌圣生物成立于2014年,是致力于分子酶創(chuàng)新研發(fā)的國(guó)家高新技shu企業(yè),總部位于上海市浦東新區(qū)醫(yī)學(xué)園區(qū)。公司圍繞“解析分子酶結(jié)構(gòu)與功能,拓展分子酶應(yīng)用場(chǎng)景,解決生命科學(xué)領(lǐng)域與精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域試劑核心問題"為重點(diǎn),開發(fā)分子生物學(xué),高通量測(cè)序,細(xì)胞生物學(xué)及體外診斷相關(guān)的酶原料與試劑。秉承客戶至上,合作分享,誠(chéng)信務(wù)實(shí),創(chuàng)新奉獻(xiàn)的價(jià)值觀,踏實(shí)服務(wù)于生命科學(xué)以及精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域。
HB191216