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Qubit核酸濃度檢測,小翊送你資料匯總
(包含實(shí)驗(yàn)常見問題解析)
背景簡介:
目前,實(shí)驗(yàn)室大多采用分光光度計(jì)來對DNA和RNA進(jìn)行定量。雖然這種方法被廣泛采用,但并不意味著它的讀數(shù)是準(zhǔn)確而可靠的。因?yàn)?/span>紫外吸光度測量不具有選擇性,無法區(qū)分DNA、RNA或蛋白質(zhì),同時(shí)一些游離核苷酸或多余的鹽離子也會影響檢測的數(shù)值。此外,紫外分光光度計(jì)的靈敏度不足,無法完成低濃度DNA和RNA的定量。
基于此,Life Technologies(賽默飛世爾旗下)推出了Qubit,我們一起來探索一下qubit的神奇之處。
Qubit熒光計(jì)
Qubit熒光計(jì)是新一代核酸和蛋白定量儀,是Thermo研發(fā)生產(chǎn)的一種檢測核酸質(zhì)量和數(shù)量,并對RNA、ssDNA、dsDNA、蛋白質(zhì)等進(jìn)行定量的小型儀器,主要用于需要進(jìn)行高靈敏性、高特異性及高度測量的實(shí)驗(yàn)應(yīng)用。 目前主要是以qubit3.0和qubit4.0為主。
儀器原理
采用熒光染料檢測特定目標(biāo)分子的濃度,配套只有與DNA、RNA或蛋白質(zhì)結(jié)合后才發(fā)出熒光的特異性熒光染料。這些熒光染料只有與特異性的靶分子結(jié)合時(shí)才能發(fā)出熒光信號,采用專門的熒光檢測技術(shù),檢測特定目標(biāo)分子的濃度,從而對DNA和RNA進(jìn)行定量。
實(shí)驗(yàn)操作
簡單兩步
1. 配置標(biāo)準(zhǔn)品并測量,儀器自動校正并生成標(biāo)準(zhǔn)曲線;
2. 配置檢測樣本,上機(jī)檢測
圖2. Qubit實(shí)驗(yàn)操作流程圖
特點(diǎn)
Qubit技術(shù)只檢測靶分子(而不是污染物)的濃度,比如:Qubit檢測雙鏈DNA濃度時(shí),特異性檢測待測樣本中的的雙鏈DNA,對于樣本中存在的單鏈DNA或者RNA不檢測。
這種特異性可以獲得十分的結(jié)果,對于芯片分析(Microarray)和實(shí)時(shí)定量PCR(qPCR)而言,測定樣本中的DNA或RNA是必需的。同時(shí)在新一代測序(NGS)實(shí)驗(yàn)中,對我們后續(xù)的建庫過程也是很必要的。
常見問題匯總
1.Qubit檢測能否指示核酸樣品中的樣品質(zhì)量?
不能,Qubit 檢測僅 樣品中DNA/RNA的量。 Qubit熒光計(jì)不能獲取吸光度讀數(shù)以提供A260 / A280比率或檢測核酸樣品中的蛋白質(zhì)。質(zhì)量情況可以使用NanoDrop儀器完成。
2. 產(chǎn)品成分只有兩個(gè)標(biāo)準(zhǔn)品,制作標(biāo)準(zhǔn)曲線的時(shí)候需要對standard 2進(jìn)行稀釋嗎?
使用產(chǎn)品時(shí)可直接用兩個(gè)標(biāo)準(zhǔn)品測定熒光值后做標(biāo)準(zhǔn)曲線,即兩點(diǎn)連成直線。
如果想稀釋多個(gè)梯度制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,也可以使用1×TE對standard 2 進(jìn)行梯度稀釋。
另如果擔(dān)心96孔板測試時(shí)候熒光相互干擾,可選擇黑色的底部透明板。
3.使用酶標(biāo)儀做Qubit檢測,Ex值480 nm,Em值520 nm,但是我用的儀器沒有這兩個(gè)波長設(shè)置,其他的波長測定可以嗎?準(zhǔn)確度和靈敏度與酶標(biāo)儀相比如何?
可以,picogreen的吸收峰如下圖,可知Ex在480nm處有大吸收峰,Em在520nm處有大吸收峰,而如果儀器波長不在這兩個(gè)上面,也是可以測定的,只不過熒光值會低一點(diǎn)的。
Qubit定量分析的準(zhǔn)確度和靈敏度與酶標(biāo)儀的準(zhǔn)確度和靈敏度相同。 這是產(chǎn)品開發(fā)過程中的一項(xiàng)要求。
4. 為什么要做復(fù)孔?
Qubit是一個(gè)靈敏度比較高的濃度測定儀器,測量值與樣本的質(zhì)量和外界的溫度都有關(guān)系,增加復(fù)孔可以有效降低測量過程中帶來的誤差,保證數(shù)據(jù)的可準(zhǔn)確性。
5. 復(fù)孔對應(yīng)的數(shù)據(jù)不一致?
1)操作誤差;2)樣本質(zhì)量差,濃度低對應(yīng)的誤差較大;3)片段長度不均一(Qubit里面的染料對于不同長度的DNA結(jié)合能力有差別,重復(fù)對應(yīng)的時(shí)間不同,熒光值不同)
6. 環(huán)境溫度不同,測試的值會不同嗎?
會的,Qubit里面對應(yīng)的熒光染料在不同的溫度下對應(yīng)的熒光信號強(qiáng)弱會有偏差的,一般在低溫測出的值會偏大大,高溫測出的值偏?。ㄔ谠噭┖兄袠?biāo)準(zhǔn)品恢復(fù)室溫測試時(shí),整體誤差范圍在10%左右,極限誤差在15%左右)
7.測試復(fù)孔的時(shí)候,連續(xù)測,不取出來,為什么值越來越???
連續(xù)在激發(fā)光激發(fā)的情況下,熒光染料的半衰期會降低,此時(shí)對應(yīng)收集的熒光信號會降低,對應(yīng)的數(shù)據(jù)會偏低,建議讀取完數(shù)據(jù)之后,從儀器中取出,5min左右再去測量,基本不會有什么偏差
8. 如何檢測Qubit試劑的測試準(zhǔn)確性?
1)相對準(zhǔn)確,參考life對應(yīng)試劑測量,對比結(jié)果分析;
2)準(zhǔn)確,試劑盒中配套的標(biāo)準(zhǔn)品,經(jīng)過適當(dāng)稀釋之后,上機(jī)測試,對比結(jié)果分析
對應(yīng)產(chǎn)品
dsDNA HS Assay Kit for Qubit®
——5min準(zhǔn)確定量結(jié)果
dsDNA Assay Kit for Qubit®是Yeasen生物開發(fā)的專門用于Qubit®熒光儀或熒光酶標(biāo)儀的試劑盒,線性范圍0.2-100 ng,即使在存在ssDNA、RNA和單體核苷酸的條件下,也可以選擇性的檢測dsDNA,且耐受較高濃度的蛋白質(zhì)、鹽類、洗滌劑等污染物。
簡便:無實(shí)驗(yàn)操作簡單,5min之內(nèi)出結(jié)果;
靈敏: 0.2-100ng的樣本,都能準(zhǔn)確定量;
準(zhǔn)確:競品同比誤差小,均控制在10%以內(nèi)批間差異??;
穩(wěn)定:不同生產(chǎn)批次之間無差異。
訂購信息
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品編號 | 規(guī)格 | 價(jià)格(元) |
dsDNA HS Assay Kit for Qubit® | 12640ES60/76 | 100/500 T | 686/2696 |
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