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漲知識!對于PCR你真的知道么?
PCR技術(shù)作為分子生物學(xué)基礎(chǔ)的研究方法之一。20世紀(jì)80年代凱利·穆利斯發(fā)明第—代PCR技術(shù)以來,“變性、退火、延伸"三部曲從未停歇。歷經(jīng)三十多年的演變,PCR技術(shù)已衍生出眾多變體。小翊總結(jié)了一代PCR的一些常見類型,助力您的科學(xué)研究。
常規(guī)PCR
常規(guī)PCR一般是由Taq DNA聚合酶介導(dǎo)的PCR反應(yīng),操作較為簡便,產(chǎn)物帶有A尾。通過瓊脂糖凝膠電泳對終產(chǎn)物進(jìn)行定性和半定量分析。兼容樣本范圍廣,但保真性低,主要應(yīng)用于常規(guī)重組質(zhì)粒驗證和基因型鑒定等方面。
常規(guī)PCR產(chǎn)品
產(chǎn)品名稱:2×Hieff® Robust PCR Master Mix (With Dye)
產(chǎn)品特點:
1)延伸速度快(15-30s/kb),極限速度達(dá)5s/kb。
2)模板適用性更廣泛,靶基因GC耐受范圍35-70%。
圖1. 以小鼠基因組為模板,分別擴(kuò)增1-4kb的片段。
高保真PCR
高保真PCR一般是由保真性較高的DNA聚合酶介導(dǎo)的PCR反應(yīng)。第—代高保真DNA聚合酶是從棲熱原始菌Pyrococcus furiosus中獲得的具有校正功能的pfu酶,與常規(guī)Taq酶相比多了一種3’-5’的核酸外切酶活性(Proofreading活性),保真性大大提高且擴(kuò)增的產(chǎn)物通常為平末端。目前主要有2類產(chǎn)品:一類是混合型的高保真酶,將帶有Proofreading活性的酶與普通Taq酶混合用于提高擴(kuò)增效率;另一類是單一型的高保真酶,保真性更高。
翊圣Hieff Canace® Gold高保真DNA聚合酶基于Pfu,經(jīng)基因工程改造而成。酶溶液中添加了*的反應(yīng)增強(qiáng)因子、熱啟動因子和延伸因子,極大提高了擴(kuò)增的成功率,特異性和延伸速度。對于高保真PCR應(yīng)用而言,具有高保真性、高成功率、高特異性的Hieff Canace® Gold高保真DNA聚合酶是理想選擇。
高保真PCR產(chǎn)品
產(chǎn)品名稱:Hieff Canace® Gold PCR Master Mix
產(chǎn)品特點:
1)保真性高,是Taq酶的52倍,pfu酶的6倍。
2)超高特異性。
3)高靈敏:可擴(kuò)增低至1 pg模板。
圖2. 5種品牌的高保真DNA聚合酶擴(kuò)增2 kb,4 kb的小鼠gDNA。Y:Hieff Canace® Gold高保真DNA聚合酶;A-E:其他品牌的高保真DNA聚合酶。
熱啟動PCR
熱啟動PCR,也稱Hotstart PCR。指通過一定條件將DNA聚合酶與其他PCR反應(yīng)物隔絕,使其低溫條件下無活性,高溫加熱后釋放酶活,進(jìn)而避免出現(xiàn)非特異性產(chǎn)物。熱啟動PCR的關(guān)鍵是熱啟動型的DNA聚合酶,一般通過抗體、配體或化學(xué)修飾等來封閉酶活性中心,不同的熱啟動修飾方法原理上有所區(qū)別,各有優(yōu)劣勢(見下表)。通常應(yīng)用于復(fù)雜模板、低拷貝基因擴(kuò)增,也是IVD試劑的核心原料。
酶活封閉類型 | 化學(xué)修飾 | 配體修飾 | 抗體修飾 |
原理 | 低溫下,化學(xué)小分子和DNA聚合酶活性中心結(jié)合,酶無活性;升溫至變性溫度,兩者脫離,酶活性中心暴露發(fā)生聚合反應(yīng)。 | 核酸適配體通過非共價鍵作用與聚合酶結(jié)合,進(jìn)而抑制聚合酶在非許可溫度下的聚合反應(yīng)。 | 高溫變性前,抗Taq抗體與Taq酶結(jié)合,抑制聚合酶活性。溫度升高至變性溫度,抗Taq抗體變性失活,聚合酶發(fā)生聚合反應(yīng)。 |
優(yōu)點 | 酶活性維持更加穩(wěn)定且無任何外源DNA污染,性價比較高。 | 酶激活時間短,保證酶活。 | 酶激活時間短,保證酶活,親和力強(qiáng),靈敏度高。 |
缺點 | 酶激活時間較長可能會影響酶的活性,導(dǎo)致PCR產(chǎn)物的產(chǎn)量降低。 | 核酸配體是一種可逆抑制劑,不如化學(xué)修飾法穩(wěn)定,特異不夠強(qiáng) | 抗體修飾是一種動態(tài)平衡,不如化學(xué)修飾法穩(wěn)定,價格更貴。 |
熱啟動PCR產(chǎn)品
產(chǎn)品名稱:Hieff UNICON® HotStart Taq DNA Polymerase (抗體法熱啟動Taq酶)
產(chǎn)品特點:抗體法修飾,親和力強(qiáng),靈敏度高,特異性好。
直擴(kuò)PCR
直擴(kuò)PCR技術(shù),是以未經(jīng)基因組純化的微量原始樣本或其裂解產(chǎn)物作為模板進(jìn)行PCR反應(yīng)。廣泛適用于血液樣本、植物和動物等組織,與常規(guī)PCR相比,樣本用量少、操作簡單、實驗成本低、可高通量化操作。可應(yīng)用于基因分型、轉(zhuǎn)基因鑒定等實驗。
翊圣直擴(kuò)PCR系列產(chǎn)品運用*的裂解體系,快速裂解樣品,裂解液可直接作為模板,搭配試劑盒中的具有*抑制物耐受性的Taq DNA聚合酶進(jìn)行基因的擴(kuò)增。
圖3.組織直擴(kuò)系列流程圖
小鼠直擴(kuò)PCR產(chǎn)品
產(chǎn)品名稱:Mouse Tissue Direct PCR Kit (With Dye) 小鼠組織直接PCR試劑盒(Cat#10185)
產(chǎn)品特點:
1)樣本需要量少:5mg鼠組織或1-5mm鼠尾。
2)模板制備更方便:無需研磨,無需精提純化gDNA。
3)優(yōu)化的PCR體系:具有更高的特異性、更強(qiáng)的 PCR 反應(yīng)抑制物耐受性。
圖4.適合不同類型的小鼠粗提組織
多重PCR
多重PCR,也稱復(fù)合PCR。反應(yīng)原理、反應(yīng)過程與常規(guī)PCR無異,需要在同一個PCR反應(yīng)體系中,使用多對引物對多個基因同時進(jìn)行擴(kuò)增。理論上只要PCR擴(kuò)增的條件合適,引物對的數(shù)量可以不限,但實際由于各種條件的限制,實際能夠擴(kuò)增的產(chǎn)物有限。多重PCR反應(yīng)體系的組成和PCR循環(huán)的條件需經(jīng)過優(yōu)化以確保同時擴(kuò)增多個片段。具有性、系統(tǒng)性、經(jīng)濟(jì)簡便性,難點是反應(yīng)體系各組分的平衡。主要用于多種病原微生物的同時檢測或癌基因的分型。
圖5.多重PCR原理圖
多重PCR產(chǎn)品
產(chǎn)品名稱:Hieff® Multiplex PCR Kit
產(chǎn)品特點:
1)擴(kuò)增子大小:適合50bp-1.5kb的擴(kuò)增子。
2)均一性好:靶點偏好性極低。
3)特異性強(qiáng):///大程度抑制非特異性擴(kuò)增;
4)靈敏度高:可擴(kuò)增低至1ng模板;
5)擴(kuò)增重數(shù):可達(dá)20-1000重。
圖6. 以人gDNA模板,進(jìn)行10重PCR,可檢測低至1ng的模板
巢式PCR
巢式PCR是指利用兩對引物進(jìn)行兩輪PCR擴(kuò)增的反應(yīng)。首先使用目的片段外圍的引物對模板進(jìn)行擴(kuò)增,然后使用內(nèi)部的巢式引物同時將第—輪PCR擴(kuò)增產(chǎn)物作為第二輪擴(kuò)增的模板。第二次PCR擴(kuò)增得到的目的片斷短于第—次擴(kuò)增。
翊圣GMyc-PCR 支原體檢測試劑盒基于支原體16S-23S rRNA序列保守區(qū)域利用巢式PCR法原理可檢測到常見的支原體污染。主要應(yīng)用于病毒檢測、測序分析、低表達(dá)基因檢測等。
巢式PCR產(chǎn)品
產(chǎn)品名稱:GMyc-PCR Mycoplasma Test Kit GMyc-PCR支原體檢測試劑盒
產(chǎn)品特點:檢測多種支原體類型,檢測限低至單拷貝。
圖7. 巢式PCR擴(kuò)增含不同濃度支原體樣品。
降落PCR
降落PCR,又稱Touch-down PCR。通過設(shè)置PCR程序中的退火溫度,一般開始時高于預(yù)設(shè)的Tm值,隨著反應(yīng)的進(jìn)行,退火溫度逐漸降低到Tm值,并終低于該溫度進(jìn)行PCR反應(yīng)。通過反應(yīng)程序中退火溫度的設(shè)置,極大程度上降低了引物與模板的非特異性結(jié)合。主要用于PCR反應(yīng)程序的優(yōu)化,提高產(chǎn)物特異性。
常見的PCR類型介紹就到這里了。當(dāng)然,除了上述介紹的PCR形式,還有錨定PCR、原位PCR等不同的PCR類型,如感興趣可自行查閱或留言哦!
相關(guān)產(chǎn)品*活動
產(chǎn)品類別 | 產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品編號 | 規(guī)格 | 價格(元) | *(元) |
常規(guī)PCR | 2×Hieff® Robust PCR Master Mix (With Dye) | 10106ES03 | 1ml | 65 | 買30支送30支 買50支送70支 買100支送200支 買300支送800支 |
高保真PCR | 2×Hieff Canace® Gold PCR Master Mix高保真酶預(yù)混液 | 10149ES01 | 1ml/5ml | 553/1453 | 1-3支,144元/支 4-6支,128元/支 7-10支,120元/支;11支以上,112元/支 |
熱啟動PCR | 2×Hieff™ HotStart PCR Genotyping Master Mix (With Dye) | 10108ES03 | 1ml | 75 | 買30支送30支 買50支送70支 買100支送200支 買300支送800支 |
2×Hieff UNICON® HotStart PCR Master Mix (With Dye) | 10111ES03 | 1ml | 96 | 77 | |
直擴(kuò)PCR | Mouse Tissue Direct PCR Kit (With Dye) 小鼠組織直接PCR試劑盒 | 10185ES50/70 | 50/200T | 323/983 | 買一送一 |
多重PCR | Hieff Multiplex PCR kit | 13279ES50 | 100T/500T | 875/3165 | 875/3165 |
巢式PCR | GMyc-PCR Mycoplasma Test Kit GMyc-PCR支原體檢測試劑盒 | 40601ES10/20 | 10T/20T | 327/557 | 327/557 |