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無毒、無臭、無需避光的預(yù)混RNA建庫(kù)試劑盒重磅推出!

2023-9-15  閱讀(222)

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你在進(jìn)行RNA建庫(kù)時(shí),是否遇到過這樣的困擾:


 
  • RNA實(shí)驗(yàn)時(shí),有些試劑打開一股臭味襲來,尤其是樣本很多時(shí),這酸爽簡(jiǎn)直能把人帶走,讓人不得不懷疑這試劑是不是有毒性;

  • 建庫(kù)試劑要求避光,總不能全程黑燈熄火操作吧?

這個(gè)毒性以及需要避光的罪魁禍?zhǔn)拙褪?/span>放線菌素D。
 
 
 
 
 
 
那么,建庫(kù)試劑盒中為什么要加放線菌素D呢?
 
相關(guān)資料顯示,放線菌素D(Actinomycin D)又稱更生霉素,分子中含有一個(gè)苯氧環(huán)結(jié)構(gòu),通過它連接兩個(gè)等位的環(huán)狀肽鏈。此肽鏈可與DNA分子的脫氧鳥嘌呤發(fā)揮特異性相互作用,使放線菌素D嵌入DNA雙螺旋的小溝中,與DNA形成復(fù)合體,阻礙RNA多聚酶的功能,抑制RNA的合成,特別是mRNA的合成。通俗點(diǎn)來說就是,放線菌素D能抑制聚合酶在合成cDNA一鏈的過程中同時(shí)合成cDNA二鏈,這樣,在二鏈合成時(shí)才能使用dUTP替換dTTP。放線菌素D的添加對(duì)鏈特異建庫(kù)效果較好,能明顯增加建庫(kù)試劑盒的鏈特異性。
 
加了放線菌素D的建庫(kù)試劑盒,能簡(jiǎn)便實(shí)驗(yàn)流程。鏈特異研究時(shí),鏈特異性也大幅度提升,在RNA相關(guān)的科研上,算是核心之一了。

 

進(jìn)口試劑商N(yùn)EB公司的RNA建庫(kù)試劑盒,也做了對(duì)比,含放線菌素D和不含放線菌素D,鏈特異性上差別很大。

 

圖.N*公司對(duì)是否添加放線菌素D的對(duì)比實(shí)驗(yàn)結(jié)果

(圖片來自NEB)

 

從圖中可以看到,90%以上的reads都比對(duì)到了預(yù)期的正義鏈上,說明含放線菌素D的測(cè)序文庫(kù)的鏈特異性良好。

 

但是,放線菌素D有它自身的弊端:有一定毒性,還需要避光。在目前這種預(yù)混版建庫(kù)試劑盒甚至是板式建庫(kù)試劑盒需求與日俱增的時(shí)代,需要避光限制了板式試劑盒的進(jìn)步。
 
現(xiàn)在,再也不用擔(dān)心放線菌素的問題了。翌圣生物酶進(jìn)化平臺(tái)ZymeEditor進(jìn)化了一款新型酶,該酶替換了放線菌素D的功能,且無臭無毒,還無需避光,并且鏈特異性上還更勝,再也不用擔(dān)心健康問題和避光問題了!
 
翌圣生物,注重客戶體驗(yàn),在RNA建庫(kù)試劑盒的研究上,一直在不斷突破。

 

圖.翌圣RNA建庫(kù)試劑盒進(jìn)化軸

 

什么?不含放線菌素D的試劑盒性能怎么樣?我們來上一波數(shù)據(jù)吧,用數(shù)據(jù)說話。

圖.含放線菌素D和不含放線菌素D的試劑盒使用同一樣本不同投入量的鏈特異性對(duì)比

 

使用舊版試劑盒(含放線菌素D)和新版試劑盒(不含放線菌素D)在分別投入10 ng、1 μg和4 μg進(jìn)行建庫(kù)時(shí),文庫(kù)產(chǎn)量相當(dāng)。

 

圖.含放線菌素D和不含放線菌素D的試劑盒使用同一樣本不同投入量的鏈特異性對(duì)比

 

使用舊版試劑盒(含放線菌素D)和新版試劑盒(不含放線菌素D)在分別投入10 ng、1 μg和4 μg進(jìn)行建庫(kù)時(shí),鏈特異性相當(dāng)。在低投入時(shí),新版不含放線菌素D的試劑盒鏈特異性更高。

 

 
產(chǎn)品推薦
 

產(chǎn)品名稱

貨號(hào)

規(guī)格

New Hieff NGS ® EvoMax RNA Library Prep Kit(dUTP)
鏈特異性預(yù)混版total RNA建庫(kù)試劑盒(不含放線菌素D)

12340ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit(Premixed version)
預(yù)混版total RNA建庫(kù)試劑盒(含放線菌素D)

12310ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit V2
 mRNA純化試劑盒V2

12629ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS)
/小鼠/大鼠核糖體RNA去除試劑盒

12257ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit(Plant)
植物核糖體RNA去除試劑盒

12254ES24/96

24 T/ 96 T

Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Bacteria(G- and G+)) with purification beads
細(xì)菌核糖體RNA去除試劑盒

12264ES24/96

24 T/ 96 T


 


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