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上新 | 磁珠法土壤/糞便DNA提取試劑盒，助力宏基因組學(xué)研究

2023-12-13　　閱讀(181)

宏基因組學(xué)是直接研究環(huán)境樣品中的遺傳學(xué)材料，主體研究對象是微生物群落的基因組，即所有微生物個體基因組的總和。對于微生物組學(xué)的研究，最常見的就是通過高通量測序技術(shù)對16SrDNA/18S rDNA/ITS等序列進(jìn)行測序，從而獲得樣品中的微生物群落組成以及相對豐度，進(jìn)而揭示環(huán)境樣品中的物種組成，物種多樣性特征，預(yù)測基因功能信息等。

圖1.宏基因組學(xué)概貌（Berg et al. Microbiome (2020) 8:103）

環(huán)境樣本，比如土壤、糞便、水體等樣本中含有豐富的微生物，但這些樣本成分復(fù)雜；

翌圣生物經(jīng)過匠心打造，自主研發(fā)出高性能的磁珠法土壤/糞便DNA提取試劑盒，助力宏基因組學(xué)的研究！

產(chǎn)品介紹

MolPure® Mag Soil/Stool DNA Kit磁珠法土壤/糞便DNA提取試劑盒（Cat#18526ES）適用于土壤、糞便、水樣、水體濾膜、細(xì)菌、真菌等環(huán)境樣本基因組DNA的提取。采用的磁珠和精心優(yōu)化的緩沖體系，可最大限度的分離純化樣本中的微生物基因組DNA。提取的核酸純度高，質(zhì)量穩(wěn)定可靠，適用于各種下游應(yīng)用實(shí)驗(yàn)，如酶切、PCR、建庫等。配合磁珠法自動化提取儀器使用，可實(shí)現(xiàn)核酸的高通量提取。

產(chǎn)品特點(diǎn)

操作便捷：室溫操作，僅需1h內(nèi)即可回收DNA；
產(chǎn)量高：的研磨珠能高效裂解土壤微生物，釋放更多DNA，最大限度地提高其產(chǎn)量；
適用范圍廣：適合土壤、糞便、水體、濾膜、拭子等環(huán)境樣本；
純度高：有效去除環(huán)境樣本中腐殖酸、重金屬離子等雜質(zhì)，適用于各種下游應(yīng)用實(shí)驗(yàn)，如酶切法建庫。

操作流程

圖2.土壤/糞便DNA提取操作流程圖

產(chǎn)品性能

DNA的濃度和純度

土壤、糞便、水體樣本，分別用18526ES和競品M進(jìn)行DNA提取，其中18526ES搭配翌圣48通道自動化核酸提取儀使用，洗脫體積均為70μL，結(jié)果顯示：18526ES相對競品展現(xiàn)出更優(yōu)異的DNA濃度和純度。

圖3.土壤/糞便/水樣DNA的濃度和純度

16S qPCR擴(kuò)增

土壤、糞便、水體樣本，分別用18526ES和競品M進(jìn)行DNA提取，各取相同體積的DNA溶液進(jìn)行細(xì)菌16S qPCR擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)，結(jié)果顯示，18526ES提取產(chǎn)物Ct值均小于競品M。

圖4 .土壤/糞便/水樣DNA16S qPCR擴(kuò)增結(jié)果

NGS文庫構(gòu)建分析

土壤樣本和糞便樣本，分別用18526ES和競品M進(jìn)行DNA提取，各取100ng DNA用翌圣一步法DNA建庫試劑盒V2（Cat#12195ES）進(jìn)行宏基因組建庫，結(jié)果顯示，18526ES提取的DNA文庫產(chǎn)量和QC指標(biāo)與競品M相當(dāng)，微生物種類數(shù)量優(yōu)于競品M。

圖5.土壤/糞便DNA文庫數(shù)據(jù)質(zhì)量

產(chǎn)品推薦

產(chǎn)品名稱	產(chǎn)品貨號	產(chǎn)品規(guī)格
MolPure® Mag Soil/Stool DNA Kit磁珠法土壤/糞便DNA提取試劑盒	18526ES20	20T
	18526ES50	50T
	18526ES70	200T
MolPure® Mag48 SoilStool DNA Kit FA 磁珠法48孔土壤/糞便DNA提取試劑盒FA（預(yù)封裝）	18528ES48	48T

磁珠法核酸提取相關(guān)產(chǎn)品

產(chǎn)品應(yīng)用	產(chǎn)品名稱	產(chǎn)品編號
磁珠法石蠟包埋組織DNA提取	MolPure® Magnetic FFPE DNA Kit	18371ES
血漿、血清游離DNA提取	MolPure® Magnetic Circulating Cell-Free DNA Kit	18382ES
拭子樣本病毒DNA/RNA提取	MolPure® Magnetic Swab Viral DNA/RNA Kit	18300ES
磁珠法組織/細(xì)胞總RNA提取	MolPure® Magnetic Tissue/Cell Total RNA Kit	18600ES
磁珠法血液DNA提取	MolPure® Magnetic M4P1 Blood DNA Kit	18504ES