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上新 | 磁珠法土壤/糞便DNA提取試劑盒,助力宏基因組學研究

2023-12-13  閱讀(242)

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宏基因組學是直接研究環(huán)境樣品中的遺傳學材料,主體研究對象是微生物群落的基因組,即所有微生物個體基因組的總和。對于微生物組學的研究,最常見的就是通過高通量測序技術對16SrDNA/18S rDNA/ITS等序列進行測序,從而獲得樣品中的微生物群落組成以及相對豐度,進而揭示環(huán)境樣品中的物種組成,物種多樣性特征,預測基因功能信息等。
 

圖1.宏基因組學概貌(Berg et al. Microbiome (2020) 8:103)

 

環(huán)境樣本,比如土壤、糞便、水體等樣本中含有豐富的微生物,但這些樣本成分復雜;

 

翌圣生物經過匠心打造,自主研發(fā)出高性能的磁珠法土壤/糞便DNA提取試劑盒,助力宏基因組學的研究!

 

 

產品介紹

 
MolPure® Mag Soil/Stool DNA Kit磁珠法土壤/糞便DNA提取試劑盒(Cat#18526ES)適用于土壤、糞便、水樣、水體濾膜、細菌、真菌等環(huán)境樣本基因組DNA的提取。采用的磁珠和精心優(yōu)化的緩沖體系,可最大限度的分離純化樣本中的微生物基因組DNA。提取的核酸純度高,質量穩(wěn)定可靠,適用于各種下游應用實驗,如酶切、PCR、建庫等。配合磁珠法自動化提取儀器使用,可實現核酸的高通量提取。

 

 

產品特點

 
  • 操作便捷:室溫操作,僅需1h內即可回收DNA;

  • 產量高:的研磨珠能高效裂解土壤微生物,釋放更多DNA,最大限度地提高其產量;

  • 適用范圍廣:適合土壤、糞便、水體、濾膜、拭子等環(huán)境樣本;

  • 純度高:有效去除環(huán)境樣本中腐殖酸、重金屬離子等雜質,適用于各種下游應用實驗,如酶切法建庫。

 

 

 

操作流程

 

圖2.土壤/糞便DNA提取操作流程圖

 

 

產品性能

 
01
DNA的濃度和純度
 
 
土壤、糞便、水體樣本,分別用18526ES和競品M進行DNA提取,其中18526ES搭配翌圣48通道自動化核酸提取儀使用,洗脫體積均為70μL,結果顯示:18526ES相對競品展現出更優(yōu)異的DNA濃度和純度。

 

圖3.土壤/糞便/水樣DNA的濃度和純度

 

02
16S qPCR擴增
 
 

土壤、糞便、水體樣本,分別用18526ES和競品M進行DNA提取,各取相同體積的DNA溶液進行細菌16S qPCR擴增實驗,結果顯示,18526ES提取產物Ct值均小于競品M。

 

圖4 .土壤/糞便/水樣DNA16S qPCR擴增結果

 

03
NGS文庫構建分析
 
 

土壤樣本和糞便樣本,分別用18526ES和競品M進行DNA提取,各取100ng DNA用翌圣一步法DNA建庫試劑盒V2(Cat#12195ES)進行宏基因組建庫,結果顯示,18526ES提取的DNA文庫產量和QC指標與競品M相當,微生物種類數量優(yōu)于競品M。

 

圖5.土壤/糞便DNA文庫數據質量

 

 

 

產品推薦

 

 

產品名稱

產品貨號

產品規(guī)格

MolPure® Mag Soil/Stool DNA Kit磁珠法土壤/糞便DNA提取試劑盒

18526ES20

20T

18526ES50

50T

18526ES70

200T

MolPure® Mag48 SoilStool DNA Kit FA 磁珠法48孔土壤/糞便DNA提取試劑盒FA(預封裝)

18528ES48

48T

 

 

 

磁珠法核酸提取相關產品

 

 

產品應用

產品名稱

產品編號

磁珠法石蠟包埋組織DNA提取

MolPure® Magnetic FFPE DNA Kit 

18371ES

血漿、血清游離DNA提取

MolPure® Magnetic Circulating Cell-Free DNA Kit

18382ES

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MolPure® Magnetic Swab Viral DNA/RNA Kit

18300ES

磁珠法組織/細胞總RNA提取

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18600ES

磁珠法血液DNA提取

 MolPure® Magnetic M4P1 Blood DNA Kit

18504ES



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