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細胞分裂(cell division)是生物體中細胞增殖的過程,通過這一過程,一個母細胞(mother cell)復制其所有必要的成分,并分成兩個或更多個具有相似遺傳信息的子細胞(daughter cells)。細胞分裂對于維持生命活動至關重要,是所有細胞生命的基礎。無論是對于單細胞生物的增長和繁殖,還是對于多細胞生物的生長、修復損傷組織和生殖都是不可少的。
古細菌作為地球上最早出現的生命形式之一,其細胞分裂機制能提供關于早期生命如何增殖和演變的重要線索。通過了解古細菌的分裂方式,科學家可以更好地理解生命起源時原始細胞的復制機制,以及后來不同生物域的細胞分裂方式的演化過程。大多數古細菌使用原核微管蛋白同源物FtsZ或運輸所需的內體分選復合物(ESCRT)(也稱為Cdv系統(tǒng))來實現細胞分裂,但這兩種系統(tǒng)都沒有得到可靠的表征,人們對于古細菌的分裂系統(tǒng)及其調控機制了解相對較少。
2024年3月4日,武漢大學生命科學學院杜世燊團隊在Nature Microbiology(IF:30.964)上發(fā)表了題為“Widespread photosynthesis reaction centre barrel proteins are necessary for haloarchaeal cell division"的研究論文,該論文以沃氏富鹽菌(Haloferax volcanii)為模型,發(fā)現了能調控細胞分裂的新型CdpB蛋白,揭示CdpB蛋白在細胞分裂過程中的作用機制,表明光合作用反應中心(PRC)桶蛋白在古菌的細胞分裂中起到重要作用,以期為深入理解細胞分裂的調控機制提供新的視角。
圖1.CdpB1-GFP與已知細胞分裂蛋白共定位的代表性圖像(圖片來自原文)
研究人員通過同源重組構建雙元表達質粒,判斷不同分裂基因能否雙重表達。結果顯示HVO_1691的熒光蛋白融合定位于細胞中(圖1),且與已知的細胞分裂蛋白FtsZ1、FtsZ2和SepF存在熒光共定位的情況,共定位百分比可達100%。表明HVO_1691蛋白在細胞分裂中起著重要作用,并將其重命名為細胞分裂蛋白B1 (CdpB1)。
圖2.CdpB1的缺失導致細胞分裂后形態(tài)缺陷(圖片來自原文)
圖3.去除色氨酸后cdpB1s轉錄水平的RT-qPCR分析(圖片來自原文)
為了確認CdpB1參與細胞分裂,研究人員構建His標記和非標記的CdpB1缺失菌株,將其啟動子替換為色氨酸誘導啟動子Ptna,使其表達受色氨酸調節(jié)。在色氨酸存在下,細胞生長良好;當從培養(yǎng)物中去除色氨酸后,細胞逐漸變大和畸形(圖2)。定量PCR逆轉錄(RT-qPCR)和蛋白質印跡分析證實,去除色氨酸后,cdpB1轉錄本和His-CdpB1蛋白水平急劇降低(圖2和圖3)。表明CdpB1對細胞分裂和細胞形態(tài)至關重要,降低它的表達水平導致細胞分裂及形態(tài)出現嚴重缺陷。
圖4.PRC桶蛋白在鹽古菌細胞分裂中廣泛保守(圖片來自原文)
a:PRC桶蛋白PRC桶狀蛋白在Natrinema sp. J7和H. hispanica細胞中定位的代表性圖像。b:CdpB1缺失的H. volcanii細胞分別與CdpB1或其同源物NJ7GCdpB1和HAHCdpB1互補的代表性圖像。c:CdpB1同源物的缺失分別在Natrinema sp. J7和H. hispanica細胞中引起嚴重和中度分裂缺陷。
進一步研究發(fā)現,CdpB1直接與細胞分裂蛋白FtsZ的膜錨定蛋白SepF相互作用,依賴FtsZ來調控細胞分裂。CdpB1的家族成員CdpB2和CdpB3也參與細胞分裂過程,但其缺失對細胞分裂的影響不同。CdpB蛋白的同源物也參與其他鹽古菌的細胞分裂,表明CdpB1蛋白的細胞分裂功能在不同物種中高度保守(圖4)。比較基因組學分析和系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,CdpB蛋白是PRC-barrel蛋白超家族的成員,含有PRC結構域,廣泛分布于各種古菌分支中。值得注意的是,古菌ESCRT細胞分裂系統(tǒng)中的關鍵蛋白CdvA也含有PRC結構域,表明PRC結構域在古菌細胞分裂系統(tǒng)中具有廣泛而保守的作用。綜合分析表明,PRC蛋白家族是古菌細胞分裂系統(tǒng)中的重要組成部分,可能作為適配器招募其他參與細胞分裂的蛋白,在古菌細胞分裂中具有保守功能。
綜上所述,本研究發(fā)現了一類廣泛保守的古菌細胞分裂蛋白并初步揭示了其分子機制,這些發(fā)現為細胞分裂機器的演化提供了新的見解,為深入研究古菌細胞分裂機制及分裂機器的演化奠定了基礎。
在該研究中,研究人員選擇了翌圣克隆試劑盒用于構建表達載體、qPCR Mix用于基因表達情況分析、高保真酶用于擴增目的片段。
(截圖來自原文Data 7)
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