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翌圣生物科技（上海）股份有限公司
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腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療
中國(guó)的癌癥發(fā)病率和死亡率一直在上升，自2010年以來(lái)，癌癥成為主要的死亡原因，也是中國(guó)的一個(gè)主要公共衛(wèi)生問(wèn)題，每年惡性腫瘤所致的醫(yī)療花費(fèi)超過(guò)2200億。隨著越來(lái)越多的腫瘤早篩、伴隨診斷產(chǎn)品被NMPA批準(zhǔn)，更多的省份將腫瘤分子診斷技術(shù)納入醫(yī)保，更多的腫瘤患者將得益于分子診斷技術(shù)的輔助治療，未來(lái)腫瘤患者生存率將與發(fā)達(dá)國(guó)家不斷縮小。
腫瘤伴隨診斷NGS解決方案
翌圣DNA文庫(kù)制備產(chǎn)品方案
機(jī)械法 DNA 建庫(kù)試劑盒
Hieff NGS® DNA Library Prep Kit（Cat#13577）
優(yōu)異的捕獲數(shù)據(jù)質(zhì)量
不同樣本不同品牌建庫(kù)產(chǎn)量及下機(jī)數(shù)據(jù)對(duì)比測(cè)試
分別利用cfDNA、NA12878人類(lèi)基因組 DNA 標(biāo)準(zhǔn)品、FFPE DNA為模板，其中cfDNA、NA12878樣本投入量為30 ng，F(xiàn)FPE DNA投入量為50 ng，13577與競(jìng)品試劑在3種樣本上建庫(kù)，捕獲panel為何因Cancer SLC Panel，結(jié)果顯示：13577產(chǎn)量?jī)?yōu)，下機(jī)數(shù)據(jù)捕獲率、平均捕獲深度和supplier I品牌相當(dāng)，且與3家競(jìng)品試劑相比，13577 Dup值低。
機(jī)械法 DNA 建庫(kù)試劑盒搭配 FFPE 修復(fù)試劑
Hieff NGS® FFPE DNA Repair Reagent（Cat#12606）
修復(fù)試劑 12606 搭配 13577 建庫(kù)試劑盒文庫(kù)產(chǎn)量測(cè)試數(shù)據(jù)
選擇7種不同類(lèi)型的FFPE樣本，每個(gè)樣本實(shí)驗(yàn)分成兩組，分別為末修環(huán)節(jié)不添加FFPE修復(fù)試劑和添加FFPE修復(fù)試劑，模板投入量為50 ng，PCR循環(huán)數(shù)為8，構(gòu)建好文庫(kù)后直接進(jìn)行上機(jī)測(cè)序。
加修復(fù)試劑能提高不同質(zhì)量FFPE樣本的建庫(kù)產(chǎn)量
加修復(fù)試劑對(duì)文庫(kù)產(chǎn)量的影響
加FFPE修復(fù)試劑的文庫(kù)產(chǎn)量更高，文庫(kù)產(chǎn)量提升大約在10-200%。
酶切法建庫(kù)試劑盒
Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3（Cat#12194）
極低的假陽(yáng)性率
NGS建庫(kù)引入的假陽(yáng)性問(wèn)題主要包括嵌合序列和堿基錯(cuò)摻等因素，在酶切法片段化時(shí)將會(huì)引入一些假的嵌合序列，12194對(duì)片段化酶全面升級(jí)，解決了酶切假陽(yáng)性的痛點(diǎn)。
用12194酶法片段化建庫(kù)試劑盒對(duì)3種標(biāo)準(zhǔn)品樣本（FFPE標(biāo)準(zhǔn)品、gDNA標(biāo)準(zhǔn)品、ctDNA標(biāo)準(zhǔn)品）建庫(kù)，并和競(jìng)品W進(jìn)行了頭對(duì)頭的比較。數(shù)據(jù)顯示，無(wú)論是FFPE樣本、gDNA、還是ctDNA，12194的Soft Clip、false chimeric都低于或近似于競(jìng)品W。
多重?cái)U(kuò)增靶向測(cè)序以超多重PCR為基礎(chǔ)，通過(guò)對(duì)目標(biāo)基因組區(qū)域進(jìn)行引物設(shè)計(jì)及PCR擴(kuò)增，富集靶向區(qū)域。
多重?cái)U(kuò)增靶向測(cè)序
多重?cái)U(kuò)增靶向測(cè)序以超多重PCR為基礎(chǔ)，通過(guò)對(duì)目標(biāo)基因組區(qū)域進(jìn)行引物設(shè)計(jì)及PCR擴(kuò)增，富集靶向區(qū)域。
2×Hieff® C2P4 Blood Direct Multiplex PCR Master Mix（Cat#13606）
良好的均一性
不同投入量的FFPE樣本進(jìn)行多重PCR建庫(kù)，分別用兩個(gè)擴(kuò)增子引物池進(jìn)行一輪擴(kuò)增，202對(duì)引物和530對(duì)引物，插入片段在200-300 bp，在相同的擴(kuò)增循環(huán)數(shù)和測(cè)序數(shù)據(jù)量，13606相較于競(jìng)品A有更好的均一性。
腫瘤轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
FFPE 樣本的 rRNA 去除
Hieff NGS® MaxUp Human rRNA Depletion Kit （rRNA & ITS/ETS）（Cat#12257）
不同樣本rRNA去除效率高，rRNA殘留率低
分別以1μg 人、小鼠、大鼠總RNA為樣本，Hieff NGS® MaxUp Human rRNA Depletion Kit （rRNA & ITS/ETS）（12257ES24/96）去除試劑盒去除rRNA后建庫(kù)，測(cè)序獲得rRNA殘留數(shù)據(jù)。
人珠蛋白去除
Globin mRNA Depletion Probe (Human)（Cat#12806）
良好的Globin去除性能
人血液RNA樣本為模板，以不同的投入進(jìn)行珠蛋白基因的去除，去除后Globin的占比幾乎為零。
FFPE 樣本 RNA 建庫(kù)
Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit（Cat#12308）
數(shù)據(jù)產(chǎn)出高，文庫(kù)均一性較好
不同質(zhì)量FFPE樣本與競(jìng)品公司的相似度（上排）與均一性（下排）對(duì)比
不同質(zhì)量的FFPE樣本的RNA文庫(kù)測(cè)序得到的結(jié)果進(jìn)行文庫(kù)分析，與競(jìng)品公司的文庫(kù)測(cè)序結(jié)果相似性高，數(shù)據(jù)的均一性更好。
腫瘤早篩NGS解決方案
腫瘤轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
甲基化轉(zhuǎn)化
Hieff® Superfast DNA Methylation Bisulfite Kit（Cat#12225）
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
轉(zhuǎn)化率高：DNA樣品中未甲基化胞嘧啶轉(zhuǎn)化為尿嘧啶的轉(zhuǎn)化率高達(dá)99.5%以上；
完整度好，回收率高：DNA降解程度低，轉(zhuǎn)化后樣本完整度好，DNA樣品的回收率高達(dá)55%以上。
human gDNA不同投入量進(jìn)行亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化，樣本中參入1%λDNA和0.5% PUC19DNA，12225ES的轉(zhuǎn)化率＞99.5%，DNA的回收率＞55%。
酶法甲基化轉(zhuǎn)化原料
TET/T4-BGT/APOBEC
為解決亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化的痛點(diǎn)，翌圣生物基于自主生物技術(shù)，使用定向進(jìn)化技術(shù)獲得了高活性的TET/T4-BGT/APOBEC，這三種酶可應(yīng)用于EM-seq酶法轉(zhuǎn)化。
cfDNA 以10 ng和200 ng的樣本起始量并參入1% λDNA和0.5%pUC19 DNA進(jìn)行甲基化轉(zhuǎn)化和甲基化建庫(kù)（Cat#12221ES），同時(shí)采用亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化作為對(duì)比（Cat#12222ES）, 結(jié)果顯示：TET2/T4-BGT酶氧化效率≥99%，APOBEC酶的脫氨效率≥99%，轉(zhuǎn)化率與亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化相當(dāng)，均能達(dá)到預(yù)期的效果。
DNA 甲基化建庫(kù)
甲基化單鏈建庫(kù)
Hieff NGS® Methyl-seq ssDNA Library Prep Kit for Illumina® V2（Cat#12221）
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
投入量低：可滿(mǎn)足10 pg~250 ng起始量的樣本建庫(kù)；
數(shù)據(jù)質(zhì)量佳：不同樣本類(lèi)型及不同投入量條件下均表現(xiàn)出優(yōu)異的數(shù)據(jù)質(zhì)量；
操作簡(jiǎn)便：2小時(shí)左右可以完成建庫(kù)。
以gDNA、cfDNA、FFPE DNA為模板，先進(jìn)行重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化，再進(jìn)行建庫(kù)。轉(zhuǎn)化試劑盒：DNA甲基化亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化試劑盒（ Cat # 12222ES）；和競(jìng)品對(duì)比，本試劑盒文庫(kù)產(chǎn)率要比競(jìng)品高。在測(cè)序數(shù)據(jù)方面Mapping ratio(%)比競(jìng)品略高，dup ratio(%)和競(jìng)品相當(dāng)。
甲基化雙鏈建庫(kù)
Hieff NGS® dsDNA Methyl Library Prep Kit for Illumina®（Cat#12214）
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
所有組分均通過(guò)質(zhì)量控制和功能驗(yàn)證，以確保文庫(kù)的穩(wěn)定產(chǎn)出；
支持多種類(lèi)型DNA樣本，包括gDNA、cfDNA和FFPE等；
兼容10 ng-1000 ng DNA的樣本投入量，并兼容市面主流的轉(zhuǎn)化方案。
12214ES文庫(kù)產(chǎn)量、數(shù)據(jù)質(zhì)量?jī)?yōu)于競(jìng)品
不同樣本不同投入量的文庫(kù)濃度
產(chǎn)品訂購(gòu)
樣本前處理
產(chǎn)品應(yīng)用 | 產(chǎn)品名稱(chēng) | 產(chǎn)品編號(hào) |
化學(xué)轉(zhuǎn)化 | DNA Methylation Bisulfite Kit | 12222ES |
Hieff® Superfast DNA Methylation Bisulfite Kit | 12225ES | |
Hieff® Mag DNA Methylation Bisulfite Kit | 12223ES | |
甲基化轉(zhuǎn)化酶原料 | Recombinant Ten-Eleven Translocase 2.0(eTET2.0, with buffer) | 12212ES |
T4 Phage β-glucosyltransferase (T4-BGT) (300 U/μL) | 14552ES | |
14553 Recombinant APOBEC3A (A3A) Protein | 14553ES | |
Recombinant Ten-Eleven Translocase (TET) | 14554ES | |
rRNA去除 | Hieff NGS® MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS)（Cat#12257） | 12257ES |
珠蛋白R(shí)NA去除 | Globin mRNA Depletion Probe(Human)（Cat# 12806） | 12606ES |
文庫(kù)建庫(kù)
產(chǎn)品應(yīng)用 | 產(chǎn)品名稱(chēng) | 產(chǎn)品編號(hào) |
機(jī)械法建庫(kù) | Hieff NGS® DNA Library Prep Kit 全能型DNA建庫(kù)試劑盒 | 13577ES |
FFPE 修復(fù)試劑 | Hieff NGS® FFPE DNA Repair Reagent | 12606ES |
酶切法建庫(kù) | Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3一步法DNA建庫(kù)試劑盒V3 | 12194ES |
多重?cái)U(kuò)增建庫(kù) | 2×Hieff® C2P4 Blood Direct Multiplex PCR Master Mix | 13606ES |
RNA建庫(kù) | Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit | 12308ES |
甲基化建庫(kù) | Hieff NGS® Methyl-seq DNA library Prep kit for Illumina® V2 | 12221ES |
Hieff NGS® dsDNA Methyl Library Prep Kit for Illumina® | 12214ES |
