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2023年11月16日,Vertex Pharmaceuticals和CRISPR Therapeutics共同宣布基因編輯療法產(chǎn)品CASGEVY™(Exagaglogene autotemcel)獲英國藥品監(jiān)管機構(gòu)MHRA有條件批準上市,用于治療治療鐮狀細胞病(SCD)和輸血依賴性β-地中海貧血(TDT),是獲批上市的CRISPR基因編輯藥物,12月8日,美國食品和藥物管理局(FDA)也批準了該基因編輯治療藥物。這是基因編輯治療里程碑事件,代表著一項重大的科學進步可以讓數(shù)以萬計的患者受益。
圖1. CASGEVY™治療流程(Source:CRISPR Therapeutics)
CRISPR基因編輯療法
自2012年亮相以來,CRISPR技術(shù)已在基因功能研究、藥物靶點篩選、遺傳疾病治療、癌癥研究以及作物育種等多個領(lǐng)域取得突破性成果。其工作機制如下:
Cas蛋白(如常用的Cas9)在gRNA的引導下定位到目標DNA序列,隨后Cas9與DNA結(jié)合并切割其雙鏈,產(chǎn)生一個雙鏈斷裂(DSB)。細胞為了修復這一斷裂,將啟動自身的修復機制,如非同源末端連接(NHEJ)或同源重組修復(HDR)。通過這些修復過程,可以在目標DNA中引入特定的序列。
目前CRISPR技術(shù)能精確度對DNA進行修改,包括添加、刪除或替換特定基因片段,這一進步不僅使基因修復更加便捷和精準,也為基因治療指明了新的發(fā)展方向。基于CRISPR技術(shù)的基因治療主要分為體外和體內(nèi)兩種形式,下面將為大家詳細介紹。
圖2. 體外與體內(nèi)基因編輯療法[1]
體外基因編輯療法
體外CRISPR基因編輯療法主要包括從患者身上收集細胞、在體外進行進行CRISPR基因編輯、將編輯后的細胞移植回患者體內(nèi)等流程,上述介紹的CASGEVY™便是典型的體外CRISPR基因編輯療法。除了直接利用CRISPR技術(shù)糾正導致癌癥的基因突變外,該技術(shù)在癌癥治療領(lǐng)域的另一關(guān)鍵應用是免疫細胞的工程化改造,如創(chuàng)建嵌合抗原受體T細胞(CAR-T)、通用型CAR-T(UCAR-T)等抗癌免疫療法。
CAR-T療法是通過改造患者自體T細胞,使T細胞表面表達針對特定癌癥抗原的嵌合抗原受體(CAR),通過CAR特異性識別體內(nèi)腫瘤細胞,并釋放大量的多種效應因子,高效地殺滅腫瘤細胞。然而,CAR-T療法在實際應用中仍面臨一些挑戰(zhàn),包括較長的制備周期、自體T細胞質(zhì)量的不穩(wěn)定性以及相對較高的治療成本,這些因素限制了其更廣泛的應用。
圖3. CAR-T療法流程圖[2]
為了突破傳統(tǒng)CAR-T療法的限制,UCAR-T療法,即通用型CAR-T或異體CAR-T應運而生。這種療法使用健康捐獻者的T細胞作為原料,通過病毒載體等技術(shù)將CAR基因?qū)隩細胞,并運用基因編輯技術(shù)去除T細胞表面的TCR、HLA或CD52等分子,以預防供體T細胞引發(fā)的移植物抗宿主?。℅vHD)并降低患者對異體細胞的排異反應(HvGR)。經(jīng)過這一系列精細的改造和擴增過程,UCAR-T細胞被制備成可用于治療患者的成熟產(chǎn)品。
圖4. UCAR-T療法流程[3]
UCAR-T療法流程:
供者篩選
選擇健康供者進行T細胞的采集。
CAR的引入
利用病毒載體或非病毒方法將CAR基因轉(zhuǎn)入T細胞,使其能夠特異性識別腫瘤細胞表面的抗原。
基因編輯
使用CRISPR/Cas、TALENs或ZFNs等基因編輯技術(shù),敲除T細胞表面的TCR、HLA或其他可能導致免疫排斥的分子,以降低異體反應。
體外擴增
在實驗室條件下對改造后的T細胞進行大量擴增,以獲得足夠的細胞數(shù)量用于治療。
質(zhì)量控制
對擴增后的UCAR-T細胞進行嚴格的質(zhì)量檢測,包括細胞活性、純度、無菌性等。
患者篩選和準備
確定患者是否適合接受UCAR-T治療,并進行一些預處理,以減少宿主對UCAR-T的排斥。
細胞輸注
將UCAR-T細胞通過靜脈輸注到患者體內(nèi)。
CRISPR基因編輯的體外療法涉及從患者體內(nèi)提取細胞,在實驗室環(huán)境中進行基因修改,然后將經(jīng)過編輯的細胞重新輸回患者等過程。這種方法適用于某些關(guān)鍵類型的細胞,如造血干細胞(HSC),但并不適用于所有種類的細胞。另一種基因編輯療法是直接在體內(nèi)進行的基因編輯,無需細胞提取和體外操作的步驟,可直接在患者的體內(nèi)進行基因編輯。這種方法易于批量生產(chǎn),給藥方式簡單,能顯著降低治療成本,還能為難以進行細胞提取或體外培養(yǎng)的疾病提供治療可能。
體內(nèi)CRISPR基因編輯療法
體內(nèi)基因編輯療法主要通過將基因編輯工具直接輸送至患者體內(nèi),在體內(nèi)環(huán)境中對引發(fā)疾病的特定基因進行精確且有效的修改。目前已用于體內(nèi)基因編輯治療的基因編輯工具有3類:核酸酶(Nucleases)、堿基編輯器(Base editors)及先導編輯器(Prime editors)。
圖5. 體內(nèi)基因編輯療法原理圖[4]
在哺乳動物細胞中,通常利用核酸酶在基因組DNA的特定位置引入DSB實現(xiàn)有效的基因編輯,其中,CRISPR-Cas核酸酶系統(tǒng)因其高效性和精確性而成為創(chuàng)建定向DSB廣泛的應用工具。CRISPR-Cas核酸酶系統(tǒng)體內(nèi)基因編輯流程如下:
gRNA設(shè)計及合成
設(shè)計特異性的導向RNA(gRNA)以靶向特定的DNA序列。
Cas蛋白遞送形式選擇
選擇合適的基因編輯形式,如質(zhì)粒DNA(pDNA)、mRNA或Cas核糖核蛋白(RNP)。
遞送系統(tǒng)的選擇與優(yōu)化
選擇合適的遞送系統(tǒng),如腺相關(guān)病毒(AAV)、脂質(zhì)納米顆粒(LNP)、病毒樣顆粒(VLP)等。
體內(nèi)送達
將基因編輯復合體通過靜脈注射、局部注射或其他方式遞送到患者體內(nèi)。
基因編輯
在目標細胞內(nèi),gRNA引導Cas蛋白識別并結(jié)合到目標DNA序列。Cas蛋白在目標位點造成DNA雙鏈斷裂(DSB)。
DNA修復
細胞通過自身的DNA修復機制,對斷裂的DNA進行修復。
監(jiān)測與評估
監(jiān)測基因編輯效果,評估脫靶效應和治療效果。通過生物標志物和臨床指標評估安全性和有效性。
圖6. 核酸酶作用原理圖[1]
來源于化膿性鏈球菌(Streptococcus pyogenes)的SpCas9蛋白是目前最為常用的一種Cas蛋白,然而,由于SpCas9潛在的脫靶效應和尺寸限制等問題,研究人員持續(xù)探索其他類型的Cas蛋白,如Cas12和Cas13,以期找到更小、更精確的Cas蛋白。同時,通過蛋白質(zhì)工程技術(shù)對Cas蛋白進行改造也是當前研究的重點之一。這些改造旨在提高基因編輯的效率、減少脫靶率并優(yōu)化編輯窗口,從而進一步擴展CRISPR技術(shù)在基因治療等領(lǐng)域的應用潛力。
目前CRISPR基因編輯技術(shù)仍處于高速發(fā)展階段,整個行業(yè)尚未成熟,隨著技術(shù)的不斷進步,預計會有更多的遞送技術(shù)得到改進,新的傳遞工具也將誕生,從而進一步提高治療的安全性和效果。體外CRISPR基因編輯療法已上市,相信體內(nèi)療法也會在不久的將來問世。
基因編輯相關(guān)產(chǎn)品
編輯類型 | 產(chǎn)品分類 | 產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品貨號 |
體外編輯(研究級) | Cas9蛋白 | Cas9 Nuclease | 14701ES |
Cas12a蛋白 | ArCas12a Nuclease | 14702ES | |
Cas12b蛋白 | AapCas12b Nuclease | 14808ES | |
sgRNA合成 | Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit | 11355ES | |
表達鑒定 | Cas9(CRISPR Associated Protein 9) ELISA Kit | 99401ES | |
體內(nèi)編輯 (GMP級) | 內(nèi)切酶 | BspQI GMP-grade (10 U/μL) | 10664ES |
Bsa I GMP-grade (20 U/μL) | 10661ES | ||
T7 RNA Polymerase | T7 RNA Polymerase GMP-grade (50 U/μL) | 10624ES | |
無機焦磷酸酶 | Pyrophosphatase,Inorganic GMP-grade | 10620ES | |
RNase抑制劑 | Murine RNase inhibitor GMP-grade | 10621ES | |
牛痘病毒加帽酶 | mRNA Vaccinia Capping Enzyme GMP-grade | 10614ES | |
Cap2氧甲基轉(zhuǎn)移酶 | mRNA Cap 2'-O-Methyltransferase GMP-grade | 10612ES |
參考文獻:
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