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背景介紹
隨著生物醫(yī)學(xué)的發(fā)展,DNA甲基化(DNA methylation)標(biāo)志物在癌癥診斷、治療選擇及預(yù)后評(píng)估中的重要性日益凸顯。在現(xiàn)代腫瘤治療領(lǐng)域,腫瘤 DNA 甲基化標(biāo)志物作為一種重要的生物標(biāo)志物,在癌癥的早期診斷、治療選擇及預(yù)后評(píng)估中扮演著越來(lái)越關(guān)鍵的角色。
圖1.正常細(xì)胞與腫瘤細(xì)胞DNA甲基化的狀態(tài)
DNA 甲基化是一種 DNA 的共價(jià)修飾,具體是指DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶(DNA methyltransferases,DNMTs)將甲基加到 DNA CpG 序列中胞嘧啶的 5'碳位,形成 5?甲基胞嘧啶的過(guò)程。成簇的 CpG被稱為 CpG島(CpG islands,CGIs),主要位于結(jié)構(gòu)基因的啟動(dòng)子和第一外顯子區(qū)域。DNA 甲基化標(biāo)志物是癌細(xì)胞中的 DNA異常甲基化改變,這種異常甲基化貫穿于癌癥發(fā)生和發(fā)展的全過(guò)程。
腫瘤DNA甲基化標(biāo)志物檢測(cè)及臨床應(yīng)用專家共識(shí)(2024版)指出:與傳統(tǒng)的腫瘤標(biāo)志物相比,DNA甲基化標(biāo)志物具有更早期、更無(wú)創(chuàng)、更精準(zhǔn)等優(yōu)點(diǎn)。因此,可以通過(guò)非侵入性方式獲得的痰液、血漿、血清或尿液等樣本進(jìn)行 DNA 甲基化標(biāo)志物檢測(cè)。一些DNA甲基化異常發(fā)生在腫瘤形成的初始階段,通過(guò)檢測(cè)與腫瘤發(fā)展相關(guān)的甲基化標(biāo)志物,可以輔助癌癥早期診斷、評(píng)估進(jìn)展風(fēng)險(xiǎn)。DNA 甲基化標(biāo)志物甲基化水平的增加或降低與腫瘤預(yù)后密切相關(guān),可用于治療或性手術(shù)后評(píng)估腫瘤微小殘留病灶(MRD)和監(jiān)測(cè)復(fù)發(fā)。此外,DNA甲基化標(biāo)志物還可作為化療敏感性的標(biāo)志,某些特定基因的甲基化可能預(yù)示著癌癥對(duì)治療的反應(yīng),可用于判斷化療藥物的療效,以更好地指導(dǎo)治療方案。
DNA甲基化標(biāo)志物檢測(cè)技術(shù)方法
圖2.DNA甲基化標(biāo)志物檢測(cè)技術(shù)方法
甲基化建庫(kù)試劑盒搭配MGI測(cè)序接頭一直以來(lái)為技術(shù)難點(diǎn),MGI 測(cè)序接頭與 Illumina Y 字型接頭類型存在很大的差異,MGI 測(cè)序接頭 Linear adapter 與 Bubble adapter 長(zhǎng)度不同但兩端互補(bǔ)配對(duì),因此會(huì)產(chǎn)生小泡狀結(jié)構(gòu),小泡狀結(jié)構(gòu)會(huì)降低與單鏈DNA的連接效率,影響文庫(kù)產(chǎn)出和檢測(cè)的靈敏度。
翌圣生物甲基化研發(fā)團(tuán)隊(duì)基于創(chuàng)新的MGI接頭設(shè)計(jì)方式和優(yōu)化接頭連接體系,開發(fā)出DNA甲基化MGI平臺(tái)文庫(kù)構(gòu)建試劑盒,性能媲美于Illumina平臺(tái)文庫(kù)構(gòu)建試劑盒,擁有優(yōu)異的接頭連接效率,較高的文庫(kù)產(chǎn)出,滿足微量cfDNA樣本的甲基化建庫(kù)需求。
Hieff NGS® Methyl-seq DNA library Prep kit for MGI(Cat#12226ES)
產(chǎn)品簡(jiǎn)介
Hieff NGS® Methyl-seq DNA Library Prep Kit for MGI 是針對(duì) MGI 測(cè)序平臺(tái)專業(yè)開發(fā)設(shè)計(jì)的新一代 DNA 甲基化建庫(kù)試劑盒,可以滿足甲基化轉(zhuǎn)化后10 pg~250 ng DNA 樣本建庫(kù)。該試劑盒可兼容短至 40 bp 的 DNA 樣本,適應(yīng)于先轉(zhuǎn)化后建庫(kù)。
產(chǎn)品亮點(diǎn)
投入量低:可滿足10 pg~250 ng起始量的樣本建庫(kù)
數(shù)據(jù)質(zhì)量佳:不同樣本類型及不同投入量條件下均表現(xiàn)出優(yōu)異的數(shù)據(jù)質(zhì)量
操作簡(jiǎn)便:2小時(shí)左右可以完成建庫(kù)
產(chǎn)品性能
MGI平臺(tái)甲基化建庫(kù)試劑12226和Illumina平臺(tái)甲基化建庫(kù)試劑12221的性能相當(dāng),MGI平臺(tái)甲基化建庫(kù)試劑12226的dup率更低。
圖3.不同樣本投入量下的文庫(kù)產(chǎn)量和下機(jī)數(shù)據(jù)基本指標(biāo)
2、亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化和酶法轉(zhuǎn)化后,采用12226建庫(kù),不同樣本投入量下的文庫(kù)產(chǎn)量和下機(jī)數(shù)據(jù)基本指標(biāo)
相同的樣本投入量,酶法轉(zhuǎn)化搭配MGI平臺(tái)甲基化建庫(kù)試劑12226的文庫(kù)濃度和數(shù)據(jù)質(zhì)量更高,插入片段更長(zhǎng),文庫(kù)豐富度更高。
圖4.亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化和酶法轉(zhuǎn)化后的文庫(kù)產(chǎn)量和下機(jī)數(shù)據(jù)基本指標(biāo)
新品預(yù)告
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品貨號(hào) | 產(chǎn)品應(yīng)用 |
Hieff NGS® Methyl-seq DNA library Prep kit for MGI DNA 甲基化建庫(kù)MGI試劑盒 | 12226ES | 甲基化文庫(kù)構(gòu)建MGI平臺(tái) |
敲重點(diǎn):申請(qǐng)DNA 甲基化建庫(kù)MGI試劑盒試用裝,請(qǐng)聯(lián)系當(dāng)?shù)劁N售或技術(shù),數(shù)量有限,試用回饋數(shù)據(jù)有獎(jiǎng)。
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