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Endonuclease IV(核酸內(nèi)切酶IV)又稱為Nfo,是一種多功能的核酸內(nèi)切酶。它主要功能是識(shí)別DNA鏈中的脫嘌呤/脫嘧啶位點(diǎn)(AP位點(diǎn)),通過切割A(yù)P位點(diǎn)5'端的磷酸二酯鍵,產(chǎn)生3'-羥基和5'-脫氧核糖磷酸末端(dRP)(圖1)。此外,該酶還具有在DNA的3′末端釋放磷酸甘油醛、完整的脫氧核糖 5′-磷酸和磷酸的3'-二酯酶活性;以及在DNA鏈上從3'—5'方向移除核苷酸的3'-5'外切酶活性。
圖1. Endonuclease IV反應(yīng)原理示意圖
Endonuclease IV可用于:
FFPE樣本修復(fù)中水解AP位點(diǎn)行成切刻,為DNA修復(fù)提供關(guān)鍵起始位點(diǎn);
單細(xì)胞凝膠電泳(彗星試驗(yàn));
堿洗脫、堿解旋等。
翌圣酶研發(fā)團(tuán)隊(duì)潛心研發(fā),成功推出市售Endonuclease IV(Cat#14543ES),翌圣Endonuclease IV不含非特異性DNA酶殘留,大腸桿菌宿主gDNA殘留<0.05 copies/10U。
不含非特異性DNase殘留
20 μL反應(yīng)體系中,加入不同批次的100 U Endonuclease IV和 0.5 μg λDNA-HindⅢ digest,37℃孵育16 h,瓊脂糖凝膠電泳DNA譜帶不發(fā)生變化,表明翌圣Endonuclease IV不含非特異性DNase殘留。
圖2. 非特異性DNase殘留
宿主(E.coli)gDNA殘留<0.05 copies/10U
對不同批次的翌圣Endonuclease IV進(jìn)行宿主(E.coli)基因組DNA殘留檢測,結(jié)果顯示翌圣Endonuclease IV的宿主gDNA殘留<0.05 copies/10 U。
圖3. 宿主gDNA殘留