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干貨 | 基因編輯探秘系列之產(chǎn)品選購(gòu)指南

2024-12-17  閱讀(75)

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自2012年亮相以來(lái),CRISPR技術(shù)已在基因功能研究、藥物靶點(diǎn)篩選、遺傳疾病治療、癌癥研究以及作物育種等多個(gè)領(lǐng)域取得突破性成果。其工作機(jī)制如下

 

Cas蛋白(例如廣泛使用的Cas9)在向?qū)NA(gRNA)的引導(dǎo)下能夠精準(zhǔn)地定位到特定的DNA序列上。一旦到達(dá)目標(biāo)位置,Cas9會(huì)與DNA結(jié)合并切割其雙鏈,從而產(chǎn)生一個(gè)雙鏈斷裂(DSB)。面對(duì)這樣的損傷,細(xì)胞會(huì)激活自身的修復(fù)機(jī)制來(lái)應(yīng)對(duì),主要包括非同源末端連接(NHEJ)或同源重組修復(fù)(HDR)兩種方式。利用這些天然存在的DNA修復(fù)過(guò)程,科學(xué)家可以在目標(biāo)DNA位點(diǎn)引入所需的特定序列變化,實(shí)現(xiàn)對(duì)基因組的精確編輯。

 

目前CRISPR技術(shù)能的精確度對(duì)DNA進(jìn)行修改,包括添加、刪除或替換特定基因片段,這一進(jìn)步不僅使基因修復(fù)更加便捷和精準(zhǔn),也為基因治療、生物育種、合成生物學(xué)等指明了新的發(fā)展方向。

 

 

 

翌圣基因編輯解決方案

 


 

針對(duì)上述基因編輯技術(shù)流程,翌圣生物可提供高品質(zhì)Cas蛋白等相關(guān)產(chǎn)品,以及蛋白改造、GMP規(guī)?;a(chǎn)定制服務(wù)。這些產(chǎn)品覆蓋了從設(shè)計(jì)到實(shí)施的整個(gè)過(guò)程,旨在幫助研究人員更高效、更準(zhǔn)確地完成基因編輯實(shí)驗(yàn)。接下來(lái),小編將選取部分重點(diǎn)產(chǎn)品給大家進(jìn)行展示。

 

 

 

sgRNA合成試劑盒

 

Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit (Cat#11355ES)


該試劑盒的應(yīng)用極為簡(jiǎn)便,用戶(hù)只需設(shè)計(jì)一條特定的上游引物,并結(jié)合試劑盒提供的其他試劑,即可在短短4小時(shí)內(nèi)合成出>20 μg高品質(zhì)的sgRNA。所產(chǎn)生的sgRNA具備高產(chǎn)量、高純度和高活性等優(yōu)勢(shì),在基因編輯過(guò)程中能顯著提升編輯效率,并大幅降低脫靶現(xiàn)象的發(fā)生幾率,確保基因編輯工作以高效率和高準(zhǔn)確性進(jìn)行。


 

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性能展示

 
  • 高合成產(chǎn)量:單管反應(yīng)4小時(shí),sgRNA產(chǎn)量>20 μg

圖1. 不同時(shí)間的sgRNA的合成量

 

  • 適用范圍廣:不同種類(lèi)的sgRNA均可獲得高產(chǎn)量

圖2. 不同序列的sgRNA的合成產(chǎn)量

 

  • 高純度:合成的sgRNA條帶單一

圖3. 合成的sgRNA的純度(安捷倫2100測(cè)定)

 

  • 高活性:合成的sgRNA可有效引導(dǎo)Cas9切割靶標(biāo)DNA

圖4. sgRNA的剪切效率效果圖

 

 

 

Cas9蛋白

 

Cas9 Nuclease (Cat#14701ES)

Cas9 Nuclease來(lái)源于野生型釀膿鏈球菌S. pyogenes,是依賴(lài)RNA介導(dǎo)的內(nèi)切核酸酶,可以特異地切割雙鏈DNA(在DNA PAM存在的情況下,也可以切割單鏈DNA或單鏈RNA)。Cas9切割位點(diǎn)位于目標(biāo)序列(target sequence)內(nèi),離PAM(NGG)區(qū)3個(gè)堿基。本產(chǎn)品經(jīng)過(guò)密碼子優(yōu)化及核定位信號(hào)(NLS)設(shè)計(jì),由大腸桿菌重組表達(dá)而來(lái),編輯效率高,可用于細(xì)胞(造血干細(xì)胞、T細(xì)胞等)的基因修飾,也可用于分子診斷,檢測(cè)病原體等。

 

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性能展示

 

A:體外切割測(cè)試:3批次體外切割活性均達(dá)98%以上。

B:體內(nèi)基因敲除,敲除效率與進(jìn)口品牌一致。

圖5. Cas9 Nuclease體外切割活性及基因敲除效率結(jié)果

 

 

 

Cas9蛋白

 

NLS-Cas9-EGFP Nuclease (Cat#11364ES)

NLS-Cas9-EGFP在Cas9核酸酶的基礎(chǔ)上進(jìn)行改造,它在N端包含一個(gè)核定位信號(hào)NLS,在C端包含一個(gè)EGFP和一個(gè)6X (His)序列,Cas9 RNP復(fù)合物在進(jìn)入細(xì)胞后可立即定位到細(xì)胞核。此外,與其他系統(tǒng)相比,EGFP標(biāo)簽可作為追蹤或分類(lèi)轉(zhuǎn)染細(xì)胞的報(bào)告器,通過(guò)熒光激活細(xì)胞分選(FACS)富集所需基因組編輯的細(xì)胞群。它大大降低了在基因組編輯應(yīng)用中與單細(xì)胞克隆和基因分型相關(guān)的人工和成本。

 

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性能展示

 

A:細(xì)胞轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn):電穿孔后12 h,在熒光顯微鏡下觀察細(xì)胞。

B:切割效率檢測(cè):線性化質(zhì)粒的消化效率大于90%。

注:20 μL的反應(yīng)體系,在含有線性化質(zhì)粒、gRNA 和Cas9的1×Cas9核酸酶反應(yīng)緩沖液中在37°C下反應(yīng)1小時(shí),在瓊脂糖凝膠電泳測(cè)定結(jié)果顯示,線性化質(zhì)粒的消化效率大于90%。

 

圖6. NLS-Cas9-EGFP Nuclease細(xì)胞轉(zhuǎn)染及體外切割結(jié)果

 

 

 

Cas 12a蛋白

 

ArCas12a Nuclease (Cat#14702ES)

ArCas12a核酸內(nèi)切酶,源自Agathobacter rectalis細(xì)菌的CRISPR系統(tǒng),別名Cpf1,是一個(gè)包含1263個(gè)氨基酸的單體蛋白。Cas12a缺乏HNH結(jié)構(gòu)域,可單獨(dú)利用其RuvC結(jié)構(gòu)域在CRISPR RNA(crRNA)引導(dǎo)下識(shí)別位于靶標(biāo)核酸5’端富含胸腺嘧啶(T)的PAM區(qū)而啟動(dòng)對(duì)靶標(biāo)DNA的切割,已成功用于許多哺乳動(dòng)物和植物的基因組編輯。此外Cas12a還具有反式切割活性,可不加選擇地切割反應(yīng)體系中的非靶標(biāo)單鏈DNA。與LbCas12a/AsCas12a相比,ArCas12a具有更高的溫度適應(yīng)性(25-55℃),可適用于基因組編輯及核酸檢測(cè)等。

 

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性能展示

 
  • 雙鏈DNA高效體外切割

圖7. ArCas12a順式切割活性檢測(cè) M:Marker;C:模板雙鏈DNA。

注:在crRNA的引導(dǎo)下可高效的切割雙鏈DNA(600 bp)產(chǎn)生兩段切割產(chǎn)物(200 bp+400 bp)

 

  • 反式切割活性強(qiáng),可用于核酸檢測(cè)

圖8. ArCas12a反式切割活性檢測(cè)

注:以雙鏈DNA模板為靶標(biāo),加入ArCas12a、crRNA(存在與模板DNA序列互補(bǔ)的spacer區(qū))及單鏈DNA報(bào)告探針(含有熒光報(bào)告基團(tuán))進(jìn)行體外切割,當(dāng)ArCas12a與crRNA及靶標(biāo)DNA形成復(fù)合體后會(huì)激活反式切割活性,切割單鏈DNA報(bào)告探針,從而發(fā)出熒光。結(jié)果顯示,翌圣ArCas12a與crRNA及模板DNA形成復(fù)合體后具有反式切割活性,可剪切單鏈DNA。

 

 

 

Cas 12b蛋白

 

AapCas12b Nuclease (Cat#14808ES)

AapCas12b核酸酶(又名C2c1)是由tracrRNA:crRNA(或sgRNA)介導(dǎo)的DNA核酸內(nèi)切酶,來(lái)源于嗜酸耐熱菌Alicyclobacillus acidophilus,在靶標(biāo)雙鏈DNA存在PAM(TTN)序列的情況下,特異地剪切靶標(biāo)雙鏈DNA,使DNA雙鏈斷裂并生成粘性末端。AapCas12b可不依賴(lài)PAM序列特異地剪切單鏈DNA靶標(biāo)。雙鏈或單鏈DNA靶標(biāo)均能激活A(yù)apCas12b的反式剪切活性(即旁路剪切活性/附屬剪切活性),即當(dāng)AapCas12b酶與sgRNA、靶標(biāo)DNA結(jié)合形成三元復(fù)合物后,便會(huì)被激活針對(duì)非特異序列ssDNA的反式剪切活性,將體系中的任意序列ssDNA切碎。AapCas12b最佳剪切反應(yīng)溫度為60℃,比AacCas12b更耐高溫,適用于與LAMP聯(lián)用,開(kāi)發(fā)恒溫?cái)U(kuò)增/CRISPR-Cas檢測(cè)體系。

 

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性能展示

 
  • 順勢(shì)切割活性:效果媲美進(jìn)口品牌T*

圖9. AapCas12b Nuclease (10 μM) (Cat#14808ES)順式切割活性驗(yàn)證

注:在20 μL的反應(yīng)體系,含有帶PMA序列的雙鏈Target DNA、sgRNA、Cas12b和1×reaction buffer,在60°C下反應(yīng)30 min,85°C下滅活5 min,在瓊脂糖凝膠電泳測(cè)定結(jié)果顯示,三批次AapCas12b Nuclease (10 μM) (Cat#14808ES)均能有效切割雙鏈Target DNA,切割效果與進(jìn)口品牌T*相當(dāng)。

 

  • 反式切割活性:能有效切割體系中的ssDNA

圖10. AapCas12b Nuclease (10 μM) (Cat#14808ES)反式切割活性驗(yàn)證

注:在20 μL的反應(yīng)體系,含有帶PMA序列的雙鏈Target DNA、sgRNA、Cas12b、Report ssDNA熒光探針和1×reaction buffer,在60℃反應(yīng)1h,每30 sec采集一次熒光信號(hào),結(jié)果顯示在Target DNA、sgRNA、Cas12b共同存在的情況下,Report ssDNA熒光探針能被切割,從而釋放熒光信號(hào)。

 

當(dāng)前,CRISPR基因編輯技術(shù)正處于快速發(fā)展的時(shí)期,整個(gè)領(lǐng)域仍在不斷成熟和完善中。隨著科學(xué)研究和技術(shù)應(yīng)用的持續(xù)推進(jìn),我們有理由相信未來(lái)將涌現(xiàn)出更多創(chuàng)新性的基因編輯工具,這些新工具將進(jìn)一步拓寬該技術(shù)的應(yīng)用場(chǎng)景與潛力。

 

如果您對(duì)基因編輯有任何需求或興趣,歡迎隨時(shí)聯(lián)系我們。無(wú)論是在基礎(chǔ)研究、藥物開(kāi)發(fā)、農(nóng)業(yè)生物技術(shù)、合成生物學(xué)等領(lǐng)域,我們都致力于為您提供的技術(shù)支持和服務(wù),共同探索基因編輯帶來(lái)的無(wú)限可能

 

 

 

產(chǎn)品推薦

 

產(chǎn)品應(yīng)用

產(chǎn)品定位

產(chǎn)品名稱(chēng)

產(chǎn)品貨號(hào)

通用型

NLS的SpCas9

Cas9 Nuclease

14701ES

熒光觀察/流式分選

EGFP熒光標(biāo)簽的SpCas9

NLS-Cas9-EGFP Nuclease

11364ES

基因調(diào)控

無(wú)剪切酶活性的Cas9

dCas9 Nuclease

11351ES

小分子量遞送

Cas12a

ArCas12a Nuclease

14702ES

Cas12b

AapCas12b Nuclease

14808ES

sgRNA制備

sgRNA合成

Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit

11355ES

sgRNA純化

Hieff NGS® RNA Cleaner

12602ES



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