翌圣生物科技(上海)股份有限公司

初級會員·13年

聯(lián)系電話

400-6111-883

您現(xiàn)在的位置: 首頁> 技術(shù)文章 > 純干貨!顯色示蹤熒光定量相對定量操作解析
初級會員·13年
聯(lián)人:
曹女士
話:
400-6111-883
機(jī):
后:
4006-111-883
真:
86-21-34615995
址:
上海市浦東新區(qū)天雄路166弄1號3樓
網(wǎng)址:
www.yeasen.com

掃一掃訪問手機(jī)商鋪

純干貨!顯色示蹤熒光定量相對定量操作解析

2025-3-3  閱讀(86)

分享:

實(shí)驗(yàn)材料:

1.cDNA樣本:通過上游反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)得到的cDNA。
2.熒光定量試劑:Hieff UNICON® ColorGPS qPCR SYBR Green Master Mix (No/Low/High Rox)。
3.其他試劑:RNase-free H2O、相關(guān)基因上下游引物(儲存濃度10 μM)。
4.設(shè)備與耗材:移液器、qPCR儀、冰盒、離心機(jī)、RNase-free八連排、RNase-free離心管。


實(shí)驗(yàn)步驟:

01

試劑&樣本前期準(zhǔn)備

試劑解凍和混勻

  • 從冰箱中取出:

    從-20℃冰箱中取出含酶試劑,立即放入冰盒中(冰上操作);

    避免將試劑直接放在室溫下解凍,以免溫度波動影響酶的活性。

  • 緩慢解凍:

    讓試劑在冰上自然解凍,通常需要5-10分鐘;

    如果需要快速解凍,可以將試劑握在手中輕輕搖晃,但不要過度加熱。

  • 輕輕顛倒混勻:

    解凍后,將試劑管輕輕上下顛倒幾次,使試劑充分混勻;

    避免劇烈震蕩或渦旋混勻,以免破壞酶的活性。

  • 低速離心:

    將試劑管短暫離心(5-10秒,1000 rpm左右),使管壁和管蓋上的液體集中到管底;

    離心后再次輕輕混勻,確保試劑均勻分布;

    混勻后的試劑應(yīng)繼續(xù)放在冰上,避免長時間暴露在室溫下。

Tips:混勻時盡量避免產(chǎn)生氣泡,氣泡可能會影響酶的活性或?qū)嶒?yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。


02

模板稀釋(若需要)

稀釋步驟

  • 若需追蹤模板,按以下步驟稀釋:

    取1 μL 10×Dilution Buffer + 9 μL無菌超純水 → 配制1×Dilution Buffer;

    用1×Dilution Buffer稀釋cDNA至目標(biāo)濃度(建議稀釋至Ct值20-30的范圍內(nèi))。

  • 若無需追蹤模板,直接用無菌超純水稀釋cDNA或者直接使用cDNA原液。


03

熒光定量PCR反應(yīng)體系配制

常見的熒光定量儀器為96孔反應(yīng),大體分為12列×8行。舉例說明:

純干貨!顯色示蹤熒光定量相對定量操作解析

備注說明:

  • 相對定量分析基因表達(dá)情況時,為排除樣本和操作的影響,對數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化,需要有內(nèi)參基因,例如GAPDH、β-actin等等。

  • 技術(shù)重復(fù)通常建議設(shè)置3孔,為保證后續(xù)取平均值或剔除異常值。當(dāng)然根據(jù)自己的需求進(jìn)行調(diào)整,設(shè)置2孔重復(fù)或者4孔重復(fù)均可。

  • 依據(jù)MIQE準(zhǔn)則,NTC(陰性對照)建議設(shè)置,一方面用于污染風(fēng)險判斷,另一方面其也是一套實(shí)時熒光定量 PCR (qPCR) 實(shí)驗(yàn)設(shè)計及數(shù)據(jù)報告實(shí)踐指南以及與發(fā)文共享實(shí)驗(yàn)信息的標(biāo)準(zhǔn)。


熒光定量PCR體系(大體系配制減少誤差)

大體系配制

純干貨!顯色示蹤熒光定量相對定量操作解析


以上述投入2μL cDNA模板檢測不同樣本基因1為例:

純干貨!顯色示蹤熒光定量相對定量操作解析

將上述溶液依次加好后,將管蓋蓋嚴(yán),用手輕彈管壁,使各組分充分混勻,再放入小型離心機(jī),短暫離心1-2s,再次輕彈管壁(防止有氣泡),瞬間離心(防止部分溶液沾到管壁上)并置于冰/冰板上。

備注:如使用顯蹤劑建議模板投入體積控制在2-5 μL,以保證顯蹤效果,如使用cDNA母液建議投入體積控制在2 μL(反應(yīng)體系的1/10)以內(nèi)防止影響擴(kuò)增效果。


上樣體系配置
  • 按照上機(jī)儀器選取對應(yīng)耗材(八聯(lián)排或96孔板)。

  • 在對應(yīng)耗材中按照布板依次分裝18μL/孔步驟1)配置的大體系Mix。

  • 在每個孔中加入2 μL對應(yīng)模板。

純干貨!顯色示蹤熒光定量相對定量操作解析

純干貨!顯色示蹤熒光定量相對定量操作解析

移液槍加樣Tips(吸一排二):


  • 吸取液體:緩慢、平穩(wěn)地按下按鈕至第一檔(不是按到底),然后將吸頭浸入液面下,然后緩慢、平穩(wěn)地松開檔位至原位來吸取液體。注意不要讓吸頭接觸到容器的邊緣或底部,以防止污染。

  • 液體排出:將吸頭對準(zhǔn)接收容器,然后緩慢、平穩(wěn)地按下按鈕至第二檔(按到底)以排出液體。確保所有的液體都被排出。

純干貨!顯色示蹤熒光定量相對定量操作解析

完成加樣后,將管蓋蓋嚴(yán),用手輕彈管壁,使各組分充分混勻,再放入小型離心機(jī),短暫離心1-2s,再次輕彈管壁(防止有氣泡),瞬間離心(防止部分溶液沾到管壁上)確保無氣泡后置于潔凈的96孔PCR管架。

純干貨!顯色示蹤熒光定量相對定量操作解析

備注:注意觀察每一槍是否吸到了氣泡,若出現(xiàn)氣泡吸取則會導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)出現(xiàn)較大偏差。


04

熒光定量PCR上機(jī)運(yùn)行

上機(jī)前,仔細(xì)檢查管子,確保正上方管蓋、管身沒有記號筆染料,管內(nèi)無氣泡、管壁無液體。


若采用常規(guī)程序,則進(jìn)行以下設(shè)置:

純干貨!顯色示蹤熒光定量相對定量操作解析

備注:
不同熒光定量qPCR試劑核心的酶和Buffer組成都存在差異,對應(yīng)說明書上的程序是該產(chǎn)品大多數(shù)情況下的最適反應(yīng)條件,建議按照說明書的程序進(jìn)行儀器設(shè)置,減少因用其他程序帶來的數(shù)據(jù)偏差;
熔解曲線程序可選用儀器默認(rèn)程序。


純干貨!顯色示蹤熒光定量相對定量操作解析

備注:以ABI Q5常規(guī)程序?yàn)槔?,在進(jìn)行程序設(shè)置時,確保在退火/延伸階段和熔解曲線的升溫階段打開數(shù)據(jù)信號收集開關(guān)。


若采用快速程序,需確認(rèn)儀器本身是否可以快速升降溫,運(yùn)行快速程序。以下以ABI Q5為例:

純干貨!顯色示蹤熒光定量相對定量操作解析


05

結(jié)果判定

  • 觀察熔解曲線峰是否單一。

  • 初步判斷復(fù)孔間Ct值差距是否<0.5,或者進(jìn)一步計算復(fù)孔間CT值STD是否<0.2。

  • 內(nèi)參基因Ct值盡量在14-25之內(nèi),不要過小也不要過大。


06

數(shù)據(jù)分析

下機(jī)得到的Excel數(shù)據(jù)處理如下:

純干貨!顯色示蹤熒光定量相對定量操作解析

圖示說明:

④:對照組校正后的數(shù)值;

③/④:每個小組校正后的數(shù)值比上對照組校正后的數(shù)值;

意圖表上的數(shù)據(jù)在excel中采用了保留2位小數(shù)的形式,實(shí)際計算時不可忽略小數(shù)點(diǎn)后的所有數(shù)字,減少按數(shù)字的動作,活用Excel。


07

注意事項

1、引物設(shè)計好壞對于最終實(shí)驗(yàn)的成功和實(shí)驗(yàn)結(jié)果都會有一定的影響,可參考干貨軟文,解鎖更多引物設(shè)計寶藏。


2、長時間放置的引物,建議嘗試先用預(yù)實(shí)驗(yàn)(跟著其他實(shí)驗(yàn)或人帶上幾孔測測看),避免直接進(jìn)行大規(guī)模正式實(shí)驗(yàn),從而造成不必要的風(fēng)險損失。


產(chǎn)品特別推薦:

方法

分類

產(chǎn)品名稱

貨號

RNA提取

同Trizol提取

TRIeasy™ Total RNA Extraction Reagent

10606ES

免氯仿升級版

TRIeasy™ Total RNA Extraction Reagent(Tcm Free)

19202ES

動物組織/細(xì)胞總RNA提取,避開有毒試劑,最快15 min完成

MolPure® Cell/Tissue Total RNA Kit細(xì)胞/組織總RNA提取試劑盒

19221ES

反轉(zhuǎn)錄

5 min高效高產(chǎn)反轉(zhuǎn)

預(yù)混液(含gDNA去除)

Hifair® AdvanceFast 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR (DNA digester plus)

11155ES

5 min一步gDNA去除&反轉(zhuǎn)錄預(yù)混液(下游應(yīng)用qPCR)

Hifair® AdvanceFast One-step RT-gDNA Digestion SuperMix for qPCR

11151ES

5 min快速反轉(zhuǎn),最長可滿足14 kb cDNA合成,含gDNA去除(下游應(yīng)用PCR/qPCR)

Hifair® AdvanceFast 1st Strand cDNA Synthesis Kit

11149/11150ES

高質(zhì)量一鏈cDNA合成預(yù)混液,含gDNA去除(下游應(yīng)用qPCR)

Hifair® III 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR (gDNA digester plus)

11141ES

qPCR染料法

高靈敏顯色示蹤熒光定量預(yù)混液(染料法)

Hieff UNICON® ColorGPS qPCR SYBR Green Master Mix (No Rox)

11188ES

Hieff UNICON® ColorGPS qPCR SYBR Green Master Mix (Low Rox)

11189ES

Hieff UNICON® ColorGPS qPCR SYBR Green Master Mix (High Rox)

11190ES

高特異高熒光值定量預(yù)混液(染料法)

Hieff UNICON® Advanced qPCR SYBR Master Mix

11185ES

高靈敏通用型定量預(yù)混液(染料法)

Hieff UNICON® Universal Blue qPCR SYBR Master Mix

11184ES







會員登錄

×

請輸入賬號

請輸入密碼

=

請輸驗(yàn)證碼

收藏該商鋪

X
該信息已收藏!
標(biāo)簽:
保存成功

(空格分隔,最多3個,單個標(biāo)簽最多10個字符)

常用:

提示

X
您的留言已提交成功!我們將在第一時間回復(fù)您~
產(chǎn)品對比 二維碼

掃一掃訪問手機(jī)商鋪

對比框

在線留言