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關鍵詞:dsDNA、雙鏈DNA、dsDNA定量、熒光核酸染料、A260、DNA殘留
Picogreen dsDNA雙鏈DNA(dsDNA)定量檢測
檢測原理
Picogreen是一種極為靈敏的熒光核酸染料,常用于雙鏈DNA的定量檢測。歷來DNA濃度的測定在cDNA文庫的構建,DNA亞克隆、PCR產物的估測等領域中具有重要意義。疫苗等生物制品中殘留微量DNA的檢測更是直接關系到人類的健康。
Picogreen僅在與DNA雙鏈結合后才發(fā)出熒光,且所產生的熒光與DNA濃度呈正比,在存在ssDNA、RNA和單體核苷酸的條件下,可以選擇性地檢測低至25pg/ml的dsDNA。該分析在三個數(shù)量級范圍內呈線性,且?guī)缀鯚o序列依賴性,可以地測量多個來源的DNA,包括基因組DNA、病毒DNA、小量提取DNA或PCR擴增產物。可用熒光分光光度計或熒光酶標儀讀數(shù),Ex/Em=480nm/520nm。
產品優(yōu)勢
相比傳統(tǒng)的方法,如紫外吸光法(A260)、探針雜交法、Hoechst 33258染料法等,Picogreen dsDNA Quantitation Reagent定量具有以下優(yōu)勢:
①靈敏度高:數(shù)量級較UV吸光讀數(shù)更敏感,可節(jié)省寶貴的樣品;
②特異性強:在等摩爾的RNA存在的條件下,對dsDNA具有特異性;
③耐受性好:耐受較高濃度的鹽、尿素、乙醇、氯仿、去垢劑、蛋白或瓊脂糖,可以直接定量PCR擴增產物而無需從反應混合物中純化DNA。
④易于使用——只需在樣品中加入染料,等待5分鐘,然后讀數(shù)即可,且適用于96和384孔板;與大多數(shù)基于熒光的酶標儀和熒光計兼容。
⑤適用范圍廣:可適用于PCR的分析、芯片樣品、DNA損傷分析、酶活性分析、基因組DNA定量以及復雜混合物中dsDNA的檢測和病毒DNA定量等多種領域。
產品應用
測定微量的DNA殘留(如疫苗生產);對DNA樣品進行定量
運輸和保存方法
室溫運輸。4℃避光干燥保存,有效期6個月。
檢測步驟【以雙鏈DNA定量檢測試劑盒為例】
1、2μg/ml的Calf thymus DNA standard濃縮液的配制
用1×TE對Calf thymus DNA standard (100μg/ml)進行50倍稀釋,即向30μl Calf thymus DNA standard加入1.47ml 1×TE混勻即可。
2、標準曲線的制備
① 比色皿體系檢測(2ml)
a、按照表1 向一次性微量比色皿中加入TE和2μg/ml Calf thymus DNA standard,隨后加入1ml PicoGreen定量試劑,混勻后,于室溫避光孵育2-5min,并以1×TE緩沖液為blank?!咀ⅰ浚捍_信不要在樣品中引入氣泡,輕輕地彈微量檢測皿的外部,可以驅散氣泡。
表1 比色皿體系所需加入各組分量及標準品終濃度表
TE (μl) | 2μg/ml Calf thymus DNA standard (μl) | 稀釋的PicoGreen定量試劑 (μl) | Calf thymus DNA standard終濃度 |
0 | 1000 | 1000 | 1μg/ml |
900 | 100 | 1000 | 100ng/ml |
990 | 10 | 1000 | 10ng/ml |
999 | 1 | 1000 | 1ng/ml |
1000 | 0 | 1000 | blank |
b、于熒光儀中檢測各濃度熒光值,Ex/Em=480nm/520nm。
【注】:為了確保熒光讀數(shù)在熒光儀的檢測范圍內,應調節(jié)增益使含zui高DNA濃度的樣品熒光值與熒光儀的zui大值一致;為了減少光漂白,應保持所有樣品的檢測時間一致。
c、各濃度得到的熒光值減去空白對照熒光值,對DNA濃度和熒光值做標準曲線。
② 微孔板體系檢測(200μl)
a、按照表2 向96孔板中加入TE和2μg/ml Calf thymus DNA standard,隨后加入100μl PicoGreen定量試劑,混勻后,于室溫避光孵育2-5min,并以1×TE緩沖液為blank。【注】:確信不要在樣品中引入氣泡,輕輕地彈微量檢測皿的外部,可以驅散氣泡。
表2酶標板體系所需加入各組分量及標準品終濃度表
TE (μl) | 2μg/ml Calf thymus DNA standard (μl) | 稀釋的PicoGreen定量試劑 (μl) | Calf thymus DNA standard終濃度 |
0 | 100 | 100 | 1μg/ml |
90 | 10 | 100 | 100ng/ml |
99 | 1 | 100 | 10ng/ml |
99.9 | 0.1 | 100 | 1ng/ml |
100 | 0 | 100 | blank |
b、于熒光酶標儀中檢測各濃度熒光值,Ex/Em=480nm/520nm。
【注】:為了確保熒光讀數(shù)在熒光儀的檢測范圍內,應調節(jié)增益使含zui高DNA濃度的樣品熒光值與熒光儀的zui大值一致;為了減少光漂白,應保持所有樣品的檢測時間一致。
c、各濃度得到的熒光值減去空白對照熒光值,對DNA濃度和熒光值做標準曲線。
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