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類器官crispr-cas9基因編輯及慢病毒轉(zhuǎn)染實驗方法

閱讀:290        發(fā)布時間:2023-9-20

近幾年,類器官研究十分火熱,在信號通路機制,藥篩藥敏等研究中對類器官模型需求激增,其中利用 crispr-cas9基因編輯技術(shù)對類器官進(jìn)行敲低或敲減來造模是個不錯的實驗方法,今天小愛帶大家來了解 crispr-cas9基因編輯技術(shù)及慢病毒轉(zhuǎn)染方法。

 crispr基因編輯技術(shù)中有三個最為重要的組成部分:crRNA、sgRNA和Cas9蛋白。crRNA與Cas9蛋白形成復(fù)合物,sgRNA指引(crRNA/cas9)復(fù)合物靶向目的DNA區(qū)域定向切割DNA,從而達(dá)到基因編輯的目的。

 

圖1.  crispr-cas9基因編輯技術(shù)示意圖

 

 crispr-cas9基因編輯技術(shù)大體上有三種技術(shù)路線:All in one質(zhì)粒轉(zhuǎn)染法,病毒轉(zhuǎn)化法,RNP復(fù)合物導(dǎo)入法。病毒轉(zhuǎn)化法是將sgRNA、crRNA和表達(dá)cas9蛋白的序列整合進(jìn)病毒中,再使用病毒感染細(xì)胞。相較于質(zhì)粒轉(zhuǎn)染法,優(yōu)點在于sgRNA、crRNA和表達(dá)cas9蛋白可以持續(xù)存在于細(xì)胞中,從而達(dá)到一個很高的基因編輯效果。

 

圖2. 慢病毒轉(zhuǎn)染細(xì)胞示意圖

 

很多小伙伴對類器官轉(zhuǎn)染方法十分好奇,類器官慢病毒轉(zhuǎn)染和細(xì)胞轉(zhuǎn)染大同小異,主要有以下幾個問題需要注意:

1.類器官在進(jìn)行慢病毒轉(zhuǎn)染時需不需要從基質(zhì)膠里解離出來?

考慮到病毒對于基質(zhì)膠的穿透性及轉(zhuǎn)染效率,轉(zhuǎn)染時建議將類器官從基質(zhì)膠中解離出來,用適當(dāng)培養(yǎng)基重懸在孔板內(nèi)進(jìn)行。

2.類器官在進(jìn)行慢病毒轉(zhuǎn)染時需不需要消化成單個細(xì)胞?

類器官在進(jìn)行慢病毒轉(zhuǎn)染時,消化成單個細(xì)胞來轉(zhuǎn)染效率比較高,建議消化成單個細(xì)胞進(jìn)行感染。

3.類器官轉(zhuǎn)染慢病毒多長時間合適?

轉(zhuǎn)染時間可根據(jù)實際實驗情況調(diào)整,通常是轉(zhuǎn)染12-36小時,可以借鑒細(xì)胞轉(zhuǎn)染時間。

4.類器官篩選時要不要消化成單個細(xì)胞?如果不需要消化,從膠里解離出來就行?還是在基質(zhì)膠里就行?

類器官篩選不需要消化成單個細(xì)胞,在基質(zhì)膠里就可以篩選,大部分的藥物都可以穿透基質(zhì)膠,作用到類器官上。

 

以下給大家整理了類器官轉(zhuǎn)染步驟:

1.收集類器官并消化成單個細(xì)胞后,按2×105/孔鋪到24孔板中(細(xì)胞密度可以自行摸索)。

2.用含有6μg/ml polybrene(polybrene的濃度可以自行摸索)的1ml新鮮類器官培養(yǎng)基替換原培養(yǎng)基,加入適量病毒懸液,37℃孵育。

3.(對polybrene毒性敏感的細(xì)胞選作此步驟)4小時后加入1ml新鮮培養(yǎng)基以稀釋polybrene。

4.繼續(xù)培養(yǎng)12-36小時后,如有少量細(xì)胞貼壁,可用槍頭輕柔吹打下來,混勻,將細(xì)胞培養(yǎng)基混懸液收集至離心管中(一般是6-8孔為一組)。300g 4℃ 富集離心5min后移去上清,添加1ml左右類器官傳代培養(yǎng)緩沖液(abs9730)轉(zhuǎn)移到1.5ml EP管,重新重懸離心。

5.觀察收集到的組織體積,添加25倍組織體積的基質(zhì)膠(abs9495)重懸混勻(金屬冰盒或冰上操作)。

6.以24孔細(xì)胞培養(yǎng)板為例,每孔點膠25ul組織基質(zhì)膠混合物進(jìn)行鋪板((金屬冰盒或冰上操作),將鋪好的培養(yǎng)板放入37℃培養(yǎng)箱中10-15min成膠,添加500-750μl 類器官培養(yǎng)基(恢復(fù)室溫)進(jìn)行培養(yǎng)。

7.待類器官出現(xiàn)明顯增殖現(xiàn)象(一般需要2-3天),更換含有藥物的類器官培養(yǎng)基進(jìn)行篩選(如嘌呤霉素等),沒有轉(zhuǎn)染成功的類器官將會裂解凋亡,從而篩出成功轉(zhuǎn)染的類器官。

(圖源網(wǎng)絡(luò),僅供學(xué)習(xí)參考用)

 

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