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重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司 重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司
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重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司>>核酸分析>>文庫構(gòu)建>> Rubicon R300381循環(huán)腫瘤細(xì)胞CNV文庫構(gòu)建試劑盒,Rubicon

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循環(huán)腫瘤細(xì)胞CNV文庫構(gòu)建試劑盒,Rubicon

循環(huán)腫瘤細(xì)胞CNV文庫構(gòu)建試劑盒,Rubicon
參考價(jià) 面議
具體成交價(jià)以合同協(xié)議為準(zhǔn)
  • 型號 Rubicon R300381
  • 品牌 其他品牌
  • 廠商性質(zhì) 代理商
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  • 所在地 重慶市

更新時(shí)間:2018-03-12 11:01:42瀏覽次數(shù):2008

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產(chǎn)品簡介
供貨周期 一個(gè)月
循環(huán)腫瘤細(xì)胞CNV文庫構(gòu)建試劑盒,Rubicon:
TAKARA旗下Rubicon公司PicoPLEX™DNA-seq試劑盒旨在擴(kuò)增單細(xì)胞基因組DNA,以便在Illumina®新一代測序(NGS)平臺上可靠檢測染色體非整倍體和拷貝數(shù)變異(CNV)??蓱?yīng)用于包括使用卵裂球和滋養(yǎng)外胚層細(xì)胞的植入前基因篩查(PGS)和需要單細(xì)胞擴(kuò)增的循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)中的CNV檢測。

 

PicoPLEX™DNA-seq試劑盒使用技術(shù),單管三步法3小時(shí)內(nèi)完成單細(xì)胞擴(kuò)增。

PicoPLEX™DNA-seq試劑盒旨在擴(kuò)增單細(xì)胞基因組DNA,以便在Illumina®新一代測序(NGS)平臺上可靠檢測染色體非整倍體和拷貝數(shù)變異(CNV)??蓱?yīng)用于包括使用卵裂球和滋養(yǎng)外胚層細(xì)胞的植入前基因篩查(PGS)和需要單細(xì)胞擴(kuò)增的循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)中的CNV檢測。

 

PicoPLEX DNA-seq Kit

適用Illumina®NGS平臺的單細(xì)胞文庫制備

Single Cell Library Preparation for Illumina® NGS Platforms

 

英文名稱:PicoPLEX DNA-seq Kit

中文名稱:PicoPLEX DNA-seq單細(xì)胞文庫制備試劑盒

用途:單細(xì)胞DNA擴(kuò)增制備illumina文庫,用于植入前遺傳診斷和循環(huán)腫瘤細(xì)胞檢測。

成功實(shí)例:PicoPLEX DNA-seq試劑盒已成功處理單卵裂球,滋養(yǎng)外胚層細(xì)胞和培養(yǎng)細(xì)胞。

 PicoPLEX DNA-seq試劑盒可為單一細(xì)胞提供穩(wěn)定且可重現(xiàn)的DNA擴(kuò)增,用于有限的測序覆蓋度分析,不適用于高覆蓋率的深度測序,如從頭測序和/或全基因組測序。

測序平臺:PicoPLEX庫推薦的測序平臺是Illumina MiSeq系統(tǒng)和HiSeq 2000/2500。要在Illumina NextSeq測序儀上使用,請?jiān)趲鞙?zhǔn)備之前技術(shù)咨詢。

 PicoPLEX®技術(shù) - 曾用于微陣列(arrays)法的單細(xì)胞拷貝數(shù)變異檢測,現(xiàn)在有單管形式可在Illumina NGS平臺上使用。 PicoPLEX WGA(單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增)長期以來一直被*的IVF診所用于植入前基因篩查和診斷,以檢測染色體非整倍體和拷貝數(shù)變異。

PicoPLEX DNA-seq試劑盒簡化了文庫制備,整個(gè)過程在單個(gè)試管或單孔內(nèi)進(jìn)行,減少了錯(cuò)誤和污染,加快了時(shí)間,并降低了成本。PicoPLEX DNA-seq試劑盒包含48份反應(yīng),包含將48份單細(xì)胞或DNA(6 pg至60 pg)轉(zhuǎn)換為illumina NGS文庫所需的一切,包括雙端索引(illumina indexes,放在一次性使用的微孔板中)。

 

Rubicon Picoplex試劑訂購信息

48次反應(yīng),包含一次性使用96孔板的48個(gè)雙端illumina indexes。

 

品牌

貨號/新貨號

產(chǎn)品描述

包裝

Rubicon

RB3050/R30050

PicoPLEX WGA Kit,array CGH、PCR分析用

50Rxns

Rubicon

RB3381/R300381

PicoPLEX DNA-seq Kit,48種雙端illumina indexes

48Rxns

 

PicoPLEX DNA-seq試劑盒受美國8,206,913和歐盟待決申請的保護(hù),僅供研究使用。

 

歡迎您致電 重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司 ,  

 

Rubicon公司成立于2000年,總部位于美國密歇根州。產(chǎn)品都擁有技術(shù),檢控嚴(yán)格,擁有cGMP級生產(chǎn)能力,有多個(gè)OEM合作伙伴,是單細(xì)胞測序文庫構(gòu)建的。2017年1月,Rubicon 成為Takara的一員,并且發(fā)展良好。

 

單細(xì)胞一代測序簡介

新一代測序(NGS)能夠?qū)υS多應(yīng)用進(jìn)行精確和無偏差的基因組分析,包括檢測染色體非整倍性,拷貝數(shù)變異(CNV)、插入和缺失。這些檢測尤其適用IVF診所胚胎植入前基因篩查(PGS)和癌癥遺傳學(xué)。

所有這些應(yīng)用的起始材料由于使用單細(xì)胞而受到限制,并且需要基因組的可重復(fù)擴(kuò)增作為NGS下游分析的先決條件。 PicoPLEX DNA-seq試劑盒專為滿足這種不斷增長的需求而開發(fā),可幫助從單個(gè)細(xì)胞制備Illumina兼容NGS文庫。

PicoPLEX DNA-seq文庫用于表征*的基因組特征,包括體外受精(IVF)診所PGS診斷所需染色體非整倍體異常和拷貝數(shù)變異檢測,以及癌癥研究的單腫瘤細(xì)胞(如CTC)。

 

PicoPLEX DNA-seq 優(yōu)點(diǎn)

減少ambiguity高度可重復(fù)的CNV和非整倍體檢測

減少工作流程:三步完成從單細(xì)胞測序即用文庫的制備

降低成本:單個(gè)試劑盒包含測序文庫制備所需一切

減少污染和錯(cuò)誤:文庫制備孔中完成,不需要轉(zhuǎn)移

縮短結(jié)果時(shí)間:Illumina NGS文庫在不到3個(gè)小時(shí)內(nèi)制備好

 

循環(huán)腫瘤細(xì)胞CNV文庫構(gòu)建試劑盒,Rubicon

Highly Reproducible CNV Detection Over the Entire GenomeAmplified libraries from 11 individual flow-sorted H929 cells were sequenced on an Illumina MiSeq® and downsampled to 250,000 total reads. Thirty-five base single-end reads were mapped to human over the entire genome.

染色體1中高度可重復(fù)的CNV檢測:每個(gè)單獨(dú)的H929細(xì)胞中(參見上圖),如粉紅色或藍(lán)色條所示,在染色體1中*檢測到22Mb丟失和30Mb增加。

 

PicoPLEX DNA-seq Kit試劑盒參數(shù)

 樣本

上樣量:該試劑盒每次反應(yīng)可容納5μL加樣量(細(xì)胞和緩沖液zui高2.5μL)。如果細(xì)胞在1x PBS中,則不要超過2.5μL的PBS。

適用樣本:1-10個(gè)哺乳動(dòng)物細(xì)胞(例如卵裂球,極體,滋養(yǎng)層細(xì)胞,羊膜細(xì)胞,CTC,培養(yǎng)細(xì)胞);分離的DNA(6 pg - 60 pg人類DNA);超過50 pg加樣量是可能的,但需要在步驟6和10處優(yōu)化;分選的染色體。

樣本采集兼容方法:流式分選(不要固定),稀釋和顯微操作與PicoPLEX DNA-seq兼容。

細(xì)胞洗滌:建議在PBS(不含鈣,鎂和BSA)中洗滌并限制洗滌緩沖液低于2.5μL。

 

反應(yīng)時(shí)間

PicoPLEX DNA-seq試劑盒可在<3小時(shí)內(nèi)裂解細(xì)胞并準(zhǔn)備好含indexes的NGS適用文庫。

 

運(yùn)輸和存儲PicoPLEX DNA-seq試劑盒(目錄號R300381)在干冰上運(yùn)輸。試劑盒應(yīng)在抵達(dá)后保存在-20°C。

 質(zhì)量控制PicoPLEX DNA-seq Kit使用新一代測序(NGS)對應(yīng)規(guī)格進(jìn)行測試,以確保產(chǎn)品質(zhì)量和*性。

 安全信息遵循標(biāo)準(zhǔn)的實(shí)驗(yàn)室安全程序并穿戴合適的實(shí)驗(yàn)服,防護(hù)眼鏡和一次性手套,以確保人身安全并減少樣品制備和后續(xù)擴(kuò)增反應(yīng)過程中潛在的交叉污染。更多信息請參閱相應(yīng)MSDS。

 

原理和工作流程

PicoPLEX DNA-seq原理圖

PicoPLEX DNA-seq基于Rubicon Genomics的PicoPLEX技術(shù),用于單細(xì)胞基因組DNA(gDNA)擴(kuò)增,該技術(shù)使用多重循環(huán)的隨機(jī)引物進(jìn)行可重復(fù)文庫構(gòu)建。 PicoPLEX DNA-seq Kit遵循PicoPLEX WGA Kit的相同三步工作流程,包括細(xì)胞裂解,預(yù)擴(kuò)增和zui終擴(kuò)增。首先,特制配方裂解細(xì)胞并打斷DNA。接著,專門設(shè)計(jì)的隨機(jī)引物通過對產(chǎn)物進(jìn)行zui小限度的擴(kuò)增來選擇性地預(yù)擴(kuò)增DNA,以產(chǎn)生高度可重現(xiàn)的文庫。zui后,用包含Illumina雙重條形碼的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增得到測序就緒文庫。

 

 

 

組份

 

 

組份

顏色

Cell Extraction Buffer細(xì)胞提取緩沖液

綠色

Extraction Enzyme Dilution Buffer

提取酶稀釋緩沖液

紫色

Cell Extraction Enzyme

細(xì)胞提取酶

黃色

Pre-Amp Buffer 預(yù)擴(kuò)增緩沖液

紅色

Pre-Amp Enzyme 預(yù)擴(kuò)增酶

白色

Amplification Buffer 擴(kuò)增緩沖液

桔色

Amplification Enzyme  擴(kuò)增酶

藍(lán)色

Nuclease-Free Water 無核酸酶水

透明

Dual Index Plate 雙端index 微孔板

 

Quick Protocol 快速使用手冊

 

 

循環(huán)腫瘤細(xì)胞CNV文庫構(gòu)建試劑盒,Rubicon

性能

免除文庫定量:

流式分選所得unsynchronized H929細(xì)胞擴(kuò)增后,以恒定體積pooling,并且加載到MiSeq v3流通池上。由于PicoPLEX DNA-seq反應(yīng)產(chǎn)生高度可重復(fù)的產(chǎn)物,所以pooling之前無需對文庫進(jìn)行定量。圖中空白柱子部位表示該孔不含細(xì)胞。

 

 

PicoPLEX DNA-seq試劑盒提供的染色體非整倍體檢測與arrays(陣列)分析*:通過使用相同的單胚胎細(xì)胞文庫進(jìn)行陣列和NGS檢測,PicoPLEX DNA-seq試劑盒與24sure™陣列(Illumina)等效。文庫以48個(gè)兼容的條形碼pooling,并在2x100 MiSeq v2 PE中進(jìn)行測序。

測序結(jié)果與陣列結(jié)果*,測序顯示2p(如圖)的末端增益和12q末端丟失(數(shù)據(jù)未顯示),這與通過高分辨率FISH分析確認(rèn)的親本DNA中未檢測到的易位*。(數(shù)據(jù)由GIVF提供)。

 

PicoPLEX DNA-Seq Kit引用文獻(xiàn)

• New protocol based on massive parallel sequencing for aneuploidy screening of preimplantation human embryos

• Vendrell et al. 2017 Systems Biology in Reproductive Medicine, DOI: 10.1080/19396368.2017.1312633

• Construction of thousands of single cell genome sequencing libraries using combinatorial indexing

• Vitak et al. bioRxiv Jul. 23, 2016; doi: http://dx.doi.org/10.1101/065482.

• A linkage map for the Newt Notophthalmus viridescens: Insights in vertebrate genome and chromosome evolution

• Keinath et al. 2014 Developmental Biology

 

 

ThruPLEX系列產(chǎn)品

 

試劑盒

應(yīng)用

特點(diǎn)

樣本

ThruPLEX® DNA-seq Kit

通用DNA擴(kuò)增試劑盒。應(yīng)用范圍廣。文獻(xiàn)常見應(yīng)用:ChIP-Seq。

有多種illumina index選擇。

50pg-50ng

gDNA、cDNA、FFPE DNA、ChIP DNA

ThruPLEX® Plasma-seq

循環(huán)腫瘤細(xì)胞或其他疾病無創(chuàng)檢測,母體血漿中胎兒游離DNA分析

優(yōu)化用于血漿游離DNA(短又變性的DNA片段)。

 

血漿、尿液、液體活檢1ng-30ng cfDNA

ThruPLEX®Tag-seq Kit

腫瘤或其他疾病中稀有變異等位基因檢測。

莖環(huán)形接頭包含了分子標(biāo)簽連接DNA片段兩端。

 

1ng-50ng

gDNA、cfDNA、FFPE DNA

 

Rubicon公司成立于2000年,總部位于美國密歇根州。產(chǎn)品都擁有技術(shù),檢控嚴(yán)格,擁有cGMP級生產(chǎn)能力,有多個(gè)OEM合作伙伴,是單細(xì)胞測序文庫構(gòu)建的。2017年1月,Rubicon 成為Takara的一員,并且發(fā)展良好。

 

 

Rubicon 試劑訂購信息

 

品牌

貨號

新貨號

產(chǎn)品描述

包裝

Rubicon

RB4406

R400406

ThruPLEX DNA-seq 48D Kit

ThruPLEX通用文庫構(gòu)建試劑盒

48Rxns

Rubicon

RB4407

R400407

ThruPLEX DNA-seq 96D Kit

ThruPLEX通用文庫構(gòu)建試劑盒

96Rxns

Rubicon

RB4427

R400427

ThruPLEX DNA-seq 48S Kit

ThruPLEX通用文庫構(gòu)建試劑盒

48Rxns

Rubicon

RB4428

R400428

ThruPLEX DNA-seq 12S (48)Kit

ThruPLEX通用文庫構(gòu)建試劑盒

48Rxns

Rubicon

RB4523

R400523

ThruPLEX DNA-seq 6S (12 )Kit

ThruPLEX通用文庫構(gòu)建試劑盒

12Rxns

Rubicon

RB4490

R400490

ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit

ThruPLEX血漿測序試劑盒

12Rxns

Rubicon

RB4491

R400491

ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit

ThruPLEX血漿測序試劑盒

48Rxns

Rubicon

RB4492

R400492

ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit

ThruPLEX血漿測序試劑盒

96Rxns

Rubicon

RB4584

R400584

ThruPLEX Tag-seq 6S(12)Kit

12Rxns

Rubicon

RB4585

R400585

SMARTer® ThruPLEX® Tag-seq 48S Kit

48Rxns

Rubicon

RB4586

R400586

SMARTer® ThruPLEX® Tag-seq 96D Kit

96Rxns

Rubicon

RB3050

R30050

PicoPLEX WGA Kit,array CGH、PCR分析用

50Rxns

Rubicon

RB3381

R300381

PicoPLEX DNA-seq Kit,48種雙端illumina indexes

48Rxns

 

及更多Rubicon文庫構(gòu)建試劑盒

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