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重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司>>相關(guān)檢測試劑>>試劑盒>> R300718Clontech現(xiàn)貨 單細(xì)胞擴(kuò)增試劑盒

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Clontech現(xiàn)貨 單細(xì)胞擴(kuò)增試劑盒

Clontech現(xiàn)貨 單細(xì)胞擴(kuò)增試劑盒
參考價(jià) 面議
具體成交價(jià)以合同協(xié)議為準(zhǔn)
  • 型號 R300718
  • 品牌 TaKaRa
  • 廠商性質(zhì) 代理商
  • 所在地 重慶市

更新時(shí)間:2020-10-10 09:55:41瀏覽次數(shù):1608

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產(chǎn)品簡介
供貨周期 現(xiàn)貨 應(yīng)用領(lǐng)域 醫(yī)療衛(wèi)生,生物產(chǎn)業(yè)
Clontech現(xiàn)貨 單細(xì)胞擴(kuò)增試劑盒
TAKARA授權(quán)代理 現(xiàn)貨 單細(xì)胞起始量全基因組擴(kuò)增試劑盒,歡迎咨詢?nèi)A雅干細(xì)胞!Clontech現(xiàn)貨

Clontech現(xiàn)貨 單細(xì)胞擴(kuò)增試劑盒

產(chǎn)品名稱: PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3    產(chǎn)品貨號:R300718 

 
 
PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
· 單細(xì)胞(或<15 pg DNA)起始,可獲得可重復(fù)的結(jié)果
· 等位基因再現(xiàn)性
· 易于使用和自動化
· 應(yīng)用廣泛,可以用于微陣列,PCR等
 
PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 (PicoPLEX WGA v3)可以從單細(xì)胞擴(kuò)增DNA,獲得高度可重復(fù)的文庫。細(xì)胞裂解和預(yù)擴(kuò)增后,進(jìn)行低背景的PCR擴(kuò)增,并在3小時(shí)內(nèi)獲得微克級產(chǎn)物。
除了延續(xù)之前PicoPLEX WGA Kit可進(jìn)行高度可重復(fù)的拷貝數(shù)變異(CNV)分析外,該試劑盒通過使用高保真酶,盡可能減少擴(kuò)增誤差,并能檢測單核苷酸變異(SNV)。
 

 

 
 
 
圖1. 基于PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的CNV檢測
 
以來自不同細(xì)胞系(GM22601、GM05067和GM12878)的單細(xì)胞起始,使用PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3擴(kuò)增基因組。之后取1ng的擴(kuò)增產(chǎn)物,使用Illumina Nextera XT Kit制備文庫,并在Illumina MiSeq(PE 75)進(jìn)行測序。對Fastq文件去除接頭序列信息后,與human genome assembly GRCh37進(jìn)行比對。只分析常染色體。對于這兩個(gè)panels,校準(zhǔn)歸一化至100萬reads,使用bedtools 2.25.0計(jì)算每1 Mb的 bin的reads數(shù)。使用Integrative Genomics Viewer (IGV)繪制bin counts的log2 ratio (Sample/Reference)。PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3還顯示了可以高品質(zhì)的進(jìn)行染色體異倍性分析。
 
圖2. PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的全基因組覆蓋范圍的重現(xiàn)性高
 
以GM12878的單細(xì)胞樣本起始(一式兩份),分別使用PicoPLEX WGA v3,A公司試劑盒和B公司試劑盒擴(kuò)增基因組。之后取1ng的擴(kuò)增產(chǎn)物,使用Illumina Nextera XT Kit制備文庫,并在MiSeq(PE 75)進(jìn)行測序。然后與human genome assembly GRCh37進(jìn)行比對,歸一化至1M reads (0.5M paired-end reads)后,使用bedtools 2.25.0計(jì)算每個(gè)1 Mb的bin的reads數(shù)。對這兩個(gè)單細(xì)胞文庫的每個(gè)窗口的total read進(jìn)行繪制,計(jì)算Pearson和Spearman相關(guān)性并在每個(gè)圖中標(biāo)明。
Panel A. 包含異常值的樣本。*由于不同技術(shù)存在不同的偏差,沒有排除相關(guān)點(diǎn),所以圖表的比例不同。
Panel B. 排除異常值的樣本。與A公司和B公司試劑盒相比,PicoPLEX WGA v3具有更高的重現(xiàn)性和覆蓋度。

Clontech現(xiàn)貨 單細(xì)胞擴(kuò)增試劑盒

 

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