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糾結(jié),該如何選購(gòu)熒光定量PCR

閱讀:2808      發(fā)布時(shí)間:2015-8-27
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    熒光定量PCR(qPCR)是以熒光為基礎(chǔ)的定量分析技術(shù),應(yīng)用非常廣泛,可以用于定量RNA的豐度(RT-qPCR),驗(yàn)證芯片或測(cè)序的數(shù)據(jù),確定病原體的載量,進(jìn)行基因分型等等。
    熒光定量PCR儀負(fù)責(zé)監(jiān)控反應(yīng)體系中熒光強(qiáng)度的變化,記錄檢測(cè)熒光達(dá)到閾值時(shí)的循環(huán)數(shù)(被稱為Ct或Cq值)。從理論上說(shuō),每一個(gè)qPCR循環(huán)會(huì)使目標(biāo)序列翻倍,因此人們可以在Ct值的基礎(chǔ)上對(duì)樣本進(jìn)行定量。
    在進(jìn)行熒光定量PCR時(shí),我們往往會(huì)面臨眾多選擇,每一步選擇都影響著實(shí)驗(yàn)的zui終結(jié)果。好在市面上的qPCR產(chǎn)品也種類繁多,可以滿足我們的各種需求。
    染料法VS探針?lè)晒舛縋CR主要分為染料法和探針?lè)▋煞N。染料法一般采用DNA染料SYBR?Green(或Promega的BRYT?Green等),這種方法不僅使用簡(jiǎn)單,成本也zui低。不過(guò)染料法檢測(cè)的是體系中的所有雙鏈DNA,不具有序列特異性。為此,一些廠商提供ROX作為內(nèi)部熒光參考標(biāo)準(zhǔn),用來(lái)校正背景。
    成本低是染料法qPCR的一個(gè)主要優(yōu)勢(shì),DNA染料相對(duì)比較便宜,而且適用于任何序列。不過(guò)染料法無(wú)法在同一個(gè)樣本中檢測(cè)多個(gè)指標(biāo),也難以鑒定擴(kuò)增得到的序列,會(huì)受到脫靶效應(yīng)(如引物二聚體)的影響。在這種情況下,就需要進(jìn)行熔解曲線分析,判斷擴(kuò)增所得產(chǎn)物是否只有一種。
熒光定量PCR儀

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