聚焦代謝組學,結(jié)緣大咖團隊
<代謝組學>
一個頗受關注日漸活躍的研究方向
世間萬物朝夕發(fā)展,科學技術日新月異。在探索自然、解密生命的研究征程里,總是順應著技術的進步與研究的深入*地出現(xiàn)新的領域與方向,組學是其中一門代表學科,發(fā)展至今拓展出了多個分支,備受學術界青睞。第一個提出來的組學(omics)概念是1986年由美國遺傳學家Thomas H. Roderick提出的基因組學(genomics)。基因組學是對生物體所有基因進行集體表征、定量研究及不同基因組比較研究的一門交叉生物學學科。之后又基于差異組別整體分析對比的原理,產(chǎn)生了各種不同研究對象的組學,如轉(zhuǎn)錄組學(transcriptomics)是在整體水平上研究細胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學科;蛋白組學(proteomics)研究一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質(zhì)的的數(shù)目、水平及其更新等;表型組學(phenomics)是研究某一生物或細胞在各種不同外部環(huán)境條件下所有表型的學科。
各類組學的關系
代謝組學
Metabonomics /Metabolomics
是一門對生物體內(nèi)小分子代謝物組成的時空變化進行研究的學科。代表了生物動態(tài)系統(tǒng)中下游的階段,是系統(tǒng)生物學的重要組成部分。我們借用學者的總結(jié)把答案描述得通俗易懂一點,那就是“基因組學和蛋白質(zhì)組學告訴你什么可能會發(fā)生,而代謝組學則告訴你什么確實發(fā)生了。”
<大咖團隊>
中科院大連化物所許國旺課題組
許國旺課題組是國內(nèi)早從事代謝組學的研究團隊之一,開展著前沿的研究和著學科發(fā)展的趨勢。
許國旺研究員于1991年在中國科學院大連化物所獲得理學博士學位,97年晉升為研究員,99年聘為博士生導師,2005年起擔任代謝組學研究中心主任,2016年起擔任大連化物所生物技術部常務副主任, 2017年起擔任中國科學院分離分析化學重點實驗室主任?,F(xiàn)為中國化學會色譜專業(yè)委員會主任、中國抗癌協(xié)會腫瘤代謝委員會副主任、中國化學會理事、中國質(zhì)譜學會常務理事?,F(xiàn)擔任TrAC-Trends Anal. Chem.的特約編輯和Anal. Chim.Acta, Metabolomics, Anal. Bioanal. Chem.,Metabolites,J. Pharm. Biomed. Anal.,J. Chromatogr. B,Chromatographia等10多個國內(nèi)外雜志編委,高效液相色譜會議(HPLC)科學委員會常委,以及多屆毛細管色譜會議(ISCC)的科學委員會委員和代謝組學會議的組織者和科學委員會成員。至今為止,已發(fā)表SCI文章410多篇,包括PNAS,Hepatology, Clin. Chem., Cancer Res., Diabetes Care, Diabetologia, Anal. Chem.,TrAC, J. Chromatogr. A, J. Proteome Res., Mol. Cell Proteome等著名雜志。H-指數(shù): 57(Web ofScience)、72 (Google)。申請發(fā)明專利超百件(其中50多項已授權(quán))。一項成果獲國家科技進步二等獎(第五名),一項獲遼寧省科技發(fā)明二等獎(第一名),兩項成果獲中國分析測試協(xié)會科學技術成果一等獎。
許國旺研究員課題組是中科院大連化物所具綜合實力的課題組之一,前身是國家色譜研究分析中心氣相色譜組,2001年大連化物所成立生物技術部后,更名為高分辨分離分析及代謝組學組, 也是我國較早進行代謝組學研究的課題組之一。該課題組多年來根據(jù)分析化學的特點和前沿研究領域的發(fā)展趨勢,立足于中國現(xiàn)狀,結(jié)合國家重大應用領域的需求與自身技術優(yōu)勢,以分離分析研究為立足點,生命科學、重大疾病、中醫(yī)藥現(xiàn)代化、公共安全等領域的復雜樣品分析為切入點,開展復雜體系分析的方法學研究及其應用、代謝組學方法及其應用研究和轉(zhuǎn)化醫(yī)學等工作。目前,課題組擁有以許國旺研究員為核心的固定職工17人,現(xiàn)有碩、博士研究生20多名,學科背景涵蓋分析化學、生物化學、臨床醫(yī)學、藥學和微生物學等領域。
許國旺研究員及組員合影,攝于2019年9月
<緣與島津>
有幸結(jié)緣默默傾獻
島津公司作為著名的分析儀器綜合生產(chǎn)廠商,具有專業(yè)的液相色譜、氣相色譜等色譜產(chǎn)品和單四極桿質(zhì)譜、三重四極桿質(zhì)譜、高分辨質(zhì)譜LCMS-IT-TOF和Q-TOF,無機質(zhì)譜ICP-MS,生命科學產(chǎn)品MALDI-TOF、質(zhì)譜顯微鏡等齊全的質(zhì)譜產(chǎn)品。這些質(zhì)譜儀器與分離技術聯(lián)用,加上專業(yè)的數(shù)據(jù)庫、方法包和豐富的數(shù)據(jù)處理軟件,可以滿足代謝組學研究的各種需求。在科技的前行中,島津公司的產(chǎn)品有緣進入到許國旺老師的實驗室,并以優(yōu)異的性能和誠摯專業(yè)的服務獲得許老師團隊的認可,開始了多年緊密的互相合作。
中國科學院大連化學物理研究所許國旺研究員課題組實驗室配備了一系列島津分析儀器,從早期的色譜光譜分析儀器LC-10ATvp、GC-17A+QP-5000、 UV-2450,到氣質(zhì)聯(lián)用儀GCMS-QP 2010、GCMS-QP 2010 Plus,再到質(zhì)譜儀器如離子阱飛行時間質(zhì)譜液質(zhì)聯(lián)用儀LCMS-IT-TOF,三重四級桿液質(zhì)聯(lián)用儀LCMS-8050,三重四級桿氣質(zhì)聯(lián)用儀TQ-8050等。2001年大連化物所高分辨分離分析及代謝組學組成立之后,截至2019年10月,課題組利用島津分析儀器已經(jīng)在國內(nèi)外各類期刊上發(fā)表了77篇文章。研究方向涵蓋到以代謝組學分析技術平臺在疾病、中藥、植物表型等方面的應用,復雜樣品分離分析新方法、新技術等方面。
工作中的島津儀器:左LCMS-8050;右GCMS-TQ8050
<切身感受>
來自島津用戶的真實體驗與評價
相伴多年,默默傾獻。島津公司的產(chǎn)品與服務獲得了許國旺研究員的高度評價。許國旺研究員表示:“島津公司作為著名的分析儀器綜合生產(chǎn)廠商,不但是專業(yè)的液相色譜、氣相色譜等分離儀器的生產(chǎn)廠商,也是質(zhì)譜領域的者。中國科學院大連化學物理研究所“高分辨分離分析及代謝組學課題組”,已在色譜領域鉆研探索多年。近年來以分離分析研究為立足點,生命科學、重大疾病、中醫(yī)藥現(xiàn)代化、公共安全等領域的復雜樣品分析為切入點,正在開展復雜體系分析的方法學研究及其應用、代謝組學方法及其應用研究和轉(zhuǎn)化醫(yī)學等工作。島津公司一直鼎力支持本課題組的科研工作,從早期的色譜光譜分析儀器、氣質(zhì)聯(lián)用儀,再到質(zhì)譜儀器如離子阱飛行時間質(zhì)譜液質(zhì)聯(lián)用儀、三重四級桿液質(zhì)聯(lián)用儀、三重四級桿氣質(zhì)聯(lián)用儀等。通過與島津公司長期的密切合作,課題組的科研工作取得了一系列成果。“
島津鐘啟升博士與許國旺研究員合影
科研路漫漫,島津長相伴。在此衷心感謝許國旺老師及其課題組成員杰出工作和無私分享的同時,我們也希望繼續(xù)以先進的科學技術和優(yōu)質(zhì)的服務與更多科技工作者結(jié)緣,成為你們科研路上堅實的后盾,做你們邁向?qū)W術高峰的忠誠伴侶。
撰稿人:鐘躍漢