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Western Blot進(jìn)階技巧首彈——從了解目的蛋白開始

閱讀:3600      發(fā)布時(shí)間:2020-5-26
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蛋白質(zhì)印跡 (Western Blot),相信大家對(duì)此都不陌生,做為檢測蛋白表達(dá)及半定量的基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)方法,也是很多小伙伴們初入實(shí)驗(yàn)室的入門課。

“上手容易,精通難”可謂對(duì)WB實(shí)驗(yàn)的注釋,初入實(shí)驗(yàn)室的“菜鳥”可以很快上手,做出漂亮的條帶,做過多年的“大神”也可能一著不慎,實(shí)驗(yàn)“翻車”,結(jié)果一塌糊涂。有些實(shí)驗(yàn)室甚至流傳著一些所謂的“玄學(xué)”,新手人品好,難做的條帶給新手做等等。

真的是這樣么?實(shí)驗(yàn)技術(shù)可不是拼人品,靠運(yùn)氣的事兒,接下來小編將會(huì)為大家?guī)鞼B進(jìn)階技巧系列,干貨滿滿,讓大家提升WB實(shí)驗(yàn)技巧,成為真正的實(shí)驗(yàn)“大神”。


首先,讓我們了解一下什么是WB實(shí)驗(yàn)吧:

▲《定義》WB又稱為免疫印跡 (immune blot) ,是根據(jù)抗原抗體的特異性結(jié)合半定量的檢測樣品中的某種蛋白的方法。

▲《原理》通過凝膠電泳,將不同分子量大小的蛋白質(zhì)分離開,再利用特異性抗體對(duì)凝膠電泳處理過的細(xì)胞或生物組織樣品進(jìn)行著色。通過分析著色的位置和著色深度獲得特定蛋白質(zhì)在所分析的細(xì)胞或組織中表達(dá)情況的信息。

▲《應(yīng)用》定性檢測:目標(biāo)蛋白有無,分子量大小;定量檢測:檢測目標(biāo)蛋白含量(半定量)

圖1. WB操作流程圖
 

看到這,相信之前對(duì)WB了解不多的同學(xué)也應(yīng)該對(duì)WB有了一個(gè)基礎(chǔ)的認(rèn)識(shí)。那么,怎樣可以把這看似簡單的幾步做好,拿到漂亮的實(shí)驗(yàn)結(jié)果呢?話不多說,上干貨。

小編首先要強(qiáng)調(diào)的一點(diǎn),就是了解目的蛋白,這也是今天這篇文章主要給大家分享的內(nèi)容??赡苡械男』锇闀?huì)有疑問,為什么要講一個(gè)跟WB操作沒關(guān)系的步驟呢?說好的WB進(jìn)階呢?其實(shí),這往往是很多新手忽視的關(guān)鍵點(diǎn),對(duì)目的蛋白一知半解,是沒有辦法做好WB實(shí)驗(yàn)的,其他免疫學(xué)實(shí)驗(yàn)也是一樣,可能有的小伙伴還不是特別相信,接下來讓小編帶大家看看為什么了解目的蛋白是如此的重要吧~


了解目的蛋白對(duì)整個(gè)WB實(shí)驗(yàn)的重要性:


1. 了解目的蛋白,才知道目的蛋白在實(shí)驗(yàn)樣品中是否有表達(dá)

WB實(shí)驗(yàn)檢測,很多小伙伴會(huì)遇到的問題之一就是無條帶,也就是陰性結(jié)果,如何判斷陰性結(jié)果是實(shí)驗(yàn)操作問題造成的“假陰性”還是本該如此的“真陰性”,這就需要大家在實(shí)驗(yàn)前,就對(duì)目的蛋白有一個(gè)清晰的認(rèn)識(shí)。很多蛋白的表達(dá)是有組織特異性的,例如IL-10R,在視網(wǎng)膜,脾臟和肺腺癌組織中有高表達(dá),其他組織表達(dá)含量較低;還有一些蛋白,則需要特定的刺激條件才會(huì)高表達(dá),這種情況往往在磷酸化蛋白及炎癥因子蛋白等中較為常見,如果未做特殊的處理,目的蛋白表達(dá)含量很低,無法被WB檢測出。


2.了解目的蛋白,才知道如何制備樣本

樣本制備也是WB的關(guān)鍵步驟,后續(xù)的文章中也會(huì)為大家詳細(xì)分析。如何選擇合適的樣本制備方法,關(guān)鍵因素就是要了解目的蛋白;除了上面一步中的要了解目的蛋白表達(dá)組織,及預(yù)處理?xiàng)l件外,還需確認(rèn)目的蛋白表達(dá)的亞細(xì)胞定位,例如,細(xì)胞膜蛋白,核蛋白,線粒體蛋白和胞漿蛋白的提取方式都不一樣,選擇合適的方式,才能制備合格的樣品,方便后續(xù)的WB實(shí)驗(yàn)。另外一個(gè)需要注意的因素就是需要加入對(duì)應(yīng)的蛋白酶抑制劑,這一點(diǎn)對(duì)于磷酸化的蛋白尤為重要,否則蛋白在提取過程中就被降解,會(huì)造成“假陰性”結(jié)果。


圖2. 裂解液選擇參考表

3. 了解目的蛋白,才知道如何選擇內(nèi)參

內(nèi)參抗體,是WB實(shí)驗(yàn)中的重要參考,WB可以對(duì)目的蛋白進(jìn)行半定量分析,判斷不同樣品中目的蛋白表達(dá)含量的多少,就是取決于內(nèi)參的標(biāo)定。內(nèi)參選擇在WB實(shí)驗(yàn)中是很關(guān)鍵的因素,可不是GAPDH或者β-actin萬用的哦。內(nèi)參如何選擇,重要的決定因素就是目的蛋白,尤其是目的蛋白的表達(dá)位置及預(yù)處理?xiàng)l件。小編在這里總結(jié)了一下內(nèi)參的選擇表,大家可以保存哦~

圖3. 內(nèi)參選擇參考表
 

好了,相信大家應(yīng)該知道實(shí)驗(yàn)前了解目的蛋白的重要性了吧,如何了解目的蛋白呢?可以通過UniProt網(wǎng)站搜尋蛋白的相關(guān)信息,也可以在Pubmed上查閱對(duì)應(yīng)的研究文獻(xiàn),相信聰明的小伙伴們肯定可以做好的,今天的分享就先到這,接下來我們還會(huì)分享整個(gè)WB操作過程中的細(xì)節(jié),全面提升大家的WB水平,歡迎關(guān)注!


 

蛋白質(zhì)印跡(Western Blot)實(shí)驗(yàn)中產(chǎn)品推薦:

實(shí)驗(yàn)步驟  推薦指數(shù)  貨號(hào)  產(chǎn)品名稱  規(guī)格
樣本制備   abs9228  RIPA (中)  100ml
   abs9229  RIPA (強(qiáng))  100ml
   abs9230  RIPA (弱)  100ml
   abs9231  RIPA (強(qiáng),無抑制劑)  100ml
   abs9160  NP-40  100ml
   abs9195  1M Tris-HCl,pH6.8  1L
   abs9201  1M Tris-HCl,pH8.8(更多pH請看absin網(wǎng)站)  1L
   abs9117  SDS  100ml
  ★★  abs9116  WB/IP 細(xì)胞裂解液  100ml
  ★★  abs9239  WB/IP 細(xì)胞裂解液(無抑制劑)  100ml
  ★★★★  abs9101  紅細(xì)胞裂解液  100ml,250ml,500ml
   abs812852  PMSF  50mg,100mg,200mg
   abs816442  Aprotinin 抑肽酶 10mg,25mg,50mg,100mg
   abs817902  Peptatin 胃蛋白酶抑制劑A 10mg,25mg,50mg,100mg
   abs9133  EDTA  100ml
   abs42017684  EGTA  1g,10g
   abs817431  原釩酸鹽  100mg,500mg
   abs47014865  β-甘油磷酸鹽  10g,25g
  ★★  abs9161  廣譜型蛋白酶抑制劑混合物  1ml
  ★★  abs9162  廣譜型磷酸酶抑制劑混合物  1ml
蛋白定量  ★★  abs9232  BCA蛋白定量試劑盒  500次,2500次
  ★★  abs9233  增強(qiáng)型BCA 蛋白定量試劑盒  500次
上樣與電泳   abs9226  DTT溶液(1mol/L)  5ml,10ml
   abs9237  2X Laemmli樣品緩沖液  5ml*2
   abs9238  10%SDS十二烷基硫酸鈉溶液  500ml
  ★★  abs953  2*上樣緩沖液 (適用于SDS-PAGE)  10ml
  ★★  abs9301  預(yù)制膠 10%,10 wells  5片/盒
  ★★  abs9308  預(yù)制膠 10%,15 wells  5片/盒
  ★★  abs9302  預(yù)制膠 12%,10 wells  5片/盒
  ★★  abs9309  預(yù)制膠 12%,15 wells  5片/盒
   abs9303  預(yù)制膠 15% ,10 wells  5片/盒
   abs9310  預(yù)制膠 15% ,15 wells  5片/盒
   abs9304  預(yù)制膠 4-15%, 10 wells  5片/盒
   abs9311  預(yù)制膠 4-15%, 15 wells  5片/盒
  ★★  abs9305  預(yù)制膠 4-20%, 10 wells  5片/盒
  ★★  abs9312  預(yù)制膠 4-20%, 15 wells  5片/盒
   abs9307  預(yù)制膠 8%, 15 wells  5片/盒
   abs9306  預(yù)制膠 8-20%, 10 wells  5片/盒
   abs9313  預(yù)制膠 8-20%, 15 wells  5片/盒
  NEW  abs9328  3-5kd小分子量預(yù)制膠,16.5%,10wells  10片/盒
  NEW  abs9329  3-5kd小分子量預(yù)制膠,16.5%,15wells  10片/盒
  ★★★  abs925  蛋白電泳套裝  
   abs951  running buffer  100ml,1L
  ★★★★★  abs923  預(yù)染蛋白marker, 10-245 KDa  500ul,5*500ul
  ★★★★★  abs924  預(yù)染蛋白marker, 10-180 kDa  250ul,2*250ul
   abs966  Genshare考馬斯亮藍(lán)蛋白膠快速染色液  500ml
  ★★★  abs964  考馬斯亮藍(lán)染色試劑盒(常規(guī)型)R250  1kit
   abs965  考馬斯亮藍(lán)染色試劑盒(增強(qiáng)型)G250  1kit
轉(zhuǎn)膜   abs931  PVDF膜0.2 μm  20張
  ★★  abs932  PVDF膜0.45 μm  20張
  ★★  abs959  NC膜0.2 μm  20張
   abs960  NC膜0.45 μm  20張
   abs950  10*電轉(zhuǎn)液  100ml,1L
封閉   abs9174  脫脂奶粉  100g,500g
  ★★★★★  abs9155  BSA  50g,100g
一抗孵育  ★★  abs830031  Beta actin antibody   50ul,100ul
   abs132001  Beta actin antibody   50ug,100ug
   abs119680  Beta Actin Polyclonal Antibody  50ul,100ul
   abs132184  Beta-Actin antibody  50ug,100ug
   abs137975  Beta-Actin Mouse Monoclonal Antibody  50ug,100ug
  ★★  abs830030  GAPDH antibody  50ul,100ul
   abs132004  GAPDH antibody  50ug,100ug
   abs137959  GAPDH Mouse Monoclonal Antibody  50ug,100ug
   abs118936  GAPDH Polyclonal Antibody  50ul,100ul
   abs131993  Tubulin alpha Antibody  50ug,100ug
  ★★  abs830032  Tubulin Beta antibody  50ul,100ul
   abs131994  Tubulin beta Antibody  50ug,100ug
   abs125209  Tubulin Beta Polyclonal Antibody  50ul,100ul
二抗孵育  ★★  abs928  Goat anti-mouse IgG-HRP  100ul,500ul,1ml
  ★★  abs20002  Goat anti-rabbit IgG-HRP  100ul,500ul,1ml
  ★★  abs20003  Goat anti-Mouse IgG-FITC  1ml,500ul,100ul
  ★★  abs20004  Goat anti-Rabbit IgG-FITC  100ul,500ul,1ml
  ★★  abs20005  Rabbit anti-Goat IgG-HRP  100ul,500ul,1ml
一抗孵育   abs830001  Anti- GST  50ul,100ul
   abs830002  Anti- His Tag抗體  50ul,100ul
   abs830003  Anti- His(C-terminal Specific) 抗體  50ul,100ul
   abs830004  Anti- Myc 抗體  50ul,100ul
   abs830005  Anti- DYKDDDDK  50ul,100ul
   abs830006  Anti- HA 抗體  50ul,100ul
   abs830008  Anti-V5,mAb  50ul,100ul
   abs830010  Anti- GST,HRP  50ul
   abs830011  Anti- His Tag (HRP) 抗體  50ul
   abs830012  Anti- His(C-terminal Specific) (HRP) 抗體  50ul
   abs830013  Anti- Myc (HRP) 抗體  50ul
   abs830014  Anti- DYKDDDDK,HRP  50ul
   abs830015  Anti- HA (HRP) 抗體  50ul
   abs830016  Anti- V5 (HRP) 抗體  50ul
   abs137956  C-Myc-Tag Mouse Monoclonal Antibody  50ug,100ug
   abs137958  Flag-Tag Mouse Monoclonal Antibody  50ug,100ug
顯色  ★★★★★  abs920   ECL化學(xué)發(fā)光檢測試劑盒  2*25ml,2*50ml,2*250ml
   abs9212  DAB 顯色試劑盒(棕黃色,WB)  1kit
   abs9213  DAB 顯色試劑盒(紫藍(lán)色,WB)  1kit
其他輔助試劑   abs952  10*TBST  100ml,1L
   abs9152  Tween-20  500ml
  ★★  abs954  WB一抗二抗稀釋液  100ml
   abs969  Western一抗二抗去除液(中性)  250ml
   abs968  Western一抗二抗去除液(弱堿性)  250ml
   abs967  Western一抗二抗去除液(強(qiáng)堿性)  250ml
新手*  ★★★★★  abs926  WB solution base kit(rabbit)  1kit
  ★★★★★  abs927  WB solution base kit(mouse)  1kit
  ★★★★★  abs928  WB solution base kit(goat)  1kit

 

Absin特色產(chǎn)品線:
WB相關(guān):ECL發(fā)光液、預(yù)染marker、預(yù)制膠;IHC相關(guān):二抗試劑盒、組化筆;IP/CoIP試劑盒;激動(dòng)劑/抑制劑;血清、BSA、蛋白酶K、CTB、TTX、CEE;凋亡試劑盒;呼吸爆發(fā)試劑盒;ELISA試劑盒;重組蛋白;抗體: 二抗、標(biāo)簽抗體、對(duì)照抗體;定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測)...

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