細(xì)胞分選: 單細(xì)胞分選

單細(xì)胞DNA甲基化的發(fā)展歷程及研究目的

時(shí)間：2022/9/21閱讀：186

　　由于技術(shù)進(jìn)步，目前單細(xì)胞DNA測(cè)序現(xiàn)在可以作為常規(guī)實(shí)驗(yàn)，并且研究人員可通過該技術(shù)詳細(xì)描述細(xì)胞群體中的異質(zhì)性。細(xì)胞間差異有可能對(duì)應(yīng)表現(xiàn)在表觀遺傳標(biāo)記的差異，進(jìn)而與基因表達(dá)有關(guān)。

　　因此，具有測(cè)量單細(xì)胞水平上的全基因組DNAme的能力將有助于深入了解轉(zhuǎn)錄調(diào)控和細(xì)胞異質(zhì)性，以及完善對(duì)DNAme模式在細(xì)胞分裂過程中建立并遺傳了特定的基因座的理解。

　　基于亞硫酸氫鹽的全基因組甲基化測(cè)序是*用于DNAme研究的金標(biāo)準(zhǔn)，達(dá)到單堿基分辨率。亞硫酸氫鹽處理后使未甲基化的胞嘧啶殘基脫氨基變成尿嘧啶，發(fā)生了甲基化的胞嘧啶受到保護(hù)依然為胞嘧啶。

　　因?yàn)镈NA經(jīng)亞硫酸氫鹽處理會(huì)導(dǎo)致樣本的高度降解，所以限制樣本量非常低樣本做WGBS，但在2014年Smallwood首先證明了單細(xì)胞DNA中的WGBS是可行的，并已成功使用此方法測(cè)量單個(gè)細(xì)胞中接近50％的CpG位點(diǎn)，揭示了甲基化小鼠胚胎干細(xì)胞的表觀遺傳異質(zhì)性。

　　目前，特別是在腫瘤早篩和發(fā)育生物學(xué)研究領(lǐng)域，科學(xué)工作者對(duì)于DNA甲基化研究的關(guān)注度持續(xù)高漲。目前DNA甲基化的研究，大多數(shù)情況下依然是借助于亞硫酸氫鹽修飾，而該過程會(huì)引起DNA的大量損失。所以需要對(duì)該過程加以優(yōu)化以滿足DNA甲基化超微量研究的需求。

　　伴隨著單細(xì)胞DNA轉(zhuǎn)錄組的快速發(fā)展測(cè)序技術(shù)，單細(xì)胞表觀基因組測(cè)序技術(shù)也隨之發(fā)展。這些技術(shù)幫助科學(xué)家探索稀有細(xì)胞類型的表觀基因組并破譯細(xì)胞群中的表觀遺傳異質(zhì)性。

單細(xì)胞DNA甲基化的發(fā)展歷程及研究目的

會(huì)員登錄

收藏該商鋪

提示