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微生物所 O1/O139型霍亂病快速檢測試劑盒
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膜蛋白質(zhì)組學(xué)研究急性髓系白血病細胞表面表型
影響因子:15.132
主要技術(shù):膜蛋白質(zhì)組學(xué)、SILAC
研究背景
流式細胞術(shù)或免疫組織化學(xué)的免疫表型是診斷、分類和監(jiān)測血液惡性腫瘤的臨床標準。基于抗體的細胞表面表型通常局限于獲得特定抗體的細胞表面蛋白,平行測量的數(shù)量也是有限的。由于對細胞表面蛋白標記物的識別有限,阻礙了血液惡性腫瘤的早期臨床診斷和亞分類。
研究內(nèi)容及結(jié)果
1. 急性髓系白血病(AML)細胞分化后膜蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定
作者選擇全反式維甲酸(ATRA)刺激AML分化形成的HL60和NB4兩種細胞系,通過SILAC定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)結(jié)合細胞表面捕獲(CSC)技術(shù)鑒定和定量ATRA刺激后AML細胞膜蛋白質(zhì)組(圖1)。終鑒定到超過500種膜蛋白,包括137種CD注釋的細胞膜蛋白(表1),幾乎一半的膜蛋白存在于兩種AML細胞系中(圖2)。在PANTHER數(shù)據(jù)庫中發(fā)現(xiàn)了兩種AML細胞系中鑒定的膜蛋白類似的功能蛋白(圖2C),如體蛋白、細胞粘附蛋白、信號蛋白和轉(zhuǎn)運蛋白,質(zhì)譜鑒定多肽顯示高達90%以上的高特異性。