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ATAC-Seq試劑盒

Assay for Transposase-Accessible Chromatin 通常簡(jiǎn)稱為ATAC-Seq。ATAC-Seq方法依賴于使用超活性轉(zhuǎn)座酶Tn5構(gòu)建二代測(cè)序（NGS）文庫(kù)。NGS測(cè)序所需的adapter被預(yù)加載到了Tn5轉(zhuǎn)座酶上，這允許染色質(zhì)片段化和adapter的連接同步進(jìn)行，生成的DNA文庫(kù)可以通過NGS進(jìn)行測(cè)序，并使用生物信息學(xué)分析具有開放或可及染色質(zhì)的基因組區(qū)域。

與其它技術(shù)（如FAIRE-Seq或DNase-Seq）相比，ATAC-Seq的主要優(yōu)勢(shì)在于檢測(cè)所需的細(xì)胞數(shù)量較少，且實(shí)驗(yàn)方法相對(duì)簡(jiǎn)單。

ATAC-Seq實(shí)驗(yàn)一般只需要大約50000個(gè)細(xì)胞作為起始材料，并且由于其相對(duì)較簡(jiǎn)單的兩步法實(shí)驗(yàn)步驟，使得它成為了開啟表觀研究的常用方法。無(wú)論您是想分析樣本中染色質(zhì)的狀態(tài)，還是比較特殊處理前后的染色質(zhì)狀態(tài)，ATAC-Seq都可以幫您研究全基因組染色質(zhì)的變化，并可以為后續(xù)實(shí)驗(yàn)中應(yīng)該研究哪種表觀遺傳修飾或轉(zhuǎn)錄因子以及應(yīng)該使用哪種方法來研究它們提供指導(dǎo)。

ATAC-Seq試劑盒

在全基因組范圍內(nèi)分析開放的染色質(zhì)區(qū)域。

ATAC-Seq試劑盒總覽

名稱格式貓?zhí)?。價(jià)格 ATAC-Seq 試劑盒16 rxns 5315015,600購(gòu)買尋找批量重組 Tn5轉(zhuǎn)座酶？引用一下。需要復(fù)用16個(gè)以上的樣品嗎？參見我們的 NexteraTM 兼容多重引物(96復(fù))。

ATAC-Seq是一種快速檢測(cè)方法，可通過識(shí)別具有開放或可及狀態(tài)的染色質(zhì)區(qū)域來分析整個(gè)基因組的表觀遺傳概況。ATAC-Seq方法快速，簡(jiǎn)便，適用于廣泛的樣品類型，已成為常用的表觀遺傳學(xué)分析方法，并且可以作為更深入的表觀遺傳學(xué)分析的基礎(chǔ)。

在ATAC-Seq實(shí)驗(yàn)中，用高活性的突變Tn5轉(zhuǎn)座酶處理來自細(xì)胞或組織樣品的完整細(xì)胞核。該轉(zhuǎn)座酶把DNA片段化的同時(shí)用測(cè)序接頭標(biāo)記靶DNA。

Active Motif的ATAC-Seq試劑盒提供了與Illumina®平臺(tái)兼容的ATAC-Seq文庫(kù)制備試劑，可以從20 – 30 mg組織或50,000 – 100,000個(gè)細(xì)胞中生成16種不同的ATAC-Seq文庫(kù)。經(jīng)過優(yōu)化的方案將指導(dǎo)您完成樣品制備、DNA片段標(biāo)記和文庫(kù)構(gòu)建的步驟，構(gòu)建可在單個(gè)測(cè)序反應(yīng)中進(jìn)行多重測(cè)序的文庫(kù)。

ATAC-Seq試劑盒亮點(diǎn)

顯示開放染色質(zhì)區(qū)域的基因組序列

僅需數(shù)小時(shí)即可完成NGS文庫(kù)制備

簡(jiǎn)單，快速的實(shí)驗(yàn)步驟與優(yōu)化的試劑

ATAC-Seq試劑盒組分

ATAC-Seq試劑盒包含兩盒組分，其中-20°C保存的一盒組分干冰運(yùn)輸，4°C保存的另一盒組分室溫運(yùn)輸。次使用后，請(qǐng)根據(jù)說明書中的存放條件保存。妥善保管的試劑自收貨之日起可穩(wěn)定保存6個(gè)月。

試劑包括

ATAC 裂解緩沖液，存儲(chǔ)在 RT 組裝的轉(zhuǎn)座體中，存儲(chǔ)在 -20 ° C 2X 標(biāo)記緩沖液中，存儲(chǔ)在 -20 ° C 1X 標(biāo)記緩沖液中，存儲(chǔ)在 -20 ° C 或 RT10X 標(biāo)記緩沖液中，存儲(chǔ)在 RT10% 吐溫20，存儲(chǔ)在 RT1% 數(shù)字蛋白,存儲(chǔ)在 -20 ° C DNA 純化柱，存儲(chǔ)在 RTDNA 純化結(jié)合緩沖區(qū)，存儲(chǔ)在 RTDNA 純化洗滌緩沖區(qū)，存儲(chǔ)在 RTDNA 純化洗脫緩沖區(qū)，存儲(chǔ)在 RT3M 醋酸鈉，存儲(chǔ)在 RT10mM dNTP，存儲(chǔ)在 -20 ° C 5X Q5緩沖區(qū)，存儲(chǔ)在 -20 ° C Q5高保真 DNA 聚合酶,儲(chǔ)存在 -20 ° C i7索引引物1，儲(chǔ)存在 -20 ° C i7索引引物2，儲(chǔ)存在 -20 ° C i7索引引物3，儲(chǔ)存在 -20 ° C i7索引引引物4，儲(chǔ)存在 -20 ° C i5索引引物1，儲(chǔ)存在 -20 ° C i5索引引物2，儲(chǔ)存在 -20 ° C i5索引引引物3，儲(chǔ)存在 -20 ° C i5索引引引物4，儲(chǔ)存在 -20 ° C SPRI 珠，儲(chǔ)存在4 ° C

ATAC-Seq試劑盒數(shù)據(jù)

ATAC-Seq試劑盒包含進(jìn)行16個(gè)ATAC-Seq反應(yīng)所需的試劑和酶。這些試劑盒組分經(jīng)過優(yōu)化，可以高效工作，經(jīng)驗(yàn)證可以生成高質(zhì)量的ATAC-Seq數(shù)據(jù)。

 

揭示啟動(dòng)子處染色質(zhì)的開放位置

具有轉(zhuǎn)錄活性的基因，其啟動(dòng)子處的染色質(zhì)通常是開放的或可及的。ATAC-Seq分析會(huì)在這些位置產(chǎn)生峰，揭示正在研究的樣品中開放的染色質(zhì)區(qū)域。

圖1：ATAC-Seq試劑盒實(shí)驗(yàn)結(jié)果展示在基因組瀏覽器中。ATAC-Seq試劑盒用于評(píng)估小鼠腦組織樣品的全基因組開放染色質(zhì)狀態(tài)。此處顯示的基因組瀏覽器軌跡位于FOXP3基因位置，該基因編碼有絲分裂后神經(jīng)元的生物標(biāo)記物。峰表明在FOXP3基因的啟動(dòng)子上有開放的染色質(zhì)。

試劑盒實(shí)驗(yàn)結(jié)果與已發(fā)表數(shù)據(jù)高度相關(guān)

Active Motif的ATAC-Seq試劑盒可生成高質(zhì)量數(shù)據(jù)。使用ATAC-Seq試劑盒產(chǎn)生的ATAC-Seq數(shù)據(jù)與已發(fā)表的ATAC-Seq數(shù)據(jù)具有很好的相關(guān)性，這突出說明了該檢測(cè)方法的可靠性和可重復(fù)性。

ATAC-Seq RKPM Data

圖2：ATAC-Seq試劑盒文庫(kù)與已發(fā)表的ATAC-Seq數(shù)據(jù)集的相關(guān)性。該圖顯示了在GM12878細(xì)胞中，已發(fā)表的ATAC-Seq(Buenrostro, J. D. et al. (2013) Nat. Methods 10: 1213-1218)數(shù)據(jù)的峰中的RPKM信號(hào)與使用試劑盒生成的數(shù)據(jù)集之間的相關(guān)性為0.94。

 

北京華新康信也有Activemotif實(shí)驗(yàn)試劑銷售，下面給大家講講Activemotif服務(wù)以及實(shí)驗(yàn)樣本；Moltox ForteBio Moltox ForteBio Moltox ForteBio Moltox ForteBio Moltox ForteBio  Toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin  Activemotif實(shí)驗(yàn)  Activemotif試劑 Activemotif說明  Activemotif試劑方案Activemotif實(shí)驗(yàn)說明  Activemotif說明書 Activemotif技術(shù)參數(shù) Activemotif方案對(duì)比  Activemotif介紹  Activemotif廣州試劑 Activemotif深圳試劑Activemotif說明書 Activemotif技術(shù)參數(shù)Activemotif實(shí)驗(yàn)方案Activemotif技術(shù)對(duì)比Activemotif購(gòu)買說明 Activemotif江蘇試劑 Activemotif北京試劑Activemotif廈門試劑Activemotif大理試劑Activemotif武漢試劑Activemotif福建試劑Activemotif安徽試劑Activemotif廣西試劑Activemotif廈門試劑Activemotif常州試劑Activemotif安徽試劑Activemotif長(zhǎng)沙試劑Activemotif哈爾濱試劑Activemotif沈陽(yáng)試劑Activemotif深圳試劑Activemotif武昌試劑Activemotif湖北試劑Activemotif湖南試劑Activemotif上海試劑Activemotif ForteBio實(shí)驗(yàn)試劑，moltox實(shí)驗(yàn)試劑，toxin實(shí)驗(yàn)試劑，ForteBio  moltox  toxin 各種試劑的實(shí)驗(yàn)參數(shù)，說明書，歡迎咨詢  Activemotif試劑介紹  Activemotif試劑介紹  Activemotif研究方案

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