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概述科里埃爾研究所致力于推進(jìn)研究,為教師、學(xué)生和合作者提供支持基礎(chǔ)和轉(zhuǎn)化研究的*設(shè)備和專業(yè)知識。為此,我們的研究核心設(shè)施在廣泛的科學(xué)領(lǐng)域提供各種各樣的服務(wù); 這些不同的資源提供儀器,技術(shù)專業(yè)知識,培訓(xùn)和教育那些參與追求創(chuàng)新,端研究。這些設(shè)施擴(kuò)大了調(diào)查人員的能力,促進(jìn)了合作,加快了發(fā)現(xiàn)和翻譯的速度。
生物信息學(xué)可用的分析工作流程: RNA-seqChIP-seqATAC-seqWES/WGE 減少表示亞硫酸鹽定序(RRBS)微生物組宏基因組學(xué)(16S 測序) scRNA-seqscATAC-seqexample 標(biāo)準(zhǔn)輸出: 用于在 UCSC 或 IGV 上追蹤可視化的 RNA-seqC 報(bào)告文件(bigwig) ;BAM 比對文件可用于 requestRaw 基因計(jì)數(shù)表列出差異表達(dá)基因及其表達(dá)倍數(shù)變化和 FDR 校正的 p 值3可視化: PCA,熱圖,路徑的火山圖列表 RRBSQC reportBAM 比對文件(當(dāng)請求時(shí))所有檢測到的 CpG 位點(diǎn)的完整甲基化表具有 p 值(FDR 校正)的差異甲基化 CpG 位點(diǎn)的列表可視化: PCA 圖,熱圖,對于顯著甲基化的 CpGs 列表附近 genesscRNA-seqC 報(bào)告條形碼 BAM 比對文件可用(用于 GEO) UMI/Cell count tabletSNE 或 UMAP 聚類用于亞群列表差異表達(dá)基因列表及其表達(dá)倍數(shù)變化和 FDR 校正的 p 值基于聚類或?qū)嶒?yàn)條件(兩者均為額外的2小時(shí)收費(fèi))。如果沒有基于聚類的亞群確定,差異表達(dá)將基于實(shí)驗(yàn)條件進(jìn)行。2可視化: 熱圖,火山圖路徑列表費(fèi)用: 生物信息學(xué)分析起價(jià)每小時(shí)250美元。批量分析每個(gè)樣品的估計(jì)費(fèi)用
流式細(xì)胞術(shù)和細(xì)胞分選 Coriell 流式細(xì)胞術(shù)設(shè)備能夠使用 BD FACSymphony (檢測最大16種顏色)和 SONY 分選細(xì)胞分選(無菌,速度高達(dá)20,000個(gè)細(xì)胞/秒)從基于多達(dá)6個(gè)熒光染料的均勻或混合細(xì)胞群體中進(jìn)行流式細(xì)胞術(shù)分析,其可以同時(shí)分選多達(dá)兩個(gè)單獨(dú)的群體,包括 BSL-2水平的人源樣品。設(shè)施工作人員支持研究人員創(chuàng)建高效、低成本的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)ーー即通過優(yōu)化特定于細(xì)胞計(jì)數(shù)的試劑和熒光染料的選擇ーー并在分析儀器的操作方面提供協(xié)助。我們的設(shè)施還為流式和成像細(xì)胞術(shù)數(shù)據(jù)的分析提供技術(shù)支持,以便發(fā)表,介紹和納入贈款申請; 管理細(xì)胞術(shù)數(shù)據(jù)(存儲,歸檔和檢索) ; 以及管理低成本獲取后分析軟件的現(xiàn)場許可證。
基因組學(xué)和表觀基因組學(xué)基因組學(xué),轉(zhuǎn)錄組學(xué)和表觀基因組學(xué)服務(wù)針對基因分型和突變分析的深度測序針對單個(gè)等位基因的 DNA 甲基化分析的亞硫酸氫鹽擴(kuò)增子測序減少表征亞硫酸鹽定序(RRBS)用于全基因組分析的 DNA 甲基化16S 核糖體 DNA 測序用于微生物組分析 Bulk 和單細(xì)胞用于基因表達(dá)分析的 RNA-seq Bulk 和單細(xì)胞 ATAC-seq 用于染色質(zhì)可及性的全基因組分析用于 DNA 結(jié)合蛋白和組蛋白修飾的全基因組作圖的 ChIP-seqS2聚焦超聲波儀 Pyromark Q24焦磷酸測序平臺 Applied Biosystems QuantStudio6 Flex 實(shí)時(shí) PCR 儀器安捷倫生物分析儀2100Qbit 熒光計(jì) NanoDrop 分光光度計(jì) Invitrogen iBright CL1000凝膠成像儀
誘導(dǎo)多能干細(xì)胞科里爾的 iPSC 核心提供了多種服務(wù),以滿足您的干細(xì)胞需求。Coriell 的 iPSC 實(shí)驗(yàn)室擁有建立 hiPSC 系列的廣泛專業(yè)知識,使用包括仙臺病毒和附加質(zhì)粒載體在內(nèi)的不同方法重編程各種“親本"細(xì)胞類型。Coriell 擁有一大批明顯健康和疾病模式的 iPSC 系列,而且這些系列的數(shù)量還在不斷增加。疾病特異性細(xì)胞系包括神經(jīng)系統(tǒng)疾病、單基因疾病和染色體異常。幾十年來,科里爾在幫助定義和實(shí)施生物樣本收集、加工(確保無菌性、完整性和真實(shí)性)、質(zhì)量保證(QA)、質(zhì)量控制(QC)、深低溫保存、樣本安全儲存、收集維護(hù)/庫存管理和全球分銷的最佳實(shí)踐方面發(fā)揮了關(guān)鍵作用。Coriell 公司的實(shí)驗(yàn)室按照 ISO9001標(biāo)準(zhǔn)的嚴(yán)格的標(biāo)準(zhǔn)操作程序運(yùn)作,細(xì)胞系資源經(jīng)過全面的細(xì)胞系完整性和質(zhì)量控制測試。就干細(xì)胞系而言,多能性和分化潛力的評估是使用各種技術(shù)平臺進(jìn)行的。在 Coriell 進(jìn)行的標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞系 QC 檢測(作為對科學(xué)界的一項(xiàng)服務(wù))包括,但不限于: 生長和生存能力評估微生物和真菌不育檢測支原體檢測人類病原體檢測身份檢測(微衛(wèi)星與親本細(xì)胞培養(yǎng)物匹配)細(xì)胞遺傳學(xué) G 帶核型微陣列基因分型確認(rèn)無整合重編程使用干細(xì)胞表面標(biāo)記通過免疫細(xì)胞化學(xué)和/或流式細(xì)胞術(shù)和堿性磷酸酶染色體體外胚胎體(EB)檢測和定量分析三系分化潛能使用 RT-PCR 分析胚層特異性基因的表達(dá)多能性和三系分化潛能使用 Applied Biosystems TaqMan hPSC Scorecard Panel。
動物和異種移植科里爾動物和異種移植核心提供了廣泛的服務(wù),以協(xié)助異種移植動物研究的設(shè)計(jì)和實(shí)施。Core 公司擁有一個(gè)大型的免疫缺陷(NSG)小鼠繁殖群(約30對) ,以滿足客戶的需求。實(shí)驗(yàn)動物被安置在我們 NSG 專用的 BSL-2空間,該空間全配備了手術(shù)和生存手術(shù)所必需的所有設(shè)備。該設(shè)施的能力包括方位的異種移植模型,包括移植到 NSG 小鼠中的人 CD34 + 細(xì)胞,血液惡性腫瘤(AML,ALL)的原位患者衍生的異種移植(PDX)模型和實(shí)體瘤(即肝,卵巢,腦,肺)模型。聯(lián)系連博士,
Coriell 的 Organoid Core 提供了多種3D 細(xì)胞培養(yǎng)模型,以滿足研究人員的需要。3D 細(xì)胞培養(yǎng)模型,如類器官和球體,更接近地概括了細(xì)胞結(jié)構(gòu)和細(xì)胞在體內(nèi)自然生長的微環(huán)境。3D 模型的進(jìn)步為器官發(fā)生、疾病建模和藥物治療提供了寶貴的研究機(jī)會。憑借 Coriell 在多種細(xì)胞類型和疾病模型方面的長期經(jīng)驗(yàn),我們已經(jīng)優(yōu)化了許多方案,以適應(yīng)細(xì)胞系到細(xì)胞系和疾病模型的變化。高質(zhì)量的細(xì)胞培養(yǎng)模型和工具是三維細(xì)胞培養(yǎng)成功的關(guān)鍵。Coriell 的 Organoid Core 能夠?yàn)樗?span>3D 細(xì)胞培養(yǎng)模型提供一致的可重復(fù)結(jié)果。
細(xì)胞成像科里爾細(xì)胞成像核心為新澤西州南部地區(qū)的研究人員提供了前沿光學(xué)成像能力。我們提供激光掃描和旋轉(zhuǎn)圓盤共聚焦顯微鏡,光片顯微鏡,超分辨率顯微鏡技術(shù)和寬視場顯微鏡用于固定和實(shí)時(shí)成像。我們的特色共聚焦顯微鏡是奧林巴斯 fv3000共聚焦顯微鏡,使廣泛的成像模式,包括宏觀顯微成像,超分辨率顯微鏡技術(shù)和定量數(shù)據(jù)分析。奧林巴斯 FV3000的其他關(guān)鍵特性是: TruSpectal 高靈敏度多通道成像系統(tǒng)使用專有的光譜檢測技術(shù),FV3000共聚焦顯微鏡的 TruSpectal 探測器結(jié)合了高靈敏度和光譜靈活性,甚至可以檢測到最暗的熒光團(tuán)。與傳統(tǒng)的光譜探測技術(shù)相比,它的光傳輸能力提高了3倍。它還有獨(dú)立的可調(diào)通道,以優(yōu)化每個(gè)熒光團(tuán)的信號檢測。它的 lambda 掃描模式使得復(fù)雜的重疊熒光信號能夠精確的光譜分解。FV3000顯微鏡的宏觀到微觀的工作流程為數(shù)據(jù)采集提供了一個(gè)路線圖,使你能夠在上下文中看到數(shù)據(jù),并輕松定位感興趣的區(qū)域以獲得更高分辨率的成像。它使用一個(gè)低放大率1.25 X 或2倍的物鏡來快速捕捉整個(gè)標(biāo)本的大視場(FOV)地圖。它可以識別覆蓋地圖上感興趣的區(qū)域,然后切換到一個(gè)更高的放大率目標(biāo)的高分辨率共焦成像到120納米奧林巴斯超分辨率技術(shù)(FV-OSR)。
FV3000RS 混合掃描單元使用振鏡掃描儀進(jìn)行精確掃描,同時(shí)使用共振掃描儀,非常適合對活體生理事件進(jìn)行高速成像。它可以使用共振掃描儀以大視場捕捉視頻速率圖像,其特點(diǎn)是使用剪輯掃描,速度從30幀率(fps)到最高438幀每秒(fps)。精確的時(shí)間延遲成像時(shí)間延遲實(shí)驗(yàn)需要一致的焦點(diǎn)和低光毒性的樣品。奧林巴斯的 TruFocus 設(shè)備有助于在活細(xì)胞成像過程中保持聚焦,盡管溫度發(fā)生變化或添加了試劑。FV3000顯微鏡的高靈敏度探測器需要的激光功率明顯減少,而共振掃描儀減少激光照明時(shí)間,降低光毒性,為更多的生理準(zhǔn)確的共焦成像數(shù)據(jù)。由于硅油的折射率接近于活體組織,因此硅油目標(biāo)可以在組織內(nèi)部以最小的球面像差進(jìn)行高分辨率的觀察。它的折射率匹配提供了一個(gè)理想的焦距體積,導(dǎo)致完的體積重建,并使大型生物體的高分辨率共焦成像。它的長距離工作能夠在深度上進(jìn)行詳細(xì)的顯微成像。利用三維重建軟件,可以實(shí)時(shí)觀察數(shù)據(jù)的展開情況,并且可以方便地觀察結(jié)構(gòu)。
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