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Label free: 非標(biāo)定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù);
比如你有10個組織樣品,分別提取蛋白質(zhì)并酶解成肽段。然后每一個肽段樣品進(jìn)行LC-MS分析,這樣就得到10個MS數(shù)據(jù);
對于1條肽段,其在10個樣品中的豐度(量)與其在MS1中的峰面積或信號強度成正比;
理論上,對于10個樣品中的同一條肽段,其在LC上的保留時間(retention time, RT)是一致的,因此,可以通過對比MS圖譜,實現(xiàn)對蛋白質(zhì)在不同樣本中的相對表達(dá)水平的定量分析。
Label free技術(shù)特色:
1、與SILAC, iTRAQ/TMT技術(shù)相比,樣品無需標(biāo)記,能終程度地保留樣品的“真實性”;
2、樣品處理步驟簡單,蛋白質(zhì)只需酶解即可進(jìn)行LC-MS分析;
3、能很大程度的節(jié)省樣本制備費用。
Label free分析軟件
Maxquant,Progenesis 等
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