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chip蛋白實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)
上海伊萊博生物科技有限公司成立于2005年,公司位于上海長(zhǎng)江軟件園,實(shí)驗(yàn)室面積600多平方米。公司目前具備較好的的生物學(xué)、醫(yī)學(xué)技術(shù)服務(wù)平臺(tái),能夠?yàn)閺V大客戶提供醫(yī)學(xué)科研樣本檢測(cè)、合作研究、開(kāi)發(fā)及生產(chǎn)服務(wù)。
chip蛋白實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)操作流程:
1 、樣品準(zhǔn)備與交聯(lián)
細(xì)胞收集后,用37%的formaldehyde處理細(xì)胞,交聯(lián)核酸與DNA結(jié)合蛋白;
2. 超聲打斷染色質(zhì)
裂解細(xì)胞,用Bioruptor將染色質(zhì)超聲破碎成200-1000bp片斷;將片段分為兩份,一份用于免疫共沉淀,一份用于對(duì)照。
3 、免疫共沉淀 (IP)
取B步驟所得一份片斷與ChIP特異抗體結(jié)合進(jìn)行免疫共沉淀,利用免疫磁珠法富集抗體復(fù)合物。
4 、解交聯(lián)及純化 DNA
將富集的DNA/蛋白復(fù)合物解交聯(lián)釋放DNA的片段,并進(jìn)行純化(IP DNA);B步驟所得用于對(duì)照(Input DNA)的片斷作不進(jìn)行IP實(shí)驗(yàn),但也要解交聯(lián)并純化。
5 、 DNA 段 PCR 擴(kuò)增
針對(duì)ChIP DNA, Input DNA及對(duì)照DNA的目的片段設(shè)計(jì)特異性引物并進(jìn)行熒光定量PCR擴(kuò)增。
6 、結(jié)果分析
%Input=2(CtInput-CtChIP)×Fd×
Fold Enrichment = [%(ChIP/Input)] / [%( Negative control/Input)]
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