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全自動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序建庫(kù)解碼系統(tǒng)

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更新時(shí)間:2024-12-03 22:47:52瀏覽次數(shù):1383次

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10x Genomics公司Chromium Connect單細(xì)胞測(cè)序儀器設(shè)備,是一款全自動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序建庫(kù)解碼系統(tǒng)??勺詣?dòng)化完成從單細(xì)胞懸液到可用于測(cè)序的文庫(kù)制備,從而實(shí)現(xiàn)工作效率的提升。簡(jiǎn)化后的工作流程將單細(xì)胞分離和條形碼與文庫(kù)制備相結(jié)合,將手動(dòng)操作時(shí)間從8小時(shí)以上縮短到1小時(shí)之內(nèi)。同時(shí),自動(dòng)化工作流程減少了手動(dòng)移液帶來(lái)的誤差,實(shí)現(xiàn)了流程標(biāo)準(zhǔn)化,可以產(chǎn)生一致且可重復(fù)的單細(xì)胞數(shù)據(jù)。

將您的單細(xì)胞工作流程自動(dòng)化

一、全自動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序建庫(kù)解碼系統(tǒng)儀器簡(jiǎn)介:

(1)單細(xì)胞測(cè)序儀器設(shè)備Chromium Connect,是一款全自動(dòng)的單細(xì)胞建庫(kù)解碼系統(tǒng)??勺詣?dòng)化完成從單細(xì)胞懸液到可用于測(cè)序的文庫(kù)制備,從而實(shí)現(xiàn)工作效率的提升,可以專注于更重要的工作。簡(jiǎn)化后的工作流程將單細(xì)胞分離和條形碼與文庫(kù)制備相結(jié)合,將手動(dòng)操作時(shí)間從8小時(shí)以上縮短到1小時(shí)之內(nèi)。
(2)同時(shí),自動(dòng)化工作流程減少了手動(dòng)移液帶來(lái)的誤差,實(shí)現(xiàn)了流程標(biāo)準(zhǔn)化,可以產(chǎn)生一致且可重復(fù)的單細(xì)胞數(shù)據(jù)。結(jié)合Cell Ranger數(shù)據(jù)分析軟件和Loupe Browser可視化軟件,輕松實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞水平轉(zhuǎn)錄組、免疫分析、基因組拷貝數(shù)變異和染色質(zhì)開(kāi)放性等研究。品牌10x Genomics,型號(hào)Chromium,產(chǎn)地新加坡,代理商是斑馬魚(yú)(北京)科技有限公司。

全自動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序建庫(kù)解碼系統(tǒng)

二、全自動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序建庫(kù)解碼系統(tǒng)工作流程:

單細(xì)胞測(cè)序流程是從單細(xì)胞或細(xì)胞核懸液開(kāi)始的。采用*進(jìn)的微流體技術(shù)生成含有單細(xì)胞或細(xì)胞核的微滴。接著按照簡(jiǎn)化的流程來(lái)構(gòu)建文庫(kù)。測(cè)序后采用整合的數(shù)據(jù)分析流程和可視化軟件來(lái)處理和分析數(shù)據(jù)。

全自動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序建庫(kù)解碼系統(tǒng)

三、讓您的效率提升10x:

(1)Chromium Connect將您的單細(xì)胞測(cè)序流程自動(dòng)化,包括基因表達(dá)和細(xì)胞表面蛋白的分析,讓您可以輕松地從細(xì)胞直接生成立即可測(cè)序的文庫(kù)。對(duì)于不同的實(shí)驗(yàn)和不同的用戶,該儀器都能夠產(chǎn)生一致且可重復(fù)的單細(xì)胞基因表達(dá)結(jié)果。
(2)能夠減少手動(dòng)移液的失誤,將您的手動(dòng)操作時(shí)間從8小時(shí)以上縮短到1小時(shí)以內(nèi)。這個(gè)全面整合且經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的解決方案將幫助您充分利用時(shí)間,充滿信心地開(kāi)展單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)。

全自動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序建庫(kù)解碼系統(tǒng)

四、技術(shù)原理:

Chromium單細(xì)胞解決方案能夠從多個(gè)角度捕獲細(xì)胞活性的分子讀數(shù),包括基因表達(dá)、染色質(zhì)可接近性、細(xì)胞表面蛋白、免疫克隆型、抗原特異性以及CRISPR編輯。這項(xiàng)技術(shù)的核心之處在于能夠產(chǎn)生成千上萬(wàn)個(gè)單細(xì)胞微滴,而每個(gè)微滴都含有一個(gè)可識(shí)別的條形碼,便于下游分析。

全自動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序建庫(kù)解碼系統(tǒng)

五、Next GEM技術(shù):

①每個(gè)Chromium解決方案都從高度多樣化的凝膠珠(GelBeads)開(kāi)始,每個(gè)凝膠珠都帶有的寡核苷酸條形碼標(biāo)簽序列,以及便于捕獲目標(biāo)分子的功能化序列。

②在Chromium系統(tǒng)內(nèi),將帶有條形碼標(biāo)簽的凝膠珠與細(xì)胞或細(xì)胞核、酶以及分液油混合,產(chǎn)生成千上萬(wàn)個(gè)單細(xì)胞乳液微滴,這些微滴被稱為“GEM"(Gel Bead-in-emulsion)。

③每個(gè)GEM都作為單獨(dú)的反應(yīng)微滴,凝膠珠在其中溶解,捕獲每個(gè)細(xì)胞的目標(biāo)分子,添加條形碼并擴(kuò)增。

④添加條形碼后,來(lái)自同一細(xì)胞或細(xì)胞核的所有片段都共享一種10x 條形碼。將成千上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞的帶有條形碼的產(chǎn)物混合,進(jìn)行下游反應(yīng),從而產(chǎn)生與短讀長(zhǎng)測(cè)序儀兼容的文庫(kù)。

⑤在測(cè)序后,生物信息學(xué)工具將利用可識(shí)別的條形碼序列將測(cè)序片段定位到原本的單細(xì)胞或細(xì)胞核。


全自動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序建庫(kù)解碼系統(tǒng)

全自動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序建庫(kù)解碼系統(tǒng)

六、一臺(tái)自動(dòng)化系統(tǒng),多種單細(xì)胞分析:

高效分析成千上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞,通過(guò)不同的工作流程揭示細(xì)胞異質(zhì)性。一系列單細(xì)胞測(cè)序分析可選擇連續(xù)流程,也可選擇靈活的模塊化流程,以適應(yīng)您的日常操作。

1. 單細(xì)胞基因表達(dá):將您的3’單細(xì)胞基因表達(dá)工作流程自動(dòng)化,讓您更高效地探索細(xì)胞異質(zhì)性,發(fā)現(xiàn)新的靶點(diǎn)和生物標(biāo)志物,并闡明復(fù)雜的細(xì)胞進(jìn)程。

2.單細(xì)胞免疫分析:將您的5’基因表達(dá)和V(D)J擴(kuò)增流程自動(dòng)化,并可選擇采用Feature Barcode技術(shù)同時(shí)測(cè)定細(xì)胞表面蛋白表達(dá)和抗原特異性,以便大規(guī)模分析免疫系統(tǒng)的細(xì)胞異質(zhì)性,以及T細(xì)胞和B細(xì)胞受體多樣性。

3.也可使用單細(xì)胞基因表達(dá)與細(xì)胞表面蛋白同時(shí)分析的5’多組學(xué)免疫分析的自動(dòng)化工作流程。

4. 技術(shù)培訓(xùn)和支持:Xenium、Visium CytAssist、Chromium Controller,Chromium X、Chromium™ Next GEM Single Cell 3' GEM, Library & Gel Bead Kit、Visium Spatial for FFPE Gene Expression Kit、Chip G、Feature Barcode Library Kit……斑馬魚(yú)(北京)科技有限公司是10x Genomics代理商,負(fù)責(zé)銷(xiāo)售儀器和試劑,具備豐富的單細(xì)胞測(cè)序和空間轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)方面經(jīng)驗(yàn),可為用戶提供單細(xì)胞懸液制備,建庫(kù),測(cè)序,生信分析等一整套解決方案。在購(gòu)買(mǎi)儀器后,將安排有資質(zhì)的工程師進(jìn)行現(xiàn)場(chǎng)安裝和培訓(xùn)。培訓(xùn)內(nèi)容包括樣本制備、儀器操作、數(shù)據(jù)分析。在培訓(xùn)完成后,客戶還將獲得支持,包括遠(yuǎn)程技術(shù)支持(Technical Support)、現(xiàn)場(chǎng)應(yīng)用科學(xué)家(FAS)、現(xiàn)場(chǎng)服務(wù)工程師(FSE)和生物信息學(xué)應(yīng)用(Applied Bioinformatics)團(tuán)隊(duì),覆蓋實(shí)驗(yàn)工作流程、試劑耗材、儀器和軟件的各個(gè)方面。

全自動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序建庫(kù)解碼系統(tǒng)

七、單細(xì)胞分離、標(biāo)記和文庫(kù)制備集成于一臺(tái)經(jīng)過(guò)優(yōu)化的儀器中:

集成了專為單細(xì)胞流程而定制的組件、自動(dòng)化專屬的試劑和耗材,以及輕松易用的觸摸屏計(jì)算機(jī)。從直觀的自行設(shè)置到防出錯(cuò)的試劑上樣,即便您是新手,也能讓您快速啟動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)。

全自動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序建庫(kù)解碼系統(tǒng)

八、儀器技術(shù)參數(shù):

1、功能用途:利用微流控芯片對(duì)單細(xì)胞懸液樣本進(jìn)行精確分區(qū)并建立油包水反應(yīng)體系,每個(gè)反應(yīng)體系含有特定標(biāo)簽序列,對(duì)樣品中的數(shù)千個(gè)單細(xì)胞mRNA進(jìn)行建庫(kù),通過(guò)對(duì)文庫(kù)的測(cè)序分析,解讀細(xì)胞群體的基因表達(dá)譜。可自動(dòng)化完成從單細(xì)胞懸液到可用于測(cè)序的文庫(kù)制備,減少了手動(dòng)操作誤差,實(shí)現(xiàn)了流程標(biāo)準(zhǔn)化,可以產(chǎn)生一致且可重復(fù)的單細(xì)胞數(shù)據(jù)。

2、處理樣本類(lèi)型:一種微流體芯片兼容不同大小及不同類(lèi)型的真核細(xì)胞;

3、簡(jiǎn)單的實(shí)驗(yàn)操作流程:從單細(xì)胞懸液到測(cè)序文庫(kù)的生成在8小時(shí)內(nèi)可以完成;

4、樣本處理通量:儀器可同時(shí)運(yùn)行1-8個(gè)通道,每次運(yùn)行最多可產(chǎn)生8,0000個(gè)單細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄本;

5、分區(qū)與標(biāo)簽數(shù):每次運(yùn)行產(chǎn)生>8萬(wàn)個(gè)納升級(jí)分區(qū),含有75萬(wàn)個(gè)序列標(biāo)簽(每個(gè)標(biāo)簽由16個(gè)堿基構(gòu)成);

6、集成工作流程中的步驟,從單細(xì)胞partitioning和barcoding到測(cè)序文庫(kù)生成一站式完成;

7、配備自動(dòng)化工作流程,易于使用的觸摸屏計(jì)算機(jī),簡(jiǎn)易的操作方式;

8、通過(guò)減少用戶操作之間的差異,獲得一致的單細(xì)胞基因表達(dá)結(jié)果;

9、從單細(xì)胞懸液到測(cè)序文庫(kù)全自動(dòng)化生成不超過(guò)9小時(shí);

10、手動(dòng)操作時(shí)間≤1小時(shí);

11、配備熱循環(huán)模塊,能自動(dòng)實(shí)現(xiàn)PCR反應(yīng);

12、配備磁力裝置,自動(dòng)完成清洗工作;

13、配備2D條形碼掃描器,掃描試劑信息并跟蹤試劑使用情況;

14、可以調(diào)節(jié)高度和角度,適合各種類(lèi)型用戶;

15、軟件包括:免費(fèi)安裝,免費(fèi)升級(jí)。

九、斑馬魚(yú)(北京)科技有限公司,是10x Genomics公司的授權(quán)經(jīng)銷(xiāo)商,負(fù)責(zé)產(chǎn)品的推廣銷(xiāo)售和技術(shù)支持,為您提供技術(shù)參數(shù),報(bào)價(jià)、選型、實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)、安裝培訓(xùn)、售后服務(wù)等,更多信息可和我們聯(lián)系。


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