5月26日，CNHUPO|臨床蛋白質(zhì)組學(xué)和糖組學(xué)學(xué)術(shù)研討會于上海勝利閉幕。此次研討會，諸多蛋白組學(xué)和糖組學(xué)專家闡述了組學(xué)技術(shù)在醫(yī)學(xué)/臨床研究中的應(yīng)用，為未來從研究到臨床轉(zhuǎn)化探討了新的思路，開拓了更加廣闊的應(yīng)用前景。

北京生命科學(xué)研究院邵峰院士

報(bào)告題目：Innate immunity to cytosolic LPS：Pyroptosis and beyond

報(bào)告主要內(nèi)容：

大會由復(fù)旦大學(xué)陸豪杰教授致開幕詞，北京生命科學(xué)研究所邵峰院士做了題為“Innate immunity to cytosolic LPS：Pyroptosis and beyond"的報(bào)告，明晰了細(xì)胞焦亡與傳統(tǒng)細(xì)胞凋亡的區(qū)別，闡述了分子免疫機(jī)制：Caspase-4/5/11作為胞內(nèi)LPS的受體，識別LPS的Lipid A部分，進(jìn)而發(fā)生寡聚化而激活。這些細(xì)菌免疫受體活化后，均通過誘導(dǎo)組裝炎癥小體復(fù)合物進(jìn)而激活膜打孔蛋白GSDMD，誘發(fā)細(xì)胞焦亡。

 

復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院副院長楊芃原教授

報(bào)告題目：疾病糖蛋白質(zhì)組的定量質(zhì)譜

報(bào)告主要內(nèi)容：

從質(zhì)譜技術(shù)發(fā)展歷史，到質(zhì)譜如何幫助蛋白組學(xué)研究，再到質(zhì)譜技術(shù)未來向臨床發(fā)展的展望：以MRM為基礎(chǔ)的質(zhì)譜ELISA技術(shù)可以在臨床檢驗(yàn)中逐步部分取代現(xiàn)有傳統(tǒng)ELISA，特別是檢驗(yàn)具有群和網(wǎng)絡(luò)特征的關(guān)鍵蛋白。同時(shí)，運(yùn)用Orbitrap技術(shù)的pGlyco 2.0提供給糖蛋白研究者又一有效的定量策略。

 

 

國家蛋白質(zhì)科學(xué)中心·北京秦鈞主任

報(bào)告題目：胃癌的臨床蛋白組學(xué)研究

報(bào)告主要內(nèi)容：

從蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用于臨床所面臨的問題，到未來蛋白質(zhì)組學(xué)走向臨床的前景，秦鈞教授通過一些臨床研究實(shí)例，講述了如何在實(shí)踐中逐步克服臨床生物樣本、檢測手段等方面的局限性，描繪了蛋白質(zhì)組學(xué)驅(qū)動(dòng)轉(zhuǎn)化臨床的可行性。尤其是惡性腫瘤藥物靶點(diǎn)、標(biāo)志物、治療響應(yīng)性標(biāo)志物等，有望應(yīng)用于臨床伴隨診斷。無論是在探索分子病理方面，抑或是實(shí)現(xiàn)臨床早診、治療領(lǐng)域，蛋白質(zhì)組學(xué)都發(fā)揮著越來越重要的作用。蛋白質(zhì)組學(xué)驅(qū)動(dòng)的精準(zhǔn)醫(yī)療時(shí)代（Proteomics-driven precision medicine）已經(jīng)被開啟。

 

  

同濟(jì)大學(xué)田志新教授

報(bào)告題目：基于糖蛋白質(zhì)組學(xué)的癌癥和癌癥干細(xì)胞生物標(biāo)志物的分析

報(bào)告主要內(nèi)容：

同濟(jì)大學(xué)田志新教授，做了在肝癌、乳腺癌研究中發(fā)現(xiàn)N-糖蛋白質(zhì)標(biāo)志物的報(bào)告，結(jié)合ZIC-HILIC富集、同位素二甲基標(biāo)記、pentaHILIC-nESI-MS/MS（HCD，stepped NCEs）、GPseeker定性、GPseekerQuan定量，對HCC HepG2細(xì)胞中差異表達(dá)N-糖基化在完整水平上進(jìn)行大規(guī)模位點(diǎn)和結(jié)構(gòu)特異性的分離、鑒定和定量。

 

 

西湖大學(xué)郭天南教授

西湖大學(xué)的郭天南教授介紹了運(yùn)用DIA技術(shù)結(jié)合PCT快速樣品前處理技術(shù)在臨床大隊(duì)列樣本研究中的應(yīng)用，以及使用Orbitrap技術(shù)平臺建立人類多個(gè)組織蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)庫，為DIA和PRM分析提供便利。

 

賽默飛HRMS1-DIA方案廣受關(guān)注

大會報(bào)告中賽默飛應(yīng)用經(jīng)理周岳，帶來HRMS1-DIA技術(shù)在臨床大樣本蛋白質(zhì)組學(xué)分析中的可行性評價(jià)：

經(jīng)過來自9個(gè)國家和地區(qū)的11個(gè)實(shí)驗(yàn)室，連續(xù)7天24小時(shí)運(yùn)行，基于HRMS1-DIA工作流表現(xiàn)出長期運(yùn)行中保持的穩(wěn)定性，在不同儀器及實(shí)驗(yàn)室間產(chǎn)生的數(shù)據(jù)也有的重現(xiàn)性以及提供蛋白質(zhì)組學(xué)準(zhǔn)確定量結(jié)果。HRMS1-DIA工作流可對精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究中的大隊(duì)列生物樣品進(jìn)行高通量和深度的蛋白質(zhì)組定量。

 

HRMS1-DIA方案優(yōu)勢：

1、相對傳統(tǒng)DIA的二級碎片離子定量，基于超高分辨一級全掃描的HRMS1-DIA定量蛋白和多肽的數(shù)量和準(zhǔn)確性都有顯著提高（蛋白鑒定數(shù)目提高10%，CV<10%）

2、在HRMS1-DIA工作流正常運(yùn)行的狀態(tài)下，全部11個(gè)實(shí)驗(yàn)室，平均可以鑒定到超過8000個(gè)蛋白（1% protein FDR），定量超過6000個(gè)蛋白。

3、在定量準(zhǔn)確性方面，在1小時(shí)定量6000個(gè)蛋白，50000個(gè)肽段的超高通量下，HRMS1-DIA工作流提供93%的定量準(zhǔn)確性。

4、超高80%的蛋白可以在每天、每個(gè)實(shí)驗(yàn)室定量。

 

賽默飛HRMS1-DIA方案對于蛋白質(zhì)組學(xué)的臨床轉(zhuǎn)化具有極為廣泛的參考價(jià)值，超高的穩(wěn)定性、日間重復(fù)性成為臨床研究領(lǐng)域用戶期待的技術(shù)。

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