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珀金埃爾默企業(yè)管理(上海...

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推動行業(yè)轉(zhuǎn)型升級 | 百邁客攜手珀金埃爾默打造NGS全自動化實驗生產(chǎn)線

閱讀:486      發(fā)布時間:2022-6-9
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 在我國“十四五規(guī)劃”的國家戰(zhàn)略中,生命科學(xué)被納入引領(lǐng)性科技領(lǐng)域的重點攻關(guān)項目。其中,基因與生物技術(shù)領(lǐng)域重點研究包括基因組學(xué)應(yīng)用、遺傳細(xì)胞和遺傳育種、合成生物、生物醫(yī)藥等技術(shù)創(chuàng)新與研發(fā)。這為基因測序技術(shù)在中國的發(fā)展帶來重大機(jī)遇。從全球公共衛(wèi)生事件的病原追蹤、重大疾病的篩查診斷及治療的臨床需求端到基于NGS技術(shù)進(jìn)行的生物物種基因組學(xué)研究、遺傳群體育種研究的科研服務(wù)端,市場需求都在不斷發(fā)展和擴(kuò)容。如何推動NGS技術(shù)在科研服務(wù)領(lǐng)域的產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)型升級,助力行業(yè)高質(zhì)量發(fā)展成為擺在行業(yè)內(nèi)企業(yè)和研究者們面前的發(fā)展戰(zhàn)略問題。

作為中國基因測序領(lǐng)域的企業(yè),百邁客(Biomarker)為了更好地滿足客戶需求,于219月引進(jìn)explorer™ G3全自動超高通量NGS(二代測序)文庫構(gòu)建系統(tǒng),其高度集成化與智能化的自動化設(shè)備,在無人或人工干預(yù)極少的情況下,按照程序指令自動進(jìn)行樣本制備、文庫制備、文庫質(zhì)檢、信息處理等流程,配套成熟的流程控制和分析軟件,在智能化、高通量、自動化和數(shù)字化方面優(yōu)勢突出,可大大提高效率,降低操作難度。

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百邁客生物NGS全自動化實驗生產(chǎn)線在20219月份搭建完成并通過測試;20221月份,產(chǎn)線按照規(guī)劃設(shè)計指標(biāo)進(jìn)行了多方位驗收,驗收結(jié)果達(dá)到合同指標(biāo)要求。截至發(fā)稿,共完成微生物擴(kuò)增子樣品3萬例以上,二代微生物擴(kuò)增子建庫單流程通量可達(dá)1520例樣品/天;三代微生物擴(kuò)增子建庫單流程通量可達(dá)1900例樣品/天;微生物擴(kuò)增子建庫流程自動化占比達(dá)到70%以上,一次建庫成功率穩(wěn)定在90%以上、產(chǎn)出波動性CV值比手工降低18%、實驗交付周期平均縮短20%以上。

一套能完成擴(kuò)增子建庫的全自動化實驗生產(chǎn)線

百邁客通過大量的實驗積累和優(yōu)化,力推二代微生物擴(kuò)增子項目和三代微生物擴(kuò)增子項目上線,目前測試成功的業(yè)務(wù)線包括:16S全長,16S V3+V4,ITS1等常見擴(kuò)增區(qū)域;而普通轉(zhuǎn)錄組和重測序等項目,早期就已經(jīng)在自動化液體工作站上進(jìn)行大量技術(shù)積累,為順利整合到全自動化實驗生產(chǎn)線提供了極大助益。

更智能

配合LIMS系統(tǒng),實現(xiàn)自動下單,接收訂單后自動進(jìn)行時序規(guī)劃,自動啟動任務(wù),系統(tǒng)記錄試劑耗材用量并進(jìn)行預(yù)警提醒,真正做到無人值守,24小時不間斷運行。系統(tǒng)采用先進(jìn)的設(shè)計理念,通過條碼管理96孔板的整個“生命周期”,每一塊板自“出生”就帶有唯一條形碼,條碼全程可追溯,通過實時甘特圖可清楚的看到該條碼所在的設(shè)備,和正在進(jìn)行的實驗步驟,一系列不同條碼的孔板從自動化冰箱或儲板棧里推出,通過智能柔性機(jī)械手臂搬運到產(chǎn)線上各個自動化設(shè)備,最終再回到自動化冰箱或儲板棧。組成了我們的全自動化實驗標(biāo)準(zhǔn)步驟。

高通量

產(chǎn)線配套4PCR擴(kuò)增儀,2臺核酸片段分析儀,可使用384孔模式進(jìn)行檢測,預(yù)計24小時內(nèi)可完成1536個樣品(16板)。然而,追求高通量遠(yuǎn)不止如此,明年1月,將啟動通量升級,擴(kuò)展到8PCR儀,3臺自動化片段分析儀,通量再翻倍。

信息自動化

LIMS與自動化系統(tǒng)流程控制軟件無縫銜接,LIMS下單可直接啟動系統(tǒng)執(zhí)行生產(chǎn)任務(wù),產(chǎn)線在實驗過程中產(chǎn)生的檢測結(jié)果數(shù)據(jù),可直接回傳到LIMS。使用微流控技術(shù)進(jìn)行毛細(xì)管電泳,生成電子膠圖和峰圖取代傳統(tǒng)電泳圖,而且可批量導(dǎo)入電子圖片名稱,擺脫了常規(guī)電泳制膠、染膠、照膠等繁瑣步驟。

至此,百邁客貫通了從樣本提取到檢測、建庫、質(zhì)檢、出報告的實驗全流程自動化,信息化。

曾幾何時,我們欣喜于日益增漲的測序需求,也困惑于實驗自動化設(shè)備匱乏與滯后,今天百邁客站在了新的起點之上,結(jié)合自動化智能化為科研行業(yè)帶來更好的服務(wù)。


關(guān)于百邁客生物

百邁客生物(BioMarker)成立于20095月,是一家高新技術(shù)企業(yè),公司基于功能基因組學(xué)的BT+IT(高通量基因測序技術(shù)、生物信息技術(shù)、高性能生物云計算技術(shù))技術(shù),拓展出了科技服務(wù)、生物云、智能制造三大業(yè)務(wù)板塊;擁有以博士和碩士為主體的研發(fā)、生產(chǎn)團(tuán)隊;公司自成立以來,注重創(chuàng)新發(fā)展,科研成果成果層出不窮,先后在《Nature》、《Cell》、《Nature Genetics》、《Advanced Science》、《Nature Communications》等國際著名期刊上發(fā)表高質(zhì)量合作文章近千篇,累計影響因子超過4500分。擁有國家發(fā)明專利技術(shù)60余項,軟件著作權(quán)近200項。公司擁有Illumina、PacBioNanopore、BioNano、AB SCIEIX QTRAP, Waters Q-TOF等全面的測序平臺,滿足科研工作者多種科研需求,努力打造基因產(chǎn)業(yè)國際一流企業(yè),“為世界創(chuàng)造新的可能!”

關(guān)于珀金埃爾默

珀金埃爾默是知名的端到端解決方案提供商,幫助科學(xué)家、研究人員和臨床醫(yī)生更好地診斷疾病、發(fā)現(xiàn)新的個性化藥物、監(jiān)測食品的安全與質(zhì)量,并推進(jìn)卓越的環(huán)境及應(yīng)用分析。85年來,珀金埃爾默秉承為打造更健康的世界而持續(xù)創(chuàng)新的使命,不斷推動科學(xué)技術(shù)的進(jìn)步。在全球,我們擁有16,000多名專業(yè)人員,與商業(yè)、政府、學(xué)術(shù)及醫(yī)療健康領(lǐng)域的客戶保持密切合作,為之提供涵蓋儀器、試劑、檢測方法、自動化、信息化和戰(zhàn)略服務(wù)的全面解決方案,助力客戶加快工作流程,制定更好的決策。珀金埃爾默于1978年進(jìn)入中國,并建立了覆蓋研發(fā)、生產(chǎn)、銷售與服務(wù)的完整價值鏈,以先進(jìn)的產(chǎn)品和解決方案助力中國科研及醫(yī)療健康領(lǐng)域的創(chuàng)新突破。

 

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