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MDHS-0001-人源細胞STR鑒定

2024-10-16

產      地:
暫無
所在地區(qū):
北京北京市
有效期還剩 218舉報該信息

一、服務簡介

STR(Short Tandem Repeat,短串聯(lián)重復序列)是一類廣泛存在于真核生物基因組中的DNA 串聯(lián)重復序列,其核心序列重復次數(shù)存在個體差異多態(tài)性,因此STR也被稱為細胞的DNA指紋。據(jù)估計,已建立的細胞系中,約20%是錯誤的細胞類型或物種起源,約30%存在種間或種內交叉污染(ICLA受污染細胞清單)。細胞系的交叉污染和錯誤辨識已成為生物醫(yī)學基礎研究和生物醫(yī)藥產業(yè)的重大危害,并導致科學研究結論錯誤、結果不可重復、臨床細胞治療失敗等。因此NIH、ATCC、Science和Nature等機構多次發(fā)出呼吁并要求研究者對細胞進行鑒定。無論是文章投稿、基金申請、細胞治療還是構建細胞庫,細胞是否有“身份”都是重要環(huán)節(jié)。

本單位可以提供快速、可靠的人源細胞STR鑒定服務,出具用于論文發(fā)表的中文或中英文檢測報告,包括常規(guī)檢測(8個位點和1個性別決定位點,此9位點為投稿要求的必檢位點)、超常檢測(20個位點和1個性別決定位點)。

二、服務內容

(一)服務流程

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(二)服務特點

1.采用國際目前的STR檢測技術。ABI 3130xl DNA Analyzer(Applied Biosystems®)進行分析;檢測結果用 GeneMapper ID-X  v1.5 (Applied Biosystems®)軟件進行分析。

2.靈敏度高??梢澡b別細胞樣本中含有的少量其他人源細胞污染,檢測線為皮克級:30pg/μL。

3.參考國際細胞鑒定委員會(ICLAC)發(fā)布的細胞鑒定標準:人源細胞鑒定采用STR檢測方法。其中舊版(ASN-0002-2011):包含8個STR基因座位點。新版(ASN-002-2022)建議包含13個及以上STR基因座位點。

4.鑒定報告中文版或中英版(自選),以及圖譜(見人源細胞STR分型檢測圖譜)。報告列舉和標準細胞庫匹配度≥80%的細胞STR數(shù)據(jù)列表,同時附上STR分型數(shù)據(jù)結果在標準細胞庫的比對截圖,使結果更加直觀,便于分析理解。

5.種屬鑒定作為輔助檢測。當對樣本進行人源細胞STR分型檢測時,發(fā)現(xiàn)是非人源的,則進行種屬鑒定,確認樣本種屬。

(三)注意事項

1.樣品寄送:用戶提供DNA或細胞 樣本,加冰袋運輸;同時請注明細胞數(shù)量或DNA含量,DNA 含量大于50ng/μl,體積大于20μl。如提供細胞,請?zhí)峁㏄BS細胞懸浮液,離心沉淀,去上清液,可常溫特快專遞運輸(京外客戶推薦方法);細胞數(shù)量≥106個。

2.正常檢測周期5-7個工作日,加急2-3個工作日。同時,可以提供人源細胞STR分型檢測整體解決方案,即提供ABI 3130xl和配套的試劑軟件,技術培訓,實現(xiàn)自行檢測,控制檢測時間。

3.本單位所提供的人源細胞STR分型檢測可分為科研級,工業(yè)級??蒲袡z測:遵循ISO17025原則,樣本、數(shù)據(jù)長期保存,不支持現(xiàn)場審查;工業(yè)級:遵循ISO17025原則,樣本、數(shù)據(jù)長期保存,支持現(xiàn)場審查。

(四)結果交付

檢測結果以電子版的形式發(fā)放到訂單或合同上面預留的郵箱,書面報告可根據(jù)需要隨時提供,寄送到貴單位。

三、人源細胞STR鑒定21位點

人類細胞21個基因座檢測。目前基因座最多的檢測服務,所選用的基因座不僅包含ATCC和JCRB細胞庫中的基因座,更添加11個高度多態(tài)性位點,可方便與數(shù)據(jù)庫進行比對,準確性高。位點如下:

<strong>人源細胞STR鑒定</strong>位點.jpg

比對數(shù)據(jù)庫:ATCC、DSMZ、JCRB、COG、ECACC、KCLB、ICLC...

備注:
1.根據(jù) ANSI 制定的國際標準,細胞系的匹配度≥80% 時,認為它們具有相關性,即衍生于共同的祖先細胞;匹配度在 55% 至 80% 之間,需要進一步驗證相關性;小于 55%,表明兩者不具有相關性。
2.有效峰為真實的PCR 條帶;小峰和非特異性條帶在計算中忽略不計。
3.本匹配度計算默認依照 ATCC 的計算規(guī)則,少數(shù)情況時依照 DSMZ 的計算規(guī)則,若有個性化需求委托方可提前提出。
4.委托方細胞樣本若為干細胞,免疫細胞,原代細胞等細胞,且未提交至公開數(shù)據(jù)庫,STR 數(shù)據(jù)與數(shù)據(jù)庫比對無意義。
5.STR 數(shù)據(jù)比對默認 ATCC,DSMZ,JCRB 等細胞庫,也可比對 ECACC,COG,CBA,KCLB 等數(shù)據(jù)庫或文獻,需提前注明被檢樣本的比對來源。



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