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熒光修飾可以通過共價鍵的形式連接在多肽序列的N端或C端,但是更推薦在N端進(jìn)行修飾。 以下為星肽生物常用熒光修飾以及發(fā)光顏色。
熒光標(biāo)記肽結(jié)合成像技術(shù)后可用于識別特定靶點(diǎn)。共聚焦或熒光顯微鏡的體外成像仍然是研究細(xì)胞內(nèi)各種生物過程和相互作用十分有效的方法之一。與蛋白質(zhì)不同,這些肽定位于肌動蛋白上的特定靶點(diǎn),不易聚集蛋白質(zhì),因此非常適合于體外跟蹤。同樣,FITC標(biāo)記的CPP也可被用于細(xì)胞內(nèi)組分的成像,且其細(xì)胞毒性低。
其中,FITC 是一種胺活性的熒光染料,可廣泛的用于熒光標(biāo)記肽和蛋白質(zhì)。星肽生物在N端標(biāo)記Fitc,都會建議在后面一個氨基和由異硫氰酸酯與氨基反應(yīng)產(chǎn)生的硫脲鍵之間引入烷基間隔器(alkyl spacer)如Ahx。鏈接切割需要酸性環(huán)境,在N端標(biāo)記FITC的多肽需經(jīng)歷環(huán)化作用來形成熒光素,通常會伴有后面一個氨基酸的去除,但當(dāng)有一個間隔器如Ahx,或者是通過非酸性環(huán)境將目的肽從樹脂上切下來時,這種情況可避免。空間位阻被認(rèn)為是在熒光染料前使用Ahx的主要原因,而不是為什么FITC不能直接偶聯(lián)在多肽上的原因。
對于較長的序列,建議使用 FRET pairs (fluorescence resonance energy transfer pairs)進(jìn)行修飾。
熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)是描述兩個熒光團(tuán)之間的能量轉(zhuǎn)移的機(jī)制。由于FRET效率部分基于供體和受體分子之間的距離,因此該技術(shù)通常用于研究酶效率,蛋白質(zhì) - 蛋白質(zhì)相互作用或其他分子動力學(xué)。(當(dāng)肽保持完整時,受體分子將淬滅供體分子,并且不會檢測到熒光。如果序列被蛋白酶活性切割,則受體將不再淬滅供體,并且將檢測到熒光信號)
FRET肽是研究肽酶特異性的便利工具,由于其反應(yīng)過程可被連續(xù)監(jiān)測,為酶性的檢測提供了一個便捷的方法。
供體/受體對的肽鍵水解后產(chǎn)生的熒光可衡量納摩爾級濃度的酶活性。當(dāng)FRET肽是完整的,表現(xiàn)出的是內(nèi)部的熒光猝滅,但當(dāng)供體/受體對的任何肽鍵斷裂就會釋放出熒光,此熒光可被連續(xù)檢測,從而可對酶的活性進(jìn)行定量分析。
FRET 肽可作為各類酶研究的合適底物,比如:
1. 肽酶、蛋白酶、激酶、磷酸酶的動力特征和功能特征。
2. 對新的蛋白水解酶的篩選和檢測。
3. 對多肽折疊的構(gòu)象研究。