MDHS-0001 人源細(xì)胞STR鑒定

一、服務(wù)簡(jiǎn)介

      STR（Short Tandem Repeat，短串聯(lián)重復(fù)序列）是一類廣泛存在于真核生物基因組中的DNA 串聯(lián)重復(fù)序列，其核心序列重復(fù)次數(shù)存在個(gè)體差異多態(tài)性，因此STR也被稱為細(xì)胞的DNA指紋。據(jù)估計(jì)，已建立的細(xì)胞系中，約20%是錯(cuò)誤的細(xì)胞類型或物種起源，約30%存在種間或種內(nèi)交叉污染(ICLA受污染細(xì)胞清單)。細(xì)胞系的交叉污染和錯(cuò)誤辨識(shí)已成為生物醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究和生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的重大危害，并導(dǎo)致科學(xué)研究結(jié)論錯(cuò)誤、結(jié)果不可重復(fù)、臨床細(xì)胞治療失敗等。因此NIH、ATCC、Science和Nature等機(jī)構(gòu)多次發(fā)出呼吁并要求研究者對(duì)細(xì)胞進(jìn)行鑒定。無論是文章投稿、基金申請(qǐng)、細(xì)胞治療還是構(gòu)建細(xì)胞庫(kù)，細(xì)胞是否有“身份”都是重要環(huán)節(jié)。

      本單位可以提供快速、可靠的人源細(xì)胞STR鑒定服務(wù)，出具用于論文發(fā)表的中文或中英文檢測(cè)報(bào)告，包括常規(guī)檢測(cè)（8個(gè)位點(diǎn)和1個(gè)性別決定位點(diǎn)，此9位點(diǎn)為投稿要求的必檢位點(diǎn)）、超常檢測(cè)（20個(gè)位點(diǎn)和1個(gè)性別決定位點(diǎn)）。

二、服務(wù)內(nèi)容

（一）服務(wù)流程

（二）服務(wù)特點(diǎn)

      1．采用國(guó)際目前的STR檢測(cè)技術(shù)。ABI 3130xl DNA Analyzer(Applied Biosystems®)進(jìn)行分析；檢測(cè)結(jié)果用 GeneMapper ID-X  v1.5 (Applied Biosystems®)軟件進(jìn)行分析。

      2．靈敏度高?？梢澡b別細(xì)胞樣本中含有的少量其他人源細(xì)胞污染，檢測(cè)線為皮克級(jí)：30pg/μL。

      3．參考國(guó)際細(xì)胞鑒定委員會(huì)（ICLAC）發(fā)布的細(xì)胞鑒定標(biāo)準(zhǔn)：人源細(xì)胞鑒定采用STR檢測(cè)方法。其中舊版（ASN-0002-2011）：包含8個(gè)STR基因座位點(diǎn)。新版（ASN-002-2022）建議包含13個(gè)及以上STR基因座位點(diǎn)。

      4．鑒定報(bào)告中文版或中英版（自選），以及圖譜（見人源細(xì)胞STR分型檢測(cè)圖譜）。報(bào)告列舉和標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞庫(kù)匹配度≥80%的細(xì)胞STR數(shù)據(jù)列表，同時(shí)附上STR分型數(shù)據(jù)結(jié)果在標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞庫(kù)的比對(duì)截圖，使結(jié)果更加直觀，便于分析理解。

      5．種屬鑒定作為輔助檢測(cè)。當(dāng)對(duì)樣本進(jìn)行人源細(xì)胞STR分型檢測(cè)時(shí)，發(fā)現(xiàn)是非人源的，則進(jìn)行種屬鑒定，確認(rèn)樣本種屬。

（三）注意事項(xiàng)

      1．樣品寄送：用戶提供DNA或細(xì)胞 樣本，加冰袋運(yùn)輸；同時(shí)請(qǐng)注明細(xì)胞數(shù)量或DNA含量，DNA 含量大于50ng/μl，體積大于20μl。如提供細(xì)胞，請(qǐng)?zhí)峁㏄BS細(xì)胞懸浮液，離心沉淀，去上清液，可常溫特快專遞運(yùn)輸（京外客戶推薦方法）；細(xì)胞數(shù)量≥10⁶個(gè)。

      2．正常檢測(cè)周期5-7個(gè)工作日，加急2-3個(gè)工作日。同時(shí)，可以提供人源細(xì)胞STR分型檢測(cè)整體解決方案，即提供ABI 3130xl和配套的試劑軟件，技術(shù)培訓(xùn)，實(shí)現(xiàn)自行檢測(cè)，控制檢測(cè)時(shí)間。

      3．本單位所提供的人源細(xì)胞STR分型檢測(cè)可分為科研級(jí)，工業(yè)級(jí)?？蒲袡z測(cè)：遵循ISO17025原則，樣本、數(shù)據(jù)長(zhǎng)期保存，不支持現(xiàn)場(chǎng)審查；工業(yè)級(jí)：遵循ISO17025原則，樣本、數(shù)據(jù)長(zhǎng)期保存，支持現(xiàn)場(chǎng)審查。

（四）結(jié)果交付

      檢測(cè)結(jié)果以電子版的形式發(fā)放到訂單或合同上面預(yù)留的郵箱，書面報(bào)告可根據(jù)需要隨時(shí)提供，寄送到貴單位。

三、人源細(xì)胞STR鑒定21位點(diǎn)

      人類細(xì)胞21個(gè)基因座檢測(cè)。目前基因座最多的檢測(cè)服務(wù)，所選用的基因座不僅包含ATCC和JCRB細(xì)胞庫(kù)中的基因座，更添加11個(gè)高度多態(tài)性位點(diǎn)，可方便與數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)，準(zhǔn)確性高。位點(diǎn)如下：

比對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)：ATCC、DSMZ、JCRB、COG、ECACC、KCLB、ICLC...

備注：
1.根據(jù) ANSI 制定的國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)，細(xì)胞系的匹配度≥80% 時(shí)，認(rèn)為它們具有相關(guān)性，即衍生于共同的祖先細(xì)胞；匹配度在 55% 至 80% 之間，需要進(jìn)一步驗(yàn)證相關(guān)性；小于 55%，表明兩者不具有相關(guān)性。
2.有效峰為真實(shí)的PCR 條帶;小峰和非特異性條帶在計(jì)算中忽略不計(jì)。
3.本匹配度計(jì)算默認(rèn)依照 ATCC 的計(jì)算規(guī)則，少數(shù)情況時(shí)依照 DSMZ 的計(jì)算規(guī)則，若有個(gè)性化需求委托方可提前提出。
4.委托方細(xì)胞樣本若為干細(xì)胞，免疫細(xì)胞，原代細(xì)胞等細(xì)胞，且未提交至公開數(shù)據(jù)庫(kù)，STR 數(shù)據(jù)與數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)無意義。
5.STR 數(shù)據(jù)比對(duì)默認(rèn) ATCC，DSMZ，JCRB 等細(xì)胞庫(kù)，也可比對(duì) ECACC,COG,CBA,KCLB 等數(shù)據(jù)庫(kù)或文獻(xiàn)，需提前注明被檢樣本的比對(duì)來源。