MDHS-0002 小鼠細(xì)胞STR鑒定

一、小鼠細(xì)胞STR鑒定服務(wù)簡介

      STR（Short Tandem Repeat，短串聯(lián)重復(fù)序列）是一類廣泛存在于真核生物基因組中的DNA 串聯(lián)重復(fù)序列，其核心序列重復(fù)次數(shù)存在個體差異多態(tài)性，因此STR也被稱為細(xì)胞的DNA指紋。據(jù)估計，已建立的細(xì)胞系中，約20%是錯誤的細(xì)胞類型或物種起源，約30%存在種間或種內(nèi)交叉污染(ICLA受污染細(xì)胞清單)。細(xì)胞系的交叉污染和錯誤辨識已成為生物醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究和生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的重大危害，并導(dǎo)致科學(xué)研究結(jié)論錯誤、結(jié)果不可重復(fù)、臨床細(xì)胞治療失敗等。因此NIH、ATCC、Science和Nature等機(jī)構(gòu)多次發(fā)出呼吁并要求研究者對細(xì)胞進(jìn)行鑒定。無論是文章投稿、基金申請、細(xì)胞治療還是構(gòu)建細(xì)胞庫，細(xì)胞是否有“身份”都是重要環(huán)節(jié)。

     依據(jù)美國國家標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)研究所NIST 和ATCC 建議的9個四堿基重復(fù)位點：18-3、9-2、6-7、5-5、X-1、15-3、12-1、6-4、4-2和Jarid1。并額外添加人源位點CSF1PO和vWA，用于鑒定人鼠細(xì)胞交叉污染。

    美德華生小鼠細(xì)胞STR鑒定：本科研單位實驗室20位點的小鼠細(xì)胞STR分型檢測：18-3、4-2、6-7、19-2、1-2、7-1、8-1、1-1、3-2、2-1、15-3、6-4、13-1、11-2、17-2、12-1、5-5、X-1   + TH01、D5S818。采用人鼠復(fù)合擴(kuò)增體系檢測人類細(xì)胞中的小鼠細(xì)胞污染，主要應(yīng)用在干細(xì)胞研究領(lǐng)域。同時可以用于判斷人鼠細(xì)胞混淆的情況。

二、小鼠細(xì)胞STR鑒定服務(wù)內(nèi)容

（一）小鼠細(xì)胞STR鑒定服務(wù)流程

（二）小鼠細(xì)胞STR鑒定服務(wù)特點

      1．采用國際目前的STR檢測技術(shù)。采用小鼠基因分型試劑盒（Mouse STR v3.0）對18-3、4-2、6-7、19-2、1-2、7-1、8-1、1-1、3-2、2-1、15-3、6-4、13-1、11-2、17-2、12-1、5-5、X-1等18個小鼠STR位點（與CELLOSAUROUS數(shù)據(jù)庫一致）和2個人源STR位點（同時監(jiān)控是否有人源細(xì)胞交叉污染）進(jìn)行復(fù)合擴(kuò)增，在ABI 3130XL型遺傳分析儀上對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行檢測。

      2．靈敏度高。可以鑒別細(xì)胞樣本中含有的少量其他人源和小鼠細(xì)胞污染，檢測線為皮克級。

      3．參考國際細(xì)胞鑒定委員會（ICLAC）發(fā)布的細(xì)胞鑒定標(biāo)準(zhǔn)：其中舊版（ASN-0002-2011）。

      4．鑒定報告中文版或中英版（自選），以及圖譜（見小鼠細(xì)胞STR分型檢測圖譜）。報告列舉和標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞庫匹配度≥80%的細(xì)胞STR數(shù)據(jù)列表，同時附上STR分型數(shù)據(jù)結(jié)果在標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞庫的比對截圖，使結(jié)果更加直觀，便于分析理解。

      5．種屬鑒定作為輔助檢測。當(dāng)對樣本進(jìn)行小鼠細(xì)胞STR分型檢測時，發(fā)現(xiàn)是非小鼠的，則進(jìn)行種屬鑒定，確認(rèn)樣本種屬。

（三）小鼠細(xì)胞STR鑒定注意事項

      1．樣品寄送：用戶提供DNA或細(xì)胞 樣本，加冰袋運輸；同時請注明細(xì)胞數(shù)量或DNA含量，DNA 含量大于50ng/μl，體積大于20μl。如提供細(xì)胞，請?zhí)峁㏄BS細(xì)胞懸浮液，離心沉淀，去上清液，可常溫特快專遞運輸（京外客戶推薦方法）；細(xì)胞數(shù)量≥10⁶個。

      2．正常檢測周期5-7個工作日，加急2-3個工作日。同時，可以提供小鼠細(xì)胞STR分型檢測整體解決方案，即提供ABI 3130xl和配套的試劑軟件，技術(shù)培訓(xùn)，實現(xiàn)自行檢測，控制檢測時間。

      3．本單位所提供的小鼠細(xì)胞STR分型檢測可分為科研級，工業(yè)級?？蒲袡z測：遵循ISO17025原則，樣本、數(shù)據(jù)長期保存，不支持現(xiàn)場審查；工業(yè)級：遵循ISO17025原則，樣本、數(shù)據(jù)長期保存，支持現(xiàn)場審查。

（四）小鼠細(xì)胞STR鑒定結(jié)果交付

      檢測結(jié)果以電子版的形式發(fā)放到訂單或合同上面預(yù)留的郵箱，書面報告可根據(jù)需要隨時提供，寄送到貴單位。

三、小鼠細(xì)胞STR鑒定20位點

      小鼠細(xì)胞20個基因座檢測：18個小鼠位點+2個人源位點。位點如下：