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三磷酸循環(huán)系列試劑盒 一管式點突變試劑盒
One-Stop Point mutation Kit
產(chǎn)品及特點
基因的定點突變是重要的分子生物學(xué)技術(shù),廣泛用于載體構(gòu)建、基因改造、蛋白質(zhì)功能研
究等領(lǐng)域。但傳統(tǒng)的方法需要使用單鏈 DNA 模板,而得到單鏈 DNA 模板又需要先將基因克
隆到類似 M13 這種載體中,操作過程冗長。為了克服這些缺點,本公司將突變位點設(shè)計到一
對互補的引物中,用高保真擴增質(zhì)粒模板,然后用 Dpn I 去除原始的甲基化模板,新合成的
DNA 通過互補形成帶切口的雙鏈質(zhì)粒,直接用于轉(zhuǎn)化感受態(tài)細菌。本方法過程示意圖如下:
本產(chǎn)品具有下列特點:
1. 直接使用質(zhì)粒 DNA 作為模板,免去了制備單鏈 DNA 的步驟。
2. 基于高保真 PCR,對模板 DNA 序列沒特殊要求,可以用于突變?nèi)魏涡蛄?。同時對模板的需求量很少。
3. 一管式,全部在一個優(yōu)化的緩沖體系中完成,非常簡單。
4. 使用 Dpn I 去除未突變模板,突變效率高達 90%。
5. 可用于制備點突變,缺失突變和插入突變。
6. 本產(chǎn)品 A 型適用于 8 kb 一下,B 型適用于 8-15 kb。
規(guī)格及成分
成 份 A 型10次包裝 B型10次包裝
高保真酶A型 10 uL 無
高保真酶B型 無 10 uL
5×高保真酶 Buffer A 型 100 uL 無
5×高保真酶 Buffer B 型 無 100 uL
dNTP(2.5 mM each) 50 uL 50 uL
Dpn I 酶 10 uL 10 uL
超純水 1 mL 1 mL
使用手冊 1 份 1 份
運輸及保存 低溫運輸、-20℃保存, 有效期一年。
自備試劑 質(zhì)粒 DNA、突變引物、細菌轉(zhuǎn)化試劑
使用方法
一、 引物設(shè)計及注意事項
用于特定基因突變的引物必須用戶單獨設(shè)計,請參考如下一些基本原則進行設(shè)計。
1. 共需設(shè)計兩條*互補的一對引物, 它們覆蓋要擴增的突變區(qū)位點, 突變位點好放在引物的中心??梢韵燃性O(shè)計一條,然后就可得互補的另一條引物。
2. 引物的長度通常為 25-45 個堿基。引物中突變位點任何一側(cè)都必需滿足 Tm 大于45 的條件,Tm 計算方式為 Tm=4×(GC 堿基數(shù))+2×(AT 堿基數(shù))。例如引物agtcaggccaattcgAAGcagtcgaattgccaag 就達到此標(biāo)準(zhǔn),它的突變位點 AAG 所放位置使左側(cè) Tm=46;右側(cè) Tm=48,均大于 45。
3. 盡量把引物的 GC 含量控制在 40%-60%,結(jié)尾的 1-3 個堿基好是 G 或 C。
4. 盡量使引物不要產(chǎn)生非常穩(wěn)定的二級結(jié)構(gòu)和引物二聚體。
5. 好使用經(jīng)過 PAGE 純化的引物或更高純度的引物。
二、待突變模板質(zhì)粒的選擇
1. 必需使用從 dam+的大腸桿菌(這類菌中質(zhì)粒可以被甲基化)中抽提得到的質(zhì)粒用于基因定點突變,否則 Dpn I 不能把沒有酶切的質(zhì)粒 DNA 切除,產(chǎn)生大量的假陽性。必需使用從 dam+的大腸桿菌(這類菌中質(zhì)??梢员患谆?中抽提得到的質(zhì)粒用于基因定點突變,否則 Dpn I 不能把沒有酶切的質(zhì)粒 DNA 切除,產(chǎn)生大量的假陽性。
常用的大部分大腸桿菌都是 dam+的,包括 DH5α、JM109 等。不能使用 JM110和 SCS110 以及其它 dcm-菌種。
2. 待突變質(zhì)粒和目的基因的 GC 含量應(yīng)該在 40-55%,沒有任何 GC 含量超過 70%、長度在 50bp 以上的區(qū)域。如果質(zhì)粒 GC 含量過高,請先把目的基因克隆到其它合適的載體上,再進行基因定點突變反應(yīng)。如果目的基因 GC 含量過高,而突變位點不在高 GC 含量區(qū)域,可以先把該基因的不含高 GC 含量的一個區(qū)域克隆出來,進行定點突變,然后再把突變后的片斷克隆回原基因中。如果突變位點在高 GC 區(qū),則可以使用高 GC PCR 反應(yīng)試劑。
三、 基因定點突變反應(yīng)
1. 在一個塑料離心管中加入下列成分:
待突變模板質(zhì)粒 0.1-0.5 ug
5×高保真酶 Buffer 5 uL
引物一 (10-20 uM) 1 uL
引物二 (10-20 uM) 1 uL
dNTP Mix (2.5 mM each) 4 uL
補水到 49 uL
2. 加入 1 uL 高保真 DNA 聚合酶,混勻,如果 PCR 儀沒有熱蓋則需要加少量石蠟油。
放入 PCR 儀器中按下面參數(shù)進行 PCR:
步驟 | 溫度 | 時間 | 循環(huán)數(shù) |
變性 | 95℃ | 1 分鐘 | 1 次 |
PCR(注:只 18 次循環(huán)) | 95℃ | 40 秒 | 18 次 |
PCR(注:只 18 次循環(huán)) | 60℃ | 1 分鐘 | 18 次 |
PCR(注:只 18 次循環(huán)) | 68℃ | 1 分鐘/Kb | 18 次 |
延伸 | 72℃ | 10 分鐘 | 1 次 |
保存 | 4℃ | 長時間保持 |
四、Dpn I 消化:
PCR 反應(yīng)后,直接在 PCR 反應(yīng)體系中加入 1uL Dpn I 內(nèi)切酶 (該酶在甘油保存液中會下沉到管底,故用前需要充分混勻) 。DpnI 可以酶切雙鏈都被甲基化的模板質(zhì)粒,也能降解一條鏈被甲基化的雙鏈質(zhì)粒?;靹蚝?37℃孵育 2 小時后樣品可以直接用于轉(zhuǎn)化,或者-20℃保存?zhèn)溆谩?/span>
五. 轉(zhuǎn)化、挑克隆鑒定:
每 100 微升感受態(tài)細菌 (轉(zhuǎn)化效率必須在 10 7 /ug以上) 中可以加入 5-10 微升經(jīng)過DpnI消化后的突變產(chǎn)物,按照所使用的感受態(tài)細菌的操作方法進行操作。如果PCR使用了石蠟油,在轉(zhuǎn)化時千萬別把它帶入轉(zhuǎn)化反應(yīng),否則會嚴重影響轉(zhuǎn)化效率。在涂板前通過離心濃縮的辦法,把所有被轉(zhuǎn)化后的細菌全部涂布到含有適當(dāng)抗生素的平板上培養(yǎng)。通常會得到 50 個以下的克隆,可按常規(guī)方法制備質(zhì)粒并測序。
六、常見問題:
1. 轉(zhuǎn)化后沒有克隆或克隆數(shù)極少:(1) 感受態(tài)細菌效率不夠高,請檢測一下感受態(tài)細胞的效率,確保轉(zhuǎn)化效率在 10 7 /ug。(2) 把Dpn I消化后的產(chǎn)物用常規(guī)的乙醇沉淀濃縮,這樣就可以把所有的產(chǎn)物全部用于轉(zhuǎn)化。(3) 優(yōu)化基因定點突變中的PCR參數(shù)。可以把初的 95℃變性時間延長為 2 分鐘,循環(huán)中 95℃變性的時間延長 1 分鐘,把循環(huán)中的 68℃的延伸時間改為 1.5 分鐘/kb 2 分鐘/kb,退火可以改為 60-55℃或 65-55℃等的touch down,退火時間也可以適當(dāng)延長。(4) 引物設(shè)計有問題。通過突變反應(yīng)中的PCR沒有很好地擴增出預(yù)期的突變質(zhì)粒。
2. 有克隆, 但沒有或很難檢測到預(yù)期的突變克?。?(1) 使用的待突變的模板質(zhì)粒量過多,導(dǎo)致 Dpn I 消化時不*,可減少質(zhì)粒用量。
3. 有突變克隆,但突變位點不是預(yù)期的位點:(1) 引物設(shè)計不佳,退火溫度過低,導(dǎo)致引物退火到錯誤的地方。(2) 引物質(zhì)量較差,沒有經(jīng)過 PAGE 純化。這樣引物中通常會含有比設(shè)計的引物要短的特異性較差的引物,容易導(dǎo)致非預(yù)期的突變。
三磷酸循環(huán)系列試劑盒 一管式點突變試劑盒訂購說明:
1、絕大部分產(chǎn)品備有現(xiàn)貨,一般情況下都能訂貨當(dāng)日發(fā)貨。
2、部分非常用產(chǎn)品,需提前1-2日預(yù)訂,海外期貨則需要提前3-6周預(yù)訂。
3、部分產(chǎn)品價格會因貨期、批次等因素發(fā)生變化,若有變動以訂貨當(dāng)日新價格為準(zhǔn)。
4、每日訂單截止時間為16點整,部分城市可到17點整,因超過截止時間造成當(dāng)日不能發(fā)貨的將于次日安排發(fā)貨。
5、請辦理完貨款后,將收據(jù)、底單等連同收貨人的地址、姓名、等以傳真、、短信、等形式通知我們。
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