LncRNA芯片定制檢測(cè)服務(wù)
實(shí)驗(yàn)技術(shù)簡(jiǎn)介:長(zhǎng)鏈非編碼RNA (long non-coding RNA, IncRNA) 是一類轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度超過(guò)200nt、 不編碼蛋白的RNA。IncRNA起初被認(rèn)為是基因組轉(zhuǎn)錄的“噪音”,不具有生物學(xué)功能。然而,近年來(lái)的研究表明IncRNA能在表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后水平上調(diào)控基因表達(dá),參與了X染色體沉默、基因組印記以及染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄激活、轉(zhuǎn)錄干擾、核內(nèi)運(yùn)輸?shù)榷喾N重要的調(diào)控過(guò)程,與人類疾病的發(fā)生、發(fā)展和防治都有著密切聯(lián)系。
雖然越來(lái)越多的IncRNA被發(fā)現(xiàn),但是人們現(xiàn)在了解到的IncRNA只是冰山一角,絕大部分的IncRNA的功能仍然是不清楚的。目前主要通過(guò)IncRNA芯片或新-代測(cè)序等方法對(duì)IncRNA進(jìn)行功能研究。 現(xiàn)階段,基因芯片技術(shù)發(fā)展趨于成熟穩(wěn)定,在此平臺(tái)上,通過(guò)設(shè)計(jì)不同的IncRNA探針,可以更加快速、高通量地篩選出疾病或特定生物學(xué)過(guò)程中差異表達(dá)的IncRNA和mRNA信息,終找到IncRNA的靶基因 位點(diǎn)深入分析調(diào)控機(jī)制。
實(shí)驗(yàn)操作流程:
1、樣品RNA抽屜、質(zhì)檢
2、cDNA/aRNA樣品合成和標(biāo)記
3、芯片雜交
4、洗滌、染色、掃描
5、圖像采集和數(shù)據(jù)分析
IncRNA芯片數(shù)據(jù)- -IncRNA差異 表達(dá)基因的篩選一對(duì)IncRNA重新注釋mRNA差異表達(dá)基因的篩選-→G0分析,pathway分析IncRNA與mRNA共表達(dá)分析
客戶提供:
1、實(shí)驗(yàn)對(duì)象為組織樣品,取適量(50-100mg) 新鮮組織樣品或正確保存的組織樣品,使用
BioPulverizerTM冰凍粉碎組織,加1m的RNA抽提試劑TRIzol (Invitrogen),使用Mini-Bead-Beater-16勻漿后抽提RNA。
2、實(shí)驗(yàn)對(duì)象為細(xì)胞樣品,每份樣品取1x106 ~ 1x107細(xì)胞,加1m的RNA抽提試劑TRIzol (樣品為貼壁細(xì)胞,每10cm2培養(yǎng)皿TRIzo使用量為1m),裂解后抽提RNA。
交付標(biāo)準(zhǔn):
1、芯片檢測(cè)數(shù)據(jù)
2、完整的實(shí)驗(yàn)操作規(guī)程、實(shí)驗(yàn)報(bào)告 (含軟件分析結(jié)果)以及實(shí)驗(yàn)材料
實(shí)驗(yàn)代做服務(wù):
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