非標(biāo)定量(Label-free)實(shí)驗(yàn)
非標(biāo)定量(Label-free)
非標(biāo)定量(Label-fiee) :是一種非標(biāo)記的差異蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),不需要使用同位素標(biāo)記物標(biāo)記肽段,直接根據(jù)質(zhì)譜峰的信號(hào)強(qiáng)度來對(duì)肽段或蛋白進(jìn)行相對(duì)定量。Label-free通過HPLC分級(jí)液質(zhì)聯(lián)用對(duì)酶解肽段進(jìn)行分析. 現(xiàn)在基于質(zhì)譜的非標(biāo)定量技術(shù)主要有兩種: 一是根據(jù)一級(jí)質(zhì)譜相關(guān)的肽段峰強(qiáng)度以及峰面積等信息進(jìn)行蛋白定量,二是根據(jù)蛋白對(duì)應(yīng)肽段的二級(jí)質(zhì)譜總數(shù)(spectral counts)進(jìn)行定量。
實(shí)驗(yàn)步驟
1.蛋白前期處理,包括去除核酸,蛋白純化定量,SDS聚丙烯酰氨凝膠電泳;
2.蛋白質(zhì)膠內(nèi)酶切;
3.多肽純化; .
4.多肽混合物的質(zhì)譜分析,包括質(zhì)譜鑒定和定量信息比較;
5.生信分析
結(jié)果展示
實(shí)驗(yàn)周期及交付標(biāo)準(zhǔn)
1.實(shí)驗(yàn)周期: 4-6周
2.交付標(biāo)準(zhǔn):蛋白定量結(jié)果、鑒定結(jié)果、質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)、生信分析結(jié)果(G0分析. KEGG分析等等)
需確認(rèn)的信息
1.樣本的種屬
2.樣本的類型(組織or細(xì)胞or血液)
3.樣本的數(shù)量及分組
4.分析要求
參考文獻(xiàn)
[1]HuS, Qiu N, Liu Y , et al. Identification and comparative proteomic study of quail and duck egg white protein using 2-dimensional gel electrophoresis and matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight tandem mass spectrometryanalysis[J]. Poultry Science, 2016:pew033.
[2] Bouvet M , Turkieh A,Acosta-Martin A E , et al. Proteomic Profiling of Macrophages by 2D Electrophoresis[J]. Journal
of Visualized Experiments, 2014(93).
實(shí)驗(yàn)代做服務(wù):
實(shí)驗(yàn)室代做實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目
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| 染色質(zhì)免疫沉淀分析(CLIP)實(shí)驗(yàn)服務(wù)
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