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大腸桿菌感受態(tài)也有“身份正”?

2021-5-10  閱讀(1960)

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什么是感受態(tài)?

感受態(tài)細(xì)胞(competent cell):是指受體(宿主)細(xì)胞最易接受外源DNA片段并實(shí)現(xiàn)其轉(zhuǎn)化的一種生理狀態(tài)。主要原理是通過(guò)處理使細(xì)胞的通透性變大(細(xì)胞膜表面出現(xiàn)一些孔洞),便于外源基因或載體進(jìn)入感受態(tài)細(xì)胞,在感受態(tài)細(xì)胞中得到復(fù)制擴(kuò)增,得到多個(gè)拷貝的外源基因或載體。

 

感受態(tài)的分類(lèi)

 

 
 

根據(jù)不同實(shí)驗(yàn)?zāi)康?,感受態(tài)細(xì)胞來(lái)源有原核受體細(xì)胞(大腸桿菌G-、乳酸菌G+、枯草桿菌G+ 和真核受體細(xì)胞(酵母菌、動(dòng)植物、昆蟲(chóng)等)。大腸桿菌作為構(gòu)建普通質(zhì)粒、病毒載體和各種文庫(kù)以及異源蛋白表達(dá)的重要工具,其相應(yīng)的感受態(tài)在分子克隆實(shí)驗(yàn)與蛋白表達(dá)實(shí)驗(yàn)中是極其重要的。

 

 

不同感受態(tài)的區(qū)別是什么呢?

目前市面上的大腸桿菌細(xì)胞種類(lèi)相當(dāng)多,其都是為了特定的目的而構(gòu)建的,比如:高速生長(zhǎng)/分裂,高通量克隆,普通克隆等。那不同的感受態(tài)之間的區(qū)別是什么呢?答案是基因型(即感受態(tài)的身份正),不同基因型的大腸桿菌可以滿(mǎn)足不同的實(shí)驗(yàn)?zāi)康摹?/font>

 

感受態(tài)說(shuō)明書(shū)的基因型部分寫(xiě)的recA,deoR,lacZ,DE3,pLysS都代表什么意義呢?今天小翌根據(jù)幾個(gè)方向的實(shí)驗(yàn)?zāi)康慕o大家介紹一些常見(jiàn)的基因型以及意義。

 

1、提高外源質(zhì)粒的完整性和穩(wěn)定性

基因型

意義

recA

recA基因表達(dá)ATP依賴(lài)型DNA重組酶,其缺陷型可以降低DNA重組(recombination)的概率。

dam/dcm

消除宿主對(duì)腺嘌呤(Adenine)和胞嘧啶(Cytosine)的甲基化。幫助某些外源質(zhì)粒復(fù)制,易于得到非甲基化的質(zhì)粒。

endA

對(duì)非特異性限制酶(Non-specific Endonuclease I)進(jìn)行基因敲除(Knock-out),以減少限制酶的活性,進(jìn)而降低對(duì)外源DNA的剪切,提高外源質(zhì)粒的數(shù)量和質(zhì)量。

mcrA/mcrBC

/mrr

大腸桿菌防御系統(tǒng)中最要的組成部分,可以識(shí)別外源序列,基因突變后,宿主對(duì)部分外源質(zhì)粒的防御缺失,可以用于基因組DNA或者甲基化cDNA的克隆。

hsdR/hsdS

連個(gè)基因分別編碼型限制酶EcoKEcoB 的R亞基(限制酶)、M亞基(甲基化酶)

HsdR基因的變異導(dǎo)致菌株細(xì)胞內(nèi)的EcoKEcoB活性缺失,hsdS基因的變異使hsdRhsdM不能正確識(shí)別其作用的特異DNA序列,可以保證外源DNA的穩(wěn)定性。

 

2、提高轉(zhuǎn)化效率

基因型

意義

deoR

去除某些調(diào)控基因,使得用于脫氧核糖生成的基因得到大量表達(dá)。使得超長(zhǎng)質(zhì)粒得以完整復(fù)制,提高轉(zhuǎn)化效率。

hee

在電穿孔的過(guò)程中,改造過(guò)的細(xì)胞表現(xiàn)出更強(qiáng)的存活率。

 

3、代謝相關(guān)基因型

基因型

意義

lacZ

lacZ基因是大腸桿菌中lac操縱子的結(jié)構(gòu)基因,表達(dá)β-半乳糖苷酶,分解乳糖為半乳糖苷。lacZ基因的變異或缺失將直接導(dǎo)致β-半乳糖苷酶活性缺失,細(xì)胞在只有乳糖作為碳源的培養(yǎng)基中不能生長(zhǎng),由此可以進(jìn)行菌株的篩選和純化。

lacZM15

lacZM15是β-半乳糖苷酶α中的一段,當(dāng)M15缺失(△M15)時(shí)lacZ不能表達(dá)β-半乳糖苷酶沒(méi)有活性。當(dāng)帶有lacZα片段)基因的lac操縱子通過(guò)載體(如pUC57)轉(zhuǎn)化到 lacZM15基因型的細(xì)胞時(shí)在有IPTG存在的情況下,β-半乳糖苷酶表現(xiàn)出活性,它能分解X-gal,使其呈現(xiàn)藍(lán)色。因此可以通過(guò)平板上的藍(lán)白菌落進(jìn)行克隆體的鑒定。

gal

大腸桿菌K12株中通常出現(xiàn)的基因型是galKgalT,由于這兩種基因的變異使細(xì)胞不能直接利用半乳糖作為碳源。因此通過(guò)在最小培養(yǎng)基中添加半乳糖與否,進(jìn)行菌株篩選和基因型確認(rèn)。

ara

ara基因表達(dá)阿拉伯糖代謝所需的各種酶,ara基因的變異,使細(xì)胞不能利用阿拉伯糖進(jìn)行能量代謝,可以利用此特性進(jìn)行菌株篩選。

xyl

xyl基因包含xylA、xylB、xylR三種基因。xyl基因的變異使細(xì)胞不能以木糖作為碳源進(jìn)行能量代謝。

 

4、不同的蛋白表達(dá)機(jī)制

基因型

意義

DE3

T7 RNA聚合酶的基因被重組到大腸桿菌細(xì)胞的基因組里,用于T7 promoter調(diào)控的蛋白表達(dá)。

pLysS

攜帶T7 lysozyme(溶菌酶),用于摧毀T7 RNA polymerase。調(diào)控T7 promoter蛋白表達(dá)系統(tǒng)。

lon

lon基因表達(dá)ATP依賴(lài)型蛋白酶,它對(duì)外源蛋白質(zhì)具有特異性的分解作用。lon基因的變異或缺失,對(duì)保持重組蛋白的穩(wěn)定是非常有利的。

lacIq

變異的LacI基因,導(dǎo)致lac repressor的大量表達(dá),因此更嚴(yán)格地調(diào)控lac promoter。

ompT

ompT基因表達(dá)特異性的外膜蛋白酶,它特異性地分解與細(xì)胞膜結(jié)合的含鐵腸菌素受體蛋白。ompT基因的變異使膜結(jié)合性蛋白分解酶活性缺失,有利于融合蛋白的表達(dá)。

gor

表達(dá)谷胱甘肽還原酶,其基因突變或缺失可以提高形成二硫鍵的能力,有利于富含二硫鍵的蛋白表達(dá)。

 

以上是眾多細(xì)胞基因型中的一小部分,還有很多不常見(jiàn)的變異菌株,可適用于更加特殊的實(shí)驗(yàn)?zāi)康?,小翌就不過(guò)多介紹了。

對(duì)于感受態(tài)的選擇,小翌給大家介紹下幾種常見(jiàn)的大腸桿菌感受態(tài)及其應(yīng)用方向。

菌株

特點(diǎn)

用途

DH5α

一種常用于質(zhì)??寺〉木?。缺失核酸內(nèi)切酶 (endA),提高了質(zhì)粒DNA的產(chǎn)量和質(zhì)量;重組酶缺陷型(recA)減少插入片段的同源重組概率,保證了插入DNA 的穩(wěn)定性;lacZΔM15的存在使 DH5α可用于藍(lán)、白斑篩選。

構(gòu)建克隆,

質(zhì)粒提取,

藍(lán)白斑篩選。

TOP

TOP生長(zhǎng)速度快 (DH5α),10小時(shí)可見(jiàn)克隆,recA1endA1的突變有利于插入DNA的穩(wěn)定和高純度質(zhì)粒DNA的提取。

構(gòu)建克隆,

質(zhì)粒提取,

藍(lán)白斑篩選。

BL21DE3

用于T7 RNA 聚合酶為表達(dá)系統(tǒng)的高效蛋白表達(dá)宿主。可同時(shí)表達(dá)T7 RNA 聚合酶和大腸桿菌 RNA 聚合酶,用于 pET 系列,pGEX,pMAL 等質(zhì)粒的蛋白表達(dá)。

非毒性蛋白的表達(dá)。

 

訂購(gòu)信息

產(chǎn)品名稱(chēng)

產(chǎn)品貨號(hào)

產(chǎn)品規(guī)格

TOPChemically Competent Cell Top化學(xué)感受態(tài)細(xì)胞

11801ES80

10×100 μl

DH5α Chemically Competent Cell DH5α化學(xué)感受態(tài)細(xì)胞

11802ES80

10×100 μl

BL21 (DE3) Chemically Competent Cell  BL21 (DE3)化學(xué)感受態(tài)細(xì)胞

11804ES80

10×100 μl

 

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