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——提取效果媲美進口M*品牌
20世紀80年代中期前,微生物學家通過人工培養(yǎng)的方法研究土壤微生物生態(tài)系統(tǒng),而可培養(yǎng)的微生物不到總數(shù)的1%,相當多的微生物還未被認知。隨著宏基因組學的快速發(fā)展,通過提取土壤微生物總DNA來研究生態(tài)系統(tǒng)的方法開始出現(xiàn)。然而,土壤是一個非常復雜的異質(zhì)體系,其中,含有的腐植酸及腐植酸類似物、酚類化合物、重金屬離子等,在DNA提取過程中如不能有效去除,將直接影響后續(xù)的PCR擴增、核酸雜交、內(nèi)切酶消化等分子操作。
為了解決這一難題,翌圣研發(fā)了一款采用陶瓷珠和二氧化硅顆?;旌隙傻牟Aе檫M行樣本處理的土壤DNA提取試劑盒—MolPure® Soil DNA Kit,可有效處理真細菌孢子和內(nèi)生孢子,革蘭氏陽性細菌,酵母,藻類,線蟲和真菌等土壤中的各類微生物。該試劑盒的離心吸附柱中采用的硅基質(zhì)材料為*新型材料,配合*的裂解液配方可快速回收高純度核酸。提取的DNA純度高,質(zhì)量穩(wěn)定可靠,可適用于各種下游應(yīng)用實驗,如酶切、PCR等實驗。
◆ 操作便捷:室溫操作,僅需40min即可回收DNA。
◆ 產(chǎn)量高:*的玻璃珠能高效裂解土壤微生物,釋放更多DNA,最大限度地提取其產(chǎn)量。
◆ 適用范圍廣:適合花壇土、花盆土、農(nóng)田土、山林土、淤泥、黑土等各類型土壤。
◆ 純度高:有效去除土壤中腐殖酸、重金屬離子等雜質(zhì),并與離心柱法純化相結(jié)合,大大地提高了DNA的純度。
圖1. 土壤DNA提取操作流程圖
◆ 提取效果媲美進口M*品牌
圖2. 瓊脂糖電泳檢測大腸桿菌16s rDNA的擴增條帶。Y為翌圣品牌,M*為進口品牌,陽性對照為培養(yǎng)的大腸桿菌gDNA,Y1/Y2和M1/M2為1μL洗脫液,M3/M4為M1/M2稀釋3倍后的洗脫液。
◆ 比進口O*品牌操作簡單,節(jié)約30min
圖3. Yeasen土壤DNA提取試劑盒和O*品牌同類型產(chǎn)品操作步驟對比圖。Yeasen土壤DNA提取試劑盒比O*品牌同類型產(chǎn)品步驟省3步,并且提取速度節(jié)約30min。
◆ Q1:試劑盒是如何進行破壁的?
A:MolPure® Soil DNA Kit采用*的裂解液和珠磨法進行破壁,可有效處理真細菌孢子和內(nèi)生孢子,革蘭氏陽性細菌,酵母,藻類,線蟲和真菌等土壤中的各類微生物。
◆ Q2:如何解決DNA電泳拖尾嚴重呢?
A:1、可能原因一:土壤中含有豐富小型生物和易裂解的細菌。這些易裂解的小型生物和細菌在玻璃珠長時間渦旋中會造成DNA降解。
解決方案:可通過減少渦旋時間,或者用高能量的珠磨儀代替手工渦旋。高能量的珠磨儀能提供非常高的能量,在短時間就可以達到破壁效果,能減少DNA的降解。
2、可能原因二:樣品中存在某些化學物質(zhì),或者樣品在貯藏過程中發(fā)生降解。
解決方案:針對不同的樣品,采用合適的貯藏條件進行保存,以防止微生物DNA的降解。
◆ Q3:該方法可以獲得所有微生物的DNA嗎?
A:不一定。土壤樣品中含有大量的微生物,有細菌和真菌,以及其他植物根系,小型生物。某些真菌,特別孢子類真菌,因帶有非常厚的細胞壁,無法破壁而導致DNA的丟失。因此,可加強破壁的強度和時間來提取這些難提取的DNA。
◆ Q4:哪些因素會影響DNA的產(chǎn)量呢?
A:土壤樣品中所含的微生物的種類,微生物的數(shù)量,以及土壤樣品中的有機,無機鹽都會直接影響到DNA的產(chǎn)量。
◆ Q5:哪些事項需要注意?
A:注意事項如下:
1) 土壤DNA產(chǎn)量主要來源樣品內(nèi)微生物、植物動物殘渣,冰凍或貯存過程中DNA會發(fā)生不同程度的降解,導致DNA含量降低或條帶成較嚴重的涂抹狀(即降解)。因此,盡量使用新鮮樣品或貯存時間較短樣品進行DNA提取。
2) 如果土壤樣品中的水分含量比較多,建議先將水分離心去除后再進行提取。
3) 不要省略空柱子離心步驟,該步驟能除去柱子中殘留的乙醇,否則可能會影響下游實驗;如產(chǎn)物點電泳時無法正常沉降,絕大部分情況下由于空甩不*,乙醇殘留所致,可在下次提取中,提高離心機速度或延長空甩時間至5~10min,可解決殘留問題。
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品編碼 | 規(guī)格 | 價格(元) |
MolPure® Soil DNA Kit 土壤DNA提取試劑盒 | 18815ES50 | 50T | 1353.00 |
實驗類型 | 產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品編碼 |
PCR實驗 | Hieff Canace® Gold高保真DNA聚合酶 | 10148ES60/76 |
2×Hieff Canace® Gold高保真酶預混液 | 10149ES03/08 | |
電泳實驗 | YeaRed核酸染料(10,000× 水溶液) | 10202ES76 |
qPCR實驗 | Hieff UNICON® Universal Blue qPCR SYBR Green Master Mix | 11184ES08 |
克隆實驗 | Hieff Clone®一步法快速克隆試劑盒 | 10911ES20 |
Top⑩化學感受態(tài)細胞 | 11801ES80/92 | |
DH5α化學感受態(tài)細胞 | 11802ES80/92 |
HB210817