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——Protein A /G 瓊脂糖或磁珠
Protein A、Protein G是最常應用于抗體親和純化和免疫沉淀的蛋白。 Protein A/G瓊脂糖或磁珠將Protein A、G共價偶聯(lián)到介質(zhì)表面,具有結合能力更強、結合范圍更廣、實用性更高的特點。
Protein A/G 4FF Agarose | Protein A/G MagBeads | |
基質(zhì) | 高度交聯(lián)4%瓊脂糖微球 | 聚合物磁性微球 |
填料粒徑 | 45-165 µm | 1 µm |
載量 | >20 mg 人IgG/mL | >50 µg 人IgG/mg |
優(yōu)勢 | 簡單易用,無需輔助設備 | 操作簡單 |
孔徑大,結合力強 | 直徑小,動力學好 | |
靶蛋白獲取量高 | 表面光滑,beads吸附很少,背景低,抗體消耗少 | |
缺點 | 多孔易吸附(需要做pre-clear) | 配套磁力架使用方便 |
1、純化抗體:一步純化即可從血清或腹水樣品中分離出高純度的抗體。
2、免疫沉淀(immunoprecipitation,IP):通過對某蛋白質(zhì)的富集,研究該蛋白的特性(如翻譯后修飾等)。
3、免疫共沉淀Co-IP(co-Immunoprecipitation):通過對某蛋白質(zhì)的富集,研究與其結合的其他蛋白(即蛋白-蛋白相互作用、蛋白復合物等)。
1、Protein A/G 4FF Agarose純化兔血清中的抗體。
圖1 Protein A/G 4FF Agarose純化抗體結果電泳圖
2、整個實驗設計中,為了進一步闡明Atuveciclib在IL-1b誘導的基質(zhì)降解中的作用。研究人員在IL-1b刺激30 min前,先利用Atuveciclib預處理人和大鼠NP細胞2h,然后使用針對p65和細胞周期蛋白依賴性激酶9(CDK9)的特異性抗體對提取的總細胞蛋白進行免疫沉淀分析。結果發(fā)現(xiàn), IL-1b刺激增強了p65和CDK9之間的相互作用,而Atuveciclib減弱了這種作用。
Fig 2. Immunoprecipitants were then subjected to western blot analysis using specific antibodies against CDK9 and p65.
1、Co-IP背景較深或者條帶雜亂
● 固相基質(zhì)的非特異性結合
● 抗體結合非特異的蛋白
● 洗滌不當造成雜帶
● 建議方案:pre clear或者更換磁珠;設置對照排除非特異性條帶;優(yōu)化緩沖液
2、Input條帶清晰,co-IP條帶很弱?
設X為誘餌蛋白,Y為靶蛋白,有可能為
● X和Y的相互作用本身比較弱
● X蛋白并不是Y的,只部分Y與X互作
● 可以嘗試反向拉,比如用Y去拉X,可能效果比較好
3、我的蛋白正好和抗體重鏈分子量接近,要如何減少抗體干擾?
● IP/WB一抗使用不同種屬來源,選擇與IP抗體種屬無交叉反應的二抗(Cross Adsorbed secondary antibody)
● 特殊二抗:比如僅識別重鏈或者輕鏈的二抗,或者僅識別天然抗體的二抗
● 直接源頭遏制:將抗體直接交聯(lián)到bead上,或者將抗體交聯(lián)到protein A/G上,避免洗脫干擾
4、靶蛋白沒有條帶
● 裂解液不合適,或者沒有添加抑制劑,導致靶蛋白或者餌蛋白構象改變不能結合或者降解
● 餌蛋白較難洗脫,換成高強度的洗脫緩沖液
● 選用的抗體不合適,建議IP驗證過的抗體,并優(yōu)化下抗體用量
● 蛋白間為弱相互作用,或者相互作用依賴翻譯后修飾
5、瓊脂糖難離心,每次總會吸上來一點兒
● 使用帶濾膜的離心柱,下部有接樣管,瓊脂糖*截留在濾膜上
● 換成磁珠
6、我的目的蛋白因為沒有對應的特異性抗體而無法進行免疫沉淀
● 若此蛋白帶標簽,可選擇針對此蛋白的標簽抗體來進行免疫沉淀。
產(chǎn)品名稱 | 貨號 | 規(guī)格(mL) | 價格(元) |
蛋白A/G瓊脂糖純化樹脂 | 36403ES03/05/08/25/60 | 1/2/5/25/100 | 278/538/878/2886/7426 |
蛋白A/G瓊脂糖快速純化樹脂 | 36404ES08/25/60 | 5 /25 /100 | 978/3186/8726 |
蛋白A/G免疫沉淀磁珠 | 36417ES03/08 | 1/5 | 787/2937 |
產(chǎn)品名稱 | 貨號 | 規(guī)格(mL) | 價格(元) |
蛋白A瓊脂糖純化樹脂 | 36401ES08/25/60 | 5 /25 /100 | 546/2186/7426 |
蛋白A瓊脂糖快速純化樹脂 | 36402ES08/25/60 | 5 /25 /100 | 866/2656/8856 |
蛋白A/G瓊脂糖純化樹脂 | 36403ES03/05/08/25/60 | 1/2/5/25/100 | 278/538/878/2886/7426 |
蛋白A/G瓊脂糖快速純化樹脂 | 36404ES08/25/60 | 5 /25 /100 | 978/3186/8726 |
蛋白G瓊脂糖純化樹脂 | 36405ES08/25/60 | 5 /25 /100 | 546/2186/7426 |
蛋白G瓊脂糖快速純化樹脂 | 36406ES08/25/60 | 5 /25 /100 | 978/3186/8726 |
蛋白L瓊脂糖純化樹脂 | 36407ES08/25/60 | 5 /25 /100 | 2488/9988/16488 |
蛋白L瓊脂糖快速純化樹脂 | 36408ES08/25/60 | 5 /25 /100 | 2868/13288/27688 |
蛋白A純化預裝柱,1mL | 36409ES03/08 | 1 mL/5×1 mL | 528/2218 |
蛋白A純化預裝柱,5mL | 36410ES08/25 | 5 mL/5×5 mL | 1848/6838 |
蛋白G純化預裝柱,1mL | 36413ES03/08 | 1 mL/5×1 mL | 528/2218 |
蛋白G純化預裝柱,5mL | 36414ES08/25 | 5 mL/5×5 mL | 1848/6838 |
蛋白L純化預裝柱,1mL | 36415ES03/08 | 1 mL/5×1 mL | 938/3748 |
蛋白L純化預裝柱,5mL | 36416ES08/25 | 5 mL/5×5 mL | 3528/14088 |
文獻引用
[1] Wang X , Yu C , Wang C , et al. Novel cyclin-dependent kinase 9 (CDK9) inhibitor with suppression of cancer stemness activity against non-small-cell lung cancer[J]. European Journal of Medicinal Chemistry, 2019, 181. IF: 5.201
[2] Zheng L, Xiang C, Li X, et al. STARD13-correlated ceRNA network-directed inhibition on YAP/TAZ activity suppresses stemness of breast cancer via co-regulating Hippo and Rho-GTPase/F-actin signaling[J]. Journal of hematology & oncology, 2018, 11(1): 72. IF:7.33
[3] Jiang S, Liu Y, Shen Z, et al. Acetylome profiling reveals extensive involvement of lysine acetylation in the conversion of muscle to meat[J]. Journal of proteomics, 2019, 205: 103412. IF:3.537
[4] Gao L, Guo Q, Li X, et al. MiR-873/PD-L1 axis regulates the stemness of breast cancer cells[J]. EBioMedicine, 2019, 41: 395-407. IF:6.68
[5] Xie Y, Peng J, Pang J, et al. Biglycan Regulates Neuroinflammation by Promoting M1 Microglial Activation in Early Brain Injury after Experimental Subarachnoid Hemorrhage[J]. Journal of neurochemistry, 2019. IF:4.26
[6] Zhao Q, Liu Y, Wang T, et al. MiR-375 inhibits the stemness of breast cancer cells by blocking the JAK2/STAT3 signaling [published online ahead of print, 2020 Jul 30]. Eur J Pharmacol. 2020;884:173359. IF: 3.263
經(jīng)典文章分享:抗體親和純化系列——抗體純化,若有選擇,必是