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精品│翌圣ZymeEditor打造超高文庫轉(zhuǎn)化率T4 DNA Ligase

2023-6-20  閱讀(167)

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建庫作為NGS測序的核心步驟,直接影響測序質(zhì)量,文庫轉(zhuǎn)化率是評估文庫質(zhì)量的重要指標,高的文庫轉(zhuǎn)化率一定程度上意味著文庫豐富度、測序數(shù)據(jù)均一性更好。常規(guī)T4 DNA Ligase催化DNA的 3’-OH 和接頭的5’-磷酸基團之間形成磷酸二酯鍵完成接頭連接,但此過程中會出現(xiàn)片段自連,從而減低文庫轉(zhuǎn)化率,影響文庫豐富度與測序質(zhì)量。翌圣ZymeEditor™酶改造平臺對T4 DNA Ligase進行定向改造獲得Hieff® 5' App T4 DNA Ligase(Cat#14960ES),該突變體只能以預(yù)苷化接頭為底物進行接頭連接,顯著減少片段自連,提高文庫轉(zhuǎn)化率。


 

1. NGS常規(guī)建庫流程

 

 

 

產(chǎn)品特點

 

1、極低片段自連只能以預(yù)腺苷化的接頭為底物,極大降低片段自連。

2、超高接頭連接效率連接效率達95%以上。

3、嚴格質(zhì)控無切口酶、外切酶及RNase殘留。

 

 

 

數(shù)據(jù)展示

 
 
 
 
1、連接效率達95%以上
以100ng 170bp和300bp的模式片段為底物,使用Hieff® 5' App T4 DNA ligase對合成的預(yù)腺苷化(App)接頭進行接頭連接,結(jié)果顯示連接效率達95%以上,且片段自連占比極低。

圖2. 以170 bp模式片段為底物連接效率檢測

 

3. 以300 bp模式片段為底物連接效率檢測

 

 
 
 
2、無RNase 殘留
將2000 U Hieff® 5' App T4 DNA ligase與底物RNA孵育,瓊脂糖凝膠電泳比較RNA譜帶變化。結(jié)果顯示翌圣Hieff® 5' App T4 DNA ligase無RNase殘留。

 

4. RNase殘留檢測 C:陰性對照

 

 
 
 

3、無切口酶及外切酶殘留

將200 U Hieff® 5' App T4 DNA ligase與底物DNA孵育,瓊脂糖凝膠電泳比較DNA譜帶變化。結(jié)果顯示翌圣Hieff® 5' App T4 DNA ligase無切口酶殘留。

5. 切口酶殘留檢測 C:陰性對照

 

將2000 U Hieff® 5' App T4 DNA ligase與底物DNA孵育,瓊脂糖凝膠電泳比較DNA譜帶變化。結(jié)果顯示翌圣Hieff® 5' App T4 DNA ligase無外切酶殘留。

 

6. 外切酶殘留檢測 C:陰性對照

 

 

 

相關(guān)產(chǎn)品推薦

 

產(chǎn)品定位

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品貨號

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UCF.ME® T4 DNA Polymerase (3 U/μL)

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Hieff® 5' App T4 DNA ligase

14960ES

文庫擴增

Hieff Canace® Pro High-Fidelity DNA Polymerase(1 U/μL)

14382ES

 

 

 

翌圣ZymeEditor™酶改造定制服務(wù)

 
 

翌圣ZymeEditor™是一個酶改造底層技術(shù)平臺,它基于翌圣生物多年在分子酶改造領(lǐng)域中的技術(shù)積累與知識拓展,該平臺已具備對多種酶的多種需求進行定向改造的能力。因此,ZymeEditor™平臺從2023年開始正式推出酶改造對外定制服務(wù),可為各種應(yīng)用領(lǐng)域(如醫(yī)藥、診斷、食品、化工等)的客戶提供全套酶改造服務(wù),也可以單獨提供蛋白發(fā)酵及純化工藝開發(fā)優(yōu)化、規(guī)?;a(chǎn)服務(wù),以滿足不同客戶的需求,助力產(chǎn)業(yè)升級。

 

 
 
 
定制服務(wù)流程

圖7.ZymeEditor™酶改造定制服務(wù)流程

 

 



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