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近日,上海市為促進創(chuàng)新產品的市場化、產業(yè)化,強化產業(yè)功能,推動研發(fā)活動產業(yè)化,全力打響“上海制造"品牌,支撐上海產業(yè)高質量發(fā)展,發(fā)起了2023年度《上海市創(chuàng)新產品推薦目錄》編制申報工作,翌圣生物CUT&Tag試劑盒有幸入選。
圖:《2023年度上海市創(chuàng)新產品推薦目錄》公示截圖
圖:CUT&Tag實驗流程圖
在CUT&Tag試劑盒轉化過程中,翌圣生物開創(chuàng)性的在試劑盒中引入spike in,該技術已申請相關。
圖:翌圣生物CUT&Tag技術申請
在CUT&Tag技術上,翌圣不斷突破創(chuàng)新,2023年4月,翌圣推出Multi-CUT&Tag試劑盒,實現一份細胞,兩個靶標的研究。在節(jié)省樣本的同時,也節(jié)省時間和試劑。
圖:Multi-CUT&Tag實驗流程
大豆與根瘤菌共生形成高效共生固氮體——根瘤,為大豆生長發(fā)育及籽粒蛋白含量提供約65%得氮素來源,但是根瘤衰老會影響固氮終止從而影響大豆的生長發(fā)育,目前,根瘤衰老機制尚未被解析。作者利用CUT&Tag技術結合RNA-seq解析了根瘤衰老調控機制,建立了NAC-CYP分子模塊調控大豆根瘤衰老的模型也為大豆氮素高效吸收提供關鍵理論依據。
圖:CUT&Tag-qPCR驗證大豆根瘤中,NAC039直接靶向半胱氨酸蛋白酶(CYP)基因
(XX. Yu et al. Plant Cell. 2023)
環(huán)狀RNA(circRNA)是RNA大分子的一個亞類,據報道參與骨骼肌發(fā)育的調節(jié)。然而,circRNA在雞肌肉發(fā)生中的功能和調節(jié)機制仍不清楚。作者鑒定了一種新的circRNA靶標分子circGPD2,并通過各種濕實驗和CUT&Tag實驗驗證circGPD2對成肌細胞的增殖和分化具有積極作用:circGPD2通過解除miR-203a對c-JUN和MEF2C抑制作用來發(fā)揮功能,此外,生肌調節(jié)因子MyoG通過靶向GPD2啟動子上的E-box元件增強circGPD2的表達。
圖:CUT&Tag-qPCR結果表明在雞成肌細胞中,MyoG可以與P4啟動子區(qū)域的E-box 1結合
(X. Shen et al. Int J Biol Macromol.2022)
CUT&Tag技術在小鼠胚胎干細胞中的應用
通過DNA-蛋白互作、RNA-DNA互作、RNA-蛋白質互作等技術,探索發(fā)育信號傳導中的調控機制:Nodal 誘導的 lncRNA-Smad7 通過抑制小鼠胚胎干細胞 (mESC) 中的 BMP 信號傳導來調節(jié)細胞命運決定,lncRNA-Smad7 拮抗 mESC 中的 BMP 信號傳導,并類似地調節(jié) C2C12 小鼠成肌細胞中骨細胞和肌細胞形成之間的細胞命運決定。此外,lncRNA-Smad7 與 mESC 中的 hnRNPK 結合,并且 hnRNPK 與 Bmp2 啟動子結合,可能有助于 Bmp2 表達抑制。
圖:CUT&Tag結果顯示LncRNA-Smad7 KD導致Bmp2啟動子區(qū)域的H3K27me3修飾減少,而LncRNA-Smad7與hnRNPK相互作用。
(XH. Kong et al. Nucleic Acids Res. 2022)
CUT&Tag技術在癌癥免疫調控中的應用
圖:FBXO42敲除后的細胞中的染色質免疫調控圖譜
(H. Jiang et al. Sci Adv. 2022)
CUT&Tag技術在生殖細胞中的應用
圖:CUT&Tag技術表明znhit1依賴的H2A.Z摻入與轉錄激活因子Stra8共定位
(Sun et al. Developmental Cell. 2022)
產品名稱 | 貨號 | 規(guī)格 |
Hieff NGS® G-Type In-Situ DNA Binding Profiling Library Prep Kit for Illumina®CUT&Tag建庫試劑盒 | 12598ES12/48 | 12 T/ 48 T |
Hieff NGS® Multi-CUT&Tag Library Prep Kit for Illumina®多靶標CUT&Tag試劑盒 | 12592ES24/96 | 12 T/ 48 T |
1、Plant Cell | CUT&Tag聯合RNA-seq測序,解析大豆根瘤衰老的調控機制
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