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翌圣ZymeEditor™轉(zhuǎn)座酶系列產(chǎn)品全面助力NGS文庫構(gòu)建

2023-7-20  閱讀(232)

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TA克隆建庫技術(shù)是目前商業(yè)化建庫的主流方式,通常需要片段化、末修加A、接頭連接、PCR擴(kuò)增等實(shí)驗(yàn)流程,操作復(fù)雜,且建庫周期長(zhǎng)。與TA克隆建庫技術(shù)相比,轉(zhuǎn)座酶法建庫在DNA片段化的同時(shí)給DNA片段加上測(cè)序接頭,可替代TA克隆中的片段化、末修加A、接頭連接步驟,在后續(xù)建庫擴(kuò)增過程中,一步法PCR建庫就能獲得完整的用于測(cè)序的文庫,具有操作簡(jiǎn)便、極大縮短建庫時(shí)長(zhǎng)等優(yōu)點(diǎn)。


 

 

圖1. 基于Tn5酶的建庫流程

 

Tn5酶作為轉(zhuǎn)座酶法建庫的核心酶原料,在NGS領(lǐng)域應(yīng)用十分廣泛,除了應(yīng)用于DNA建庫外,還可應(yīng)用于快速RNA建庫、ATAC、CUT&Tag、單細(xì)胞測(cè)序等技術(shù)。(點(diǎn)擊查看詳情)

 

翌圣ZymeEditor™酶改造平臺(tái)精心打造轉(zhuǎn)座酶系列產(chǎn)品:Tn5 TransposaseCat#14524ES)、pA-Tn5 TransposaseCat#14528ES)、pG-Tn5 TransposaseCat#14530ES)以滿足不同應(yīng)用需求。

 

 

部分?jǐn)?shù)據(jù)展示

 

1、5 U投入量無核酸外切酶殘留

將1 U/5 U的pG-Tn5 Transposase分別與底物DNA在37°C下孵育4 h,瓊脂糖凝膠電泳比較DNA譜帶變化。結(jié)果顯示翌圣pG-Tn5 Transposase在5 U投入量下無核酸外切酶殘留。

圖2.pG-Tn5 Transposase核酸外切酶殘留檢測(cè)

 

2、相同酶投入量下,片段化能力優(yōu)于其它品牌

分別使用翌圣及品牌A相同酶量的pG-Tn5 Transposase對(duì)200 ng gDNA進(jìn)行片段化,Agilent 2100檢測(cè)片段大小分布,結(jié)果顯示:相同酶量下,翌圣pG-Tn5 Transposase片段化效果更好,酶活性更高。

圖3. pG-Tn5 Transposase片段化能力檢測(cè)

 

3、應(yīng)用于CUT&Tag建庫產(chǎn)量更高

分別使用翌圣及品牌A相同酶量的pG-Tn5 Transposase對(duì)1000個(gè)細(xì)胞投入量樣本建庫,并對(duì)文庫測(cè)序后的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,結(jié)果顯示翌圣pG-Tn5 Transposase文庫產(chǎn)量高于品牌A(圖4A),Mapping率相當(dāng)(圖4B); 染色質(zhì)上的信號(hào)分布情況與品牌A一致(圖5)。

圖4. pG-Tn5 Transposase應(yīng)用于CUT&Tag的文庫產(chǎn)量及Mapping率

 

圖5. pG-Tn5 Transposase應(yīng)用于CUT&Tag在染色質(zhì)上的信號(hào)分布

 

 

產(chǎn)品推薦

 

應(yīng)用

定位

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品貨號(hào)

轉(zhuǎn)座酶建庫ATAC建庫

 

Tn5單酶

Tn5 Transposase

14524ES

建庫試劑盒

Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina®(for 50 ng)

12207ES

CUT&Tag建庫

 

 

pA-Tn5單酶

pA-Tn5 Transposase

14528ES

pG-Tn5單酶

pG-Tn5 Transposase

14530ES

建庫試劑盒

Hieff NGS® G-Type In-Situ DNA Binding Profiling Library Prep Kit for Illumina

12598ES

 

 

 

翌圣ZymeEditor™

酶改造定制服務(wù)

 
 

翌圣ZymeEditor™是一個(gè)酶改造底層技術(shù)平臺(tái),它基于翌圣生物多年在分子酶改造領(lǐng)域中的技術(shù)積累與知識(shí)拓展,該平臺(tái)已具備對(duì)多種酶的多種需求進(jìn)行定向改造的能力。因此,ZymeEditor™平臺(tái)從2023年開始正式推出酶改造對(duì)外定制服務(wù),可為各種應(yīng)用領(lǐng)域(如醫(yī)藥、診斷、食品、化工等)的客戶提供全套酶改造服務(wù),也可以單獨(dú)提供蛋白發(fā)酵及純化工藝開發(fā)優(yōu)化、規(guī)?;a(chǎn)服務(wù),以滿足不同客戶的需求,助力產(chǎn)業(yè)升級(jí)。

 

 
 
 
定制服務(wù)流程



圖6.ZymeEditor™酶改造定制服務(wù)流程



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