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上新 | 雙鏈甲基化建庫(kù)重磅上市,助力表觀遺傳學(xué)研究

2023-9-26  閱讀(115)

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上新 | 雙鏈甲基化建庫(kù)重磅上市,助力表觀遺傳學(xué)研究


01
表觀遺傳
1942 年,Conrad Waddington 創(chuàng)造出了“表觀遺傳學(xué)"一詞,用以定義基因型未發(fā)生改變而表型改變的現(xiàn)象,以解釋發(fā)育的各個(gè)方面。大約 3/4 個(gè)世紀(jì)以后,我們發(fā)現(xiàn)基因表達(dá)模式傳遞的表觀遺傳機(jī)制并不依賴于 DNA 序列的改變,而是通過(guò)改變?nèi)旧|(zhì)的狀態(tài),而染色質(zhì)狀態(tài)同時(shí)是我們遺傳信息的生理學(xué)形式。表觀遺傳的調(diào)控機(jī)制包括多種方式,圖1主要介紹其中的3種:DNA甲基化、組蛋白修飾(圖1中顯示乙?;图谆揎棧┖头蔷幋aRNA導(dǎo)的調(diào)控。

 

 

02
表觀遺傳與人類疾病
DNA甲基化、組蛋白修飾、非編碼RNA等表觀遺傳因素,與腫瘤發(fā)生、免疫缺陷病、神經(jīng)系統(tǒng)疾病、心血管疾病和精神疾病等多種疾病相關(guān)。DNA甲基化就像一頂“神奇的帽子",在不改變DNA分子一級(jí)結(jié)構(gòu)的情況下調(diào)節(jié)基因組的功能,在調(diào)控基因表達(dá)、維持染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、基因印記、X染色體失活以及胚胎發(fā)育等生物學(xué)過(guò)程中發(fā)揮著重大的作用。
 
01
腫瘤

正常的DNA甲基化模式如果被破壞(如基因啟動(dòng)子區(qū)域的甲基化程度過(guò)高或過(guò)低)都會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞的癌變。

 
02
免疫缺陷疾病

ICF綜合征,是由DNA甲基轉(zhuǎn)移酶3b(DNMT3b)基因突變而引起的?;颊?號(hào)、9號(hào)和16號(hào)染色體異常,在其著絲粒附近具有大量重復(fù)的典型衛(wèi)星DNA序列,這些重復(fù)序列表現(xiàn)為低甲基化。

 
03精神類疾病

瑞特綜合征是由于X染色體上編碼MeCP2轉(zhuǎn)錄因子的基因突變導(dǎo)致的。MeCP2突變導(dǎo)致該基因調(diào)節(jié)DNA甲基化的過(guò)程異常,從而致病。

 

DNA甲基化研究離不開(kāi)甲基化轉(zhuǎn)化和甲基化建庫(kù)

甲基化建庫(kù)的方式有哪些呢?

 

 

翌圣生物最新推出先建庫(kù)后轉(zhuǎn)化的甲基化研究方案,與您一起探索DNA甲基化的奧秘!

 

03
產(chǎn)品簡(jiǎn)介

Hieff NGS® dsDNA Methyl Library Prep Kit for Illumina®是針對(duì)Illumina®高通量測(cè)序平臺(tái)開(kāi)發(fā)的雙鏈DNA甲基化建庫(kù)試劑盒。本試劑盒通過(guò)連接相應(yīng)的甲基化接頭,經(jīng)亞硫酸氫鹽或酶法轉(zhuǎn)化處理,再經(jīng)過(guò)一步擴(kuò)增即可構(gòu)建針對(duì)Illumina®平臺(tái)測(cè)序的甲基化文庫(kù)。

04
產(chǎn)品亮點(diǎn)

 

  • 所有組分均通過(guò)質(zhì)量控制和功能驗(yàn)證,以確保文庫(kù)的穩(wěn)定產(chǎn)出;
  • 支持多種類型DNA樣本,包括gDNA、cfDNA和FFPE等;
  • 兼容10 ng-1000 ng DNA的樣本投入量,并兼容市面主流的轉(zhuǎn)化方案

 

05
建庫(kù)原理

圖2.雙鏈甲基化建庫(kù)原理

 

06
產(chǎn)品性能
01
文庫(kù)產(chǎn)量及下機(jī)數(shù)據(jù)對(duì)比測(cè)試
 
 

選擇不同的樣本進(jìn)行機(jī)械法片段化(除cfDNA),包括10ng 、100ng、1μg的293T gDNA,50ng FFPE DNA,100ng 水稻 DNA和10ng cfDNA,樣本中摻入1% λDNA,采用Hieff® Mag DNA Methylation Bisulfite Kit(12223ES)進(jìn)行文庫(kù)轉(zhuǎn)化和Hieff NGS® dsDNA Methyl Library Prep Kit for Illumina(12214ES)進(jìn)行雙鏈甲基化建庫(kù),性能評(píng)估結(jié)果如下:

 

12214文庫(kù)產(chǎn)量、Mapping(%)、Clean/Raw(%)、Dup%優(yōu)于競(jìng)品1!

 

圖3.不同樣本不同投入量的文庫(kù)濃度

 

圖4.不同樣本不同投入量的Clean/Raw(%)

 

圖5.不同樣本不同投入量的Map Ratio(%)

 

圖6.不同樣本不同投入量的Dup(%)

 

甲基化雙鏈建庫(kù),λ DNA的轉(zhuǎn)化率>99.8%!

 

圖7.雙鏈甲基化建庫(kù)對(duì)樣本轉(zhuǎn)化率的評(píng)估

 

07
Hot 訂購(gòu)信息

 

 

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品貨號(hào)

產(chǎn)品規(guī)格

Hieff NGS® dsDNA Methyl Library Prep Kit for Illumina®雙鏈DNA甲基化建庫(kù)試劑盒

12214ES08

8T 

12214ES24

24T

12214ES96

96T

08
相關(guān)產(chǎn)品

 

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品貨號(hào)

產(chǎn)品應(yīng)用

Hieff® DNA Bisulfite  Conversion Kit

12222ES

 

柱式-亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化

Hieff® Mag DNA Methylation Bisulfite Kit

12223ES

磁珠法-亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化

Hieff® DNA Trans-Enzymatic methyl- Conversion Kit

12213ES

反向-酶法轉(zhuǎn)化

Hieff® DNA Pos-Enzymatic methyl- Conversion Kit

12212ES

正向-酶法轉(zhuǎn)化

Hieff NGS® Methyl-seq DNA library Prep kit for Illumina® V2

12221ES

甲基化建庫(kù)

Hieff Canace® Uracil+ High-Fidelity DNA polymerase

10145ES

甲基化轉(zhuǎn)化后PCR擴(kuò)增



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