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上新 | 雙鏈甲基化建庫(kù)重磅上市,助力表觀遺傳學(xué)研究
正常的DNA甲基化模式如果被破壞(如基因啟動(dòng)子區(qū)域的甲基化程度過(guò)高或過(guò)低)都會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞的癌變。
ICF綜合征,是由DNA甲基轉(zhuǎn)移酶3b(DNMT3b)基因突變而引起的?;颊?號(hào)、9號(hào)和16號(hào)染色體異常,在其著絲粒附近具有大量重復(fù)的典型衛(wèi)星DNA序列,這些重復(fù)序列表現(xiàn)為低甲基化。
瑞特綜合征是由于X染色體上編碼MeCP2轉(zhuǎn)錄因子的基因突變導(dǎo)致的。MeCP2突變導(dǎo)致該基因調(diào)節(jié)DNA甲基化的過(guò)程異常,從而致病。
甲基化建庫(kù)的方式有哪些呢?
翌圣生物最新推出先建庫(kù)后轉(zhuǎn)化的甲基化研究方案,與您一起探索DNA甲基化的奧秘!
Hieff NGS® dsDNA Methyl Library Prep Kit for Illumina®是針對(duì)Illumina®高通量測(cè)序平臺(tái)開(kāi)發(fā)的雙鏈DNA甲基化建庫(kù)試劑盒。本試劑盒通過(guò)連接相應(yīng)的甲基化接頭,經(jīng)亞硫酸氫鹽或酶法轉(zhuǎn)化處理,再經(jīng)過(guò)一步擴(kuò)增即可構(gòu)建針對(duì)Illumina®平臺(tái)測(cè)序的甲基化文庫(kù)。
所有組分均通過(guò)質(zhì)量控制和功能驗(yàn)證,以確保文庫(kù)的穩(wěn)定產(chǎn)出; 支持多種類型DNA樣本,包括gDNA、cfDNA和FFPE等; 兼容10 ng-1000 ng DNA的樣本投入量,并兼容市面主流的轉(zhuǎn)化方案
圖2.雙鏈甲基化建庫(kù)原理
選擇不同的樣本進(jìn)行機(jī)械法片段化(除cfDNA),包括10ng 、100ng、1μg的293T gDNA,50ng FFPE DNA,100ng 水稻 DNA和10ng cfDNA,樣本中摻入1% λDNA,采用Hieff® Mag DNA Methylation Bisulfite Kit(12223ES)進(jìn)行文庫(kù)轉(zhuǎn)化和Hieff NGS® dsDNA Methyl Library Prep Kit for Illumina(12214ES)進(jìn)行雙鏈甲基化建庫(kù),性能評(píng)估結(jié)果如下:
12214文庫(kù)產(chǎn)量、Mapping(%)、Clean/Raw(%)、Dup%優(yōu)于競(jìng)品1!
圖3.不同樣本不同投入量的文庫(kù)濃度
圖4.不同樣本不同投入量的Clean/Raw(%)
圖5.不同樣本不同投入量的Map Ratio(%)
圖6.不同樣本不同投入量的Dup(%)
甲基化雙鏈建庫(kù),λ DNA的轉(zhuǎn)化率>99.8%!
圖7.雙鏈甲基化建庫(kù)對(duì)樣本轉(zhuǎn)化率的評(píng)估
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品貨號(hào) | 產(chǎn)品規(guī)格 |
Hieff NGS® dsDNA Methyl Library Prep Kit for Illumina®雙鏈DNA甲基化建庫(kù)試劑盒 | 12214ES08 | 8T |
12214ES24 | 24T | |
12214ES96 | 96T |
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品貨號(hào) | 產(chǎn)品應(yīng)用 |
Hieff® DNA Bisulfite Conversion Kit | 12222ES
| 柱式-亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化 |
Hieff® Mag DNA Methylation Bisulfite Kit | 12223ES | 磁珠法-亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化 |
Hieff® DNA Trans-Enzymatic methyl- Conversion Kit | 12213ES | 反向-酶法轉(zhuǎn)化 |
Hieff® DNA Pos-Enzymatic methyl- Conversion Kit | 12212ES | 正向-酶法轉(zhuǎn)化 |
Hieff NGS® Methyl-seq DNA library Prep kit for Illumina® V2 | 12221ES | 甲基化建庫(kù) |
Hieff Canace® Uracil+ High-Fidelity DNA polymerase | 10145ES | 甲基化轉(zhuǎn)化后PCR擴(kuò)增 |